Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vra8g2581 ATGATGGATTCCCCCTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCTGACTTTGTTTCCATAGCCACCGCCAATCAGAGTGCGGCCAGGAGCAGTGGAGAAGGGGTGGCTACGGAGCAGTCGCGGCGGTGGCACGACGTGTTCTGGTTAGGAATATTCTTAATCCATTTGATTGGGCTTGGGTTCCTTCTGGGGGTTCTTGGTCTAAACAGGTTTGAGAGAGAGAATAGACTTAACATTGACAAGTTTACCTCCCGGTTTTCTGAGAACCAATCCGGGTTGACTGAGACTTACTGGCCCCTTTATGCTGCTGCTGGTGGGGTTGGGACTGTTCTTGGATGGGGTTGGTTGTTGTTGTTGGGCTCCCAGGCAACTCAAATGATGAAGGTGTCTGTTCACATACTTACCACTTACCTTGCTGTGGTCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGGCCAGATTTTCTGGGGGGTTGCTTTTGCCATTGGAGCTCTTCTGCAGTTCCTTTATGTCATATCAGTCATAGACAGACTCCCATTTACGATGTTGATTCTGCAAAAGGCTGTGAAGATGATTTGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCGTATGCTTTTATGTTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCAGCAGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTCTCTCTGTGAGCTTGTTTTGGACAGGTGCAGTACTATGTAATACTGTGCATGTTATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGTTCTTTTTCATGGTGGTAGAGATGCAGCTTCAATTCCAGCTAACTCCTTAGTGAAATCTCTACAGTATGCTTTAACAACATCGTTTGGCAGCATTTGCTATGGTTCATTATTTACTGCAGCAATTAGGACACTACGATGGAAGATACGGGGATTTCGGTCTAAGATTGGCAATAATGAGTGTTTACTTTGTCTTGTCGATTTCCTTTTCCATCTCGTGGAGACTCTTGTTCGTTTCTTTAACAAGTATGCCTATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGGTCGGCTAGAGATGCATGGGAGTTACTCCAGTCGACTGGGGTTGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGTTCTGGTGCTGTGCTTCTAATGGGTACAATTTTTGGTGGACTGATAACAGGAACTTGCTCTGGTATTTGGGCATGGGTTAAATGGAGTGACAGAATTATTATGATCGGATCCACGTCCATGCTGATGGGGATGGTATTGGTTGGATTGGCAATGGTCTTGGTGGAAAGTGCCGTTACATCCATATATATATGCTATGCAGAGGACCCCTCATTGATTCAAAGATGGGATGCTGAATTTTTCAACCAAATGTCTGAGACACTTCATCAGCGACTTCAATATAGAAGTGCTCGAGCAAGGGAAGTTTTAACACACAATCGATTCGATGACCTTGTACCCGAAAATGCACGTATCTGA 1491 0.4534 MMDSPSSSSSSSSDFVSIATANQSAARSSGEGVATEQSRRWHDVFWLGIFLIHLIGLGFLLGVLGLNRFERENRLNIDKFTSRFSENQSGLTETYWPLYAAAGGVGTVLGWGWLLLLGSQATQMMKVSVHILTTYLAVVSVLCFWAGQIFWGVAFAIGALLQFLYVISVIDRLPFTMLILQKAVKMIWNLPEVMRVAYAFMFVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLFHGGRDAASIPANSLVKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWKIRGFRSKIGNNECLLCLVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELLQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGIWAWVKWSDRIIMIGSTSMLMGMVLVGLAMVLVESAVTSIYICYAEDPSLIQRWDAEFFNQMSETLHQRLQYRSARAREVLTHNRFDDLVPENARI* 497
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vra8g2581 496 Pfam Plasma-membrane choline transporter 154 448 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Vra8g2581 496 PANTHER PLASMA-MEMBRANE CHOLINE TRANSPORTER FAMILY PROTEIN 17 489 - -
Vra8g2581 496 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 17 489 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vra8g2581 Vra-Chr8 43744402 43748776 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vra8g2581 8 43744402 43748776 Vra8g2581 8 43744402 43748776 ECH