Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun7g03869 ATGATGGATTCCCCGTCTTCCTCTTCATCCTCCTCCGAGTTCGTTTCCATAGCCACCGCCAATCAGAGTGCGGCCAGGAGCAGTGGAGAAGGGGTGGCTACGGAGCAGTCGCGGCGGTGGCACGACGTGTTCTGGTTAGGAATATTCTTAATCCATTTGATTGGGCTTGGGTTCCTTCTGGGGGTTCTTGGTCTAAATAGGTTCGAGAGAGAGAATAGACTTAACATTGACAAGTTTACCTCCCGGTTTTCTGAGAACCAATCCGGGTTGACTGAGACTTACTGGCCCCTTTATGCTGCTGCTGGTGGGGTTGGGACTGTTCTTGGATGGGGTTGGTTGTTGTTGTTGGGCTCCCAGGCAACTCAAATGATGAAGGTGTCTGTTCACATACTCACCACTTACCTTGCTGTGGTCAGTGTTTTGTGTTTCTGGACTGGCCAGATTTTCTGGGGGGTTGCTTTTGCCATTGGAGCTCTTCTGCAGTTCCTTTATGTCATATCAGTCATAGACAGACTCCCATTTACGATGTTGATTCTGCAGAAGGCTGTGAAGATGATTTGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATATGTTTTTATGTTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCAGCAGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTCTCTCTGTGAGCTTGTTTTGGACAGGTGCAGTACTATGTAATACCGTGCATGTTATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGTTCTTTTTCATGGTGGTAGAGATGCAGCTTCAATTCCAGCTAACTCCTTAGTGAAATCTCTACAGTATGCTTTAACCACATCGTTTGGCAGCATTTGCTATGGTTCATTATTTACTGCAGCAATTAGGACACTACGATGGAAGATACGGGGATTTCGGTCTAAGATTGGCAATAACGAGTGTTTACTTTGCCTTGTCGATTTCCTTTTCCATCTCGTGGAGACTCTTGTGCGTTTCTTTAACAAGTATGCCTATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGGTCAGCTAGAGATGCATGGGAGTTACTCCAGTCAACCGGGGTTGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGTTCTGGTGCTGTGCTTCTAATGGGTACTATTTTTGGTGGTCTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTATTTGGGCATGGGTTAAATGGAGTGACAGAATTATTATGATCGGATCCACTTCCATGCTGATGGGGATGGTATTGGTTGGATTGGCAATGGTCGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATCTGCTATGCCGAGGACCCCTCATTAATTCAAAGATGGGACGCTGAATTTTTCAACCAAATGTCTGAGACACTTCATCAGCGACTTCAATATAGAAGTGCTCGAGCAAGGGAAGTTTTAACCCACGATCGATTCGATGACCTTGTACCCCAAAATGCACGTATCTGA 1488 0.4583 MMDSPSSSSSSSEFVSIATANQSAARSSGEGVATEQSRRWHDVFWLGIFLIHLIGLGFLLGVLGLNRFERENRLNIDKFTSRFSENQSGLTETYWPLYAAAGGVGTVLGWGWLLLLGSQATQMMKVSVHILTTYLAVVSVLCFWTGQIFWGVAFAIGALLQFLYVISVIDRLPFTMLILQKAVKMIWNLPEVMRVAYVFMFVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLFHGGRDAASIPANSLVKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWKIRGFRSKIGNNECLLCLVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELLQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGIWAWVKWSDRIIMIGSTSMLMGMVLVGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPSLIQRWDAEFFNQMSETLHQRLQYRSARAREVLTHDRFDDLVPQNARI 495
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun7g03869 495 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 9 471 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Viun7g03869 495 Pfam Plasma-membrane choline transporter 153 447 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun7g03869 Viun-Chr7 38777566 38781751 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Viun7g03869 7 38777566 38781751 Viun7g03869 7 38777566 38781751 ECH