Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun2g00615 ATGGAGCAACCGCGGCGGTGGCACGACGTGTTCTGGCTAGGAACCTTTGTTATCCATTTGGTTGGTTTGGGTTTGGTTCTCGGGGTTTTAGGCCTAAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACCTACCGGTTTATGGAAAATGAAGCTGGTTTGACAGAGGATTACTGGCCGCTTTATGCGGTGGCAGGAGGCATTGGAACCGCACTTGGATGGAGTTGGTTGTTGCTGTTAGGCTCACGCGCTACCCAGATGATGAAGGTGTCTGTGCACATCCTCACCACTTACCTTGCAGTAATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAACAGTTTTTCTGGGGTGTTGCCTTTGCTATTGGGGCAACCTTGCAGTTCTTGTATGTGATTTCTGTCATAGACAGACTACCATTTACAATGTTGGTTCTGCAAAAGGCTGTGAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAAGTTATGAGAGTGGCATATGCATTTATGCTTGTTGTACTTTTATGGATGGCTTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATAGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACAGGAGCTGTGTTGTGCAATACTGTGCATGTCATAGTGTCTGGGACTGTGGTTCGTGTTACTATCCATGGTGGTAGAGAGGCTGAGTCTAATCCTGCTAACTCCTTAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGATCATTATTCACAGCAGCTATTAGGACACTGCGATGGGAGATAAGAGGAATCCGGTCAAAGATTGGCAACAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTCTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGATTCTTTAACAAGTATGCATATGTTCAGATTGCAGTTTATGGTAAAAGCTTTAATCGATCTGCTAGAGATGCATGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCTATTGTGGCGTATGATTGTTCAGGTGCTGTGTTGCTAATGGGGACCATATTTGGGGGCCTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCCTGGATGAAATGGACTGACAGGGCTTTTATGATTGGGTTGACATCTATGCTCATGGGGATGGTATTGGTTGGAATAGCTATGGTGGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATATGCTATGCAGAAGATCCCTTATTGATTCAGAGATGGGACACTGAATTTTTCAACCACATGTCTGAGACACTGCACCAACGACTTCAACATAGAAGTTCACGTGCCAGGGAAGTTTTAACCCACAATCAGCTTGATTCACGTATAGGAGAACTCTCTTCTATTTGA 1389 0.4449 MEQPRRWHDVFWLGTFVIHLVGLGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGIGTALGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGATLQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSIGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGTVVRVTIHGGREAESNPANSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEAIVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWMKWTDRAFMIGLTSMLMGMVLVGIAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFNHMSETLHQRLQHRSSRAREVLTHNQLDSRIGELSSI 462
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun2g00615 462 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 3 443 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Viun2g00615 462 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun2g00615 Viun-Chr2 14946466 14950965 Tandem
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Viun2g00615 2 14946466 14950965 Viun2g00615 2 14946466 14950965 ECH