Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu7g00013 ATGGTCTCAGCTTCTTCTCCCAATTCCAAGGAAATGGAAGTTAAATCAGATCAGAAATGGGTGGAGAATGGTCCCTCTCGCAATGCCAAATGGTGGTACTCAACTTTTCACACTGTGACAGCCATGATTGGTGCTGGTGTTCTCAGTCTGCCCTATGCCATGGCATATCTAGGATGGGTACCAGGGACCTTGATTCTGTTTCTAACTTGGTGCCTGACCTTAAACTCAATGTGGCAAATGATCCAACTCCATGAGTGTGTCCCCGGAACCCGGTTTGATCGTTACATTGATCTTGGTAGACATGCTTTTGGACCGAAGTTAGGACCATGGATTGTGCTGCCCCAGCAACTGATTGTGCAAGTTGGGTGTAATATTGTTTATATGGTCACCGGAGGGAAGTGCCTGAAGAAGTTCATGGAGATTGCTTGCACCAATTGTACTCAACTCAAGCAATCTTGGTGGATTGTCATTTTTGGTGGCATCCATTTCCTCTTGTCTCAGCTTCCCAATTTCAACTCCGTTGCAGGAGTTTCTTTAGCAGCTGCAGTGATGTCACTGAGTTATTCAACTATATCTTGGGTGGCATGTTTGGCTAGAGGCCGGGTTGACAATGTTAGCTATGCATACAAGCAAACCAGTTCTACGGACTTAATGTTCAGAATCTTCAATGCACTTGGTCAAATTTCATTTGCATTTGCTGGCCATGCAGTGACCCTTGAAATTCAGGCCACAATTCCATCTACCCCTGAGAAGCCCTCAAAGATACCAATGTGGAGAGGTGCTATAGGTGCATATTTCATCAATGCTATATGCTATTTCCCACTGGCACTGGTAGGATATTGGACCTTTGGAAGAGATGTTGAGGACAATGTGCTTATGGAATTTGAAAAACCTGCGGGGCTCATAGCCTCAGCTAACTTGATGGTATTCATTCATGTTGTTGGTAGCTACCAGGTACAAACACAACACAAGCAAGCACATGCTCACACTACTCAAGTTTATGCTATGCCTGTTTTTGACTTGATCGAGAGGTCGATGGTCAAAAGATTGAACTTCCCTCCTGGATTATCTCTTAGACTTGTCGCTAGATCAGCTTTTGTTGCTTTTACATTATTTGTCGGGGTGACATTCCCTTTCTTTGGTGATCTTCTTGGATTCTTTGGTGGCTTTGGTTTTGCTCCTACTTCATACTTTCTTCCTAGTGTGATGTGGCTGATCATCAAGAAGCCAAAGAGATTCAGCATCAACTGGTTCATCAATTGGGGTTCAATATATGTTGGAGTGTGCATTATGTTGGTATCTACTATTGGTGGCTTAAGGAATATTGTTGCTGACTCTTCTACTTATAACACAGTGGATGAGGTGTTAACATTTGGACAGGTGGCCTTTGTAGTCATGAAACGTGTCATTGATCTGATGAAACTGAATTTGGGATTCAATTTGGAGCGAAATTGGCAGAGGAGAGTGCATCGGAAGTCAATCGCGAGAGAGGATACAGAGTCCATTAAAGCATTCAAGCTTTGTAATTGGAGTTTCGAAGTCAATCTGAAGTCATATACAACTTTGTGTCAAGTGGTTCGAGGGGACGATTTTAATATTGGTGGAAGATATGCTGTTTTGATAATGCGTTGTGGTCCCCCATGTCCCCATGTTGTTATTCACCATGGGGGTAAGTTCATCAATGAGGGGTGCCTCAAGTATGAAGGAGAAAGTGATACCATGCTTTTTGATCCTGACGTGTGGTCATATTTTGTTGTAGTGAGTGTAGTAAAAAGTTTAGGGTACGATGGTTTTAAGGAATTGTGGTTTTCTATTGGATGTGGTTCTGTTTTGGGTGATAGGATAGAACCATTGTCTGATGACGTAGGTGCCATGCATATGGTGAATTTAGCTAACTTAAATGGTCAAGTTCATTTATATGTTGTGCACAGTGTGTCTGAAGCTGAAGTGATTCAAATGATTGAATACAACGTTGATGAAGGAGGTGACGAAGATGTTCCTCGGGATAATGAGTGTGGTGAGGGTGCAGAAGTTGCACTTCAGGTAAATGAGTGTGAGATGATAGAAGTTGAGGTTGAGGGAGGTCATGCTGAGAGGACAGGAGACTTAGAAGTGCAGGGAAAGGAACCTGAGGTTGAGGAACGTGATGGTGAGGAAGTTGTGGTTGAGGAAGCAGCTGAAGTGCAGGTTAAGGAAGTTGTGGTTGAGGAAGCACCTGAAGTGCAGGTTGAGGAAGCATCTGAAGTGCAGGTTGAGGAAGTTGTGGTTGAGGAAGTGCACGAAGAGGGTGATAGGTTACATGGGGAGGCTTACAGAATAGAAGTAGAAGTGCAGGTTGAGGAAGCATCTGAAGTGCAGGTTGAGGAAGTTGTGGTTGAGGAAGTGCACAAAGAGGGTGATAGGTTACATGGGGAGGCTTACAGAATAGAAGTAGAAGACTTAGATGTAGAAGACTTGGAGGATATAGAAGTAGAAGTTCGTGATGGTGATGGGCTAGTAGACATAAATGTGCAGTGTGATTTACCTGATAATGAGACTGACATGGAGGTTGAGGTTGAACCTGTGCAGTGTGATTTAACTGATAATGAGACTGACATGGAGGTTGAGGATGAACCTTTTTTACCTGAATCTGAGTCAGATAGTGAAGAAGATGAGATTGATGATTCGAGACTTGACTTCTCCTCTAAAAGTGATGAAGAAAGTGAAGATGAAGAGGGGTATGGTAATTTTTCTACCTTTACTATGCCAAAAGAAATGGCTGATTTCAAGCGGGAAGTGGGTACATATTTTGGGGATAAAAATGACATTCTTGATGCTATCAAATCTTATGGAGTAGAGAATGGAAAGAATTTAAAAATTGTTAAAAATGATAGAAAAAGAGTAAGGGTTAAATGTTTGGGATCAAAAGGAGAATGTCCGTGGGTGACATATTTTGGTTTCATGGATGCAGGCGTTGATATTAGAGATAAATTTAGTAGGAAATGGAACATAGCAATATCCAAGAATATGGCTTACAGGGCCAAAGCCTATGCATCAGATGAAGTGGCAGGTAGAATTTATGATTATGCACATGAGTTATTAGCAAGAAACCCTGGGTCCACAATCAAGGTCAAAGTTGATCCATATAATGGCAAACCAATCTTCAGGAGGCTTTATGCATGCCTAAAGGCATGTAAATATAGCTTTGTCTCATGCAGGCCAATCATTGGCCTTGATGGAGCCTTTTTGAAAGAAAGATACTGTGGTGAGCTACTAACTACTGTGGGTCGAGATGCAAACAACCAAATGTTGCCACTAGCATTTGCAATAGTAGAAGTTGAGAACAAGGACACTTGA 3336 0.423 MVSASSPNSKEMEVKSDQKWVENGPSRNAKWWYSTFHTVTAMIGAGVLSLPYAMAYLGWVPGTLILFLTWCLTLNSMWQMIQLHECVPGTRFDRYIDLGRHAFGPKLGPWIVLPQQLIVQVGCNIVYMVTGGKCLKKFMEIACTNCTQLKQSWWIVIFGGIHFLLSQLPNFNSVAGVSLAAAVMSLSYSTISWVACLARGRVDNVSYAYKQTSSTDLMFRIFNALGQISFAFAGHAVTLEIQATIPSTPEKPSKIPMWRGAIGAYFINAICYFPLALVGYWTFGRDVEDNVLMEFEKPAGLIASANLMVFIHVVGSYQVQTQHKQAHAHTTQVYAMPVFDLIERSMVKRLNFPPGLSLRLVARSAFVAFTLFVGVTFPFFGDLLGFFGGFGFAPTSYFLPSVMWLIIKKPKRFSINWFINWGSIYVGVCIMLVSTIGGLRNIVADSSTYNTVDEVLTFGQVAFVVMKRVIDLMKLNLGFNLERNWQRRVHRKSIAREDTESIKAFKLCNWSFEVNLKSYTTLCQVVRGDDFNIGGRYAVLIMRCGPPCPHVVIHHGGKFINEGCLKYEGESDTMLFDPDVWSYFVVVSVVKSLGYDGFKELWFSIGCGSVLGDRIEPLSDDVGAMHMVNLANLNGQVHLYVVHSVSEAEVIQMIEYNVDEGGDEDVPRDNECGEGAEVALQVNECEMIEVEVEGGHAERTGDLEVQGKEPEVEERDGEEVVVEEAAEVQVKEVVVEEAPEVQVEEASEVQVEEVVVEEVHEEGDRLHGEAYRIEVEVQVEEASEVQVEEVVVEEVHKEGDRLHGEAYRIEVEDLDVEDLEDIEVEVRDGDGLVDINVQCDLPDNETDMEVEVEPVQCDLTDNETDMEVEDEPFLPESESDSEEDEIDDSRLDFSSKSDEESEDEEGYGNFSTFTMPKEMADFKREVGTYFGDKNDILDAIKSYGVENGKNLKIVKNDRKRVRVKCLGSKGECPWVTYFGFMDAGVDIRDKFSRKWNIAISKNMAYRAKAYASDEVAGRIYDYAHELLARNPGSTIKVKVDPYNGKPIFRRLYACLKACKYSFVSCRPIIGLDGAFLKERYCGELLTTVGRDANNQMLPLAFAIVEVENKDT 1111
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu7g00013 1111 PANTHER OS05G0424000 PROTEIN-RELATED 29 438 - -
Vimu7g00013 1111 MobiDBLite consensus disorder prediction 857 888 - -
Vimu7g00013 1111 Pfam MuDR family transposase 921 974 IPR004332 -
Vimu7g00013 1111 MobiDBLite consensus disorder prediction 857 910 - -
Vimu7g00013 1111 Pfam Transmembrane amino acid transporter protein 28 437 IPR013057 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu7g00013 Vimu-Chr7 122387 128050 Dispersed/Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vimu7g00013 10 450 Organic Solute Cotransporters AT1G25530 73.243 0.0 655
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu7g00013 7 122387 128050 Vimu7g00013 7 122387 128050 ECH