Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu7g00003 ATGGAGCAAACGCGGCGCTGGCACGATGTGTTCTGGTTAGGAACATTTGTTATCCATTTGGTTGGTTTGGGTTTGGTTCTCGGGGTTTTAGGCCTAAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACCTACCGGTTCATGGAAAATGAAGCTGGTTTGACGGAGGATTACTGGCCGCTTTATGCGGTGGCAGGAGGCATTGGAACCGCCCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGCTGTTAGGATCACGCGCTACCCAGATGATGAAAGTGTCTGTGCACATCCTCACCACTTACCTTGCAGTGATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAGCAGTTTTTCTGGGGCGTTGCCTTTGCTATTGGGGCAACCTTGCAGTTCTTGTATGTGATTTCTGTCATAGACAGACTACCATTTACAATGTTGGTTCTGCAAAAGGCTGTCAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAAGTTATGAGAGTGGCATATGCATTTATGCTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCTTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATAGGTGATGGCGGACGTTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTGTAAGCTTGTTTTGGACAGGAGCTGTGCTATGCAATACCGTGCATGTCATAGTGTCTGGGACTGTGGTTCGTGTTACTATCCATGGTGGTAGAGAGGCTGAGTCAAATCCTGCTAACTCCTTAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGATCATTATTCACAGCTGCAATTAGGACACTGCGATGGGAGGTAAGAGGAATCCGGTCAAAGATTGGCAACAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTCTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGATTCTTTAACAAGTATGCATATGTTCAGATTGCAGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGATCTGCTAGAGATGCATGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCAATTGTGGCGTATGATTGTTCAGGTGCTGTGTTGCTAATGGGGACCATTTTTGGGGGCTTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTCTGGGCCTGGATGAAATGGAATGATAGGGCTTTTATGATTGGGTTGACATCTATGCTCATGGGAATGGTATTGGTTGGAATAGCTATGGTGGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATATGCTATGCAGAAGATCCCTTATTGATTCAGAGATGGGACACTGAATTTTTCAACCACATGTCTGAGACACTGCACCAACGACTTCAGCATAGAAGTTCACGTGCGAGGGAAGTTTTAACCCACAATCAGCTTGATTCACGTATTGGAGAACTCTCTTCTATTTGA 1389 0.4471 MEQTRRWHDVFWLGTFVIHLVGLGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGIGTALGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGATLQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSIGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGTVVRVTIHGGREAESNPANSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEVRGIRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEAIVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWMKWNDRAFMIGLTSMLMGMVLVGIAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFNHMSETLHQRLQHRSSRAREVLTHNQLDSRIGELSSI 462
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu7g00003 462 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Vimu7g00003 462 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 3 443 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu7g00003 Vimu-Chr7 38962 42572 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu7g00003 7 38962 42572 Vimu7g00003 7 38962 42572 ECH