Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu3g03591 ATGATGGATTCCCCCTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCGAGTTCGTTTCCATAGCCACCGCCAATCAGAGTGCGGCCAGGAGCAGTGGAGAAGGGGTGGCTACGGAGCAGTCGCGGCGGTGGCACGACGTGTTCTGGTTAGGAATATTCTTAATCCATTTGATTGGGCTTGGGTTCCTTCTGGGGGTTCTTGGTCTAAATAGGTTTGAGAGAGAGAATAGACTTAACATTGACAAGTTTACCTCCCGGTTTTCTGAGAACCAATCCGGGTTGACTGAGACTTACTGGCCCCTTTATGCTGCTGCTGGTGGGGTTGGGACTGTTCTTGGATGGGGTTGGTTGTTGTTGTTGGGCTCCCAGGCAACTCAAATGATGAAGGTGTCTGTTCACATACTTACCACTTACCTTGCTGTGGTCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGGCCAGATTTTCTGGGGGGTTGCTTTTGCCATTGGAGCTCTTCTGCAGTTCCTTTATGTCATATCAGTCATAGACAGACTCCCATTTACGATGTTGATTCTGCAAAAGGCTGTGAAGATGATTTGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATATGCTTTTATGTTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCAGCAGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTCTCTCTGTGAGCTTGTTTTGGACAGGTGCAGTACTATGTAATACTGTGCATGTTATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGTTCTTTTTCATGGTGGTAGAGATGCAGCTTCAATTCCAGCTAACTCCTTAGTGAAATCTCTACAGTATGCTTTAACAACATCGTTTGGCAGCATTTGCTATGGTTCATTATTTACTGCAGCAATTAGGACACTACGATGGAAGATACGGGGATTTCGGTCTAAGATTGGCAATAATGAGTGTTTACTTTGCCTTGTCGATTTCCTTTTCCATCTCGTGGAGACTCTTGTTCGTTTCTTTAACAAGTATGCCTATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGGTCGGCTAGAGATGCATGGGAATTACTCCAGTCGACTGGGGTTGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGTTCTGGTGCCGTGCTTCTAATGGGTACTATTTTCGGTGGACTTATAACCGGAACTTGCTCTGGTATTTGGGCATGGGTTAAATGGAGTGACAGAATTATTATGATCGGATCCACGTCCATGCTGATGGGGATGGTATTGGTTGGATTGGCAATGGTCGTGGTGGAAAGTGCCGTTACATCCATATACATATGCTATGCAGAGGACCCCTCATTGATTCAAAGATGGGACGCTGAATTTTTCAACCAAATGTCTGAGACACTTCATCAGCGACTTCAATATAGAAGTGCTCGAGCAAGGGAAGTTTTAACACACAATCGATTCGATGACCTTGTACCCCAAAACGCACGTATCTGA 1488 0.457 MMDSPSSSSSSSEFVSIATANQSAARSSGEGVATEQSRRWHDVFWLGIFLIHLIGLGFLLGVLGLNRFERENRLNIDKFTSRFSENQSGLTETYWPLYAAAGGVGTVLGWGWLLLLGSQATQMMKVSVHILTTYLAVVSVLCFWAGQIFWGVAFAIGALLQFLYVISVIDRLPFTMLILQKAVKMIWNLPEVMRVAYAFMFVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLFHGGRDAASIPANSLVKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWKIRGFRSKIGNNECLLCLVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELLQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGIWAWVKWSDRIIMIGSTSMLMGMVLVGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPSLIQRWDAEFFNQMSETLHQRLQYRSARAREVLTHNRFDDLVPQNARI 495
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu3g03591 495 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 9 471 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Vimu3g03591 495 Pfam Plasma-membrane choline transporter 153 447 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu3g03591 Vimu-Chr3 48649515 48653346 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu3g03591 3 48649515 48653346 Vimu3g03591 3 48649515 48653346 ECH