Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sto6g2811 ATGACGGACTCTCCttctttctcctcctcctcctcctccgatTTCGATTCCGCCAACACCGTGGATCAGAATTTGGGGCAAAGTGGTGGAGTCGCTAGTGATGTGGTTGTGATCTCAGAGCAATCGCGTCGGTGGCATGACGTTTTCTGGTTAGGAATATTCCTGATTCATTTGATTGGCTTGGGGTTCCTTATGGGGCTTCTTGGCCTCAATAGGTTTAAGAAAGAGAATAGACTTAATATTGATAAGTATACTGCCCGGTTTTCCGAGAATAAAGCCGGATTGACGGAGGATTACTGGCCGCTCTATGCTGTTGCTGGTGGAGTTGGGACTATTCTTGGATGGAgttggttgttgttgttgggTTCTCGTGGCAGTCAAATGATGAAGGTCTCGGTTCACATCCTCACCACTTATCTTGCTGTGattagtgttttgtgtttctggGCTGAACAGTTTTTCTGGGGAGTCTTTTTTGCCATTGGAGCAACTCTGCAGTTCTTGTATGTGATATCAGTCATTGACAGACTTCCATTTACCATGTTGGTTCTGCAAAAGGCTGTGAAGATGGTATGGAGTCTTCCTGAGGTTATGAGATTGGCTTATGCGTTTATGCTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCTTTTGGAGCAGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTTTTTCTGTAAGCTTATTTTGGACAGGTGCAGTACTTTGTAATACAGTACATGTCATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGTCCTTATCCATGGTGGTAGAGAGGCAGAATCAATACCTGCTAACTCTTTAGTGAAATCTCTTCAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGCTCATTATTCACAGCTGCTATTAGGACACTACGTTGGGAGATTAGGGGATTCCGATCAAAGATTGGAAACAACGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTTTTTCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTTTTCAACAAGTATGCCTATGTTCAGATAGCTGTTCATGGTAAAAGCTTTAACCGCTCAGCAAGAGATGCATGGGAGTTATTTCAGTCTACTGGAGTTGAAGCCCTCGTGGCCTATGATTGTTCTGGTGCTGTCCTGCTAATGGGCACCATTTTTGGTGGGCTAATTACCGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATCAAATGGAGTGACCGAGTAATTATGATTGGGTCCACGTCTATGTTGATGGGAATGGTTTTGAATGACTTCAGTACAGGGTGCTTTCCTTTAATCACAAAACTTATGGTTGGAGTGGCTATGGTGGTGGTGGAAAGCGCTGTTACATCCATTTATATCTGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATTCACAGATGGGACGCTGAATTTTTCAACCAGATGTCTGAGACACTACACCAGAGACTTCAACATAGAAGCGCCCGAGCTCGGGAAGTTCTAATGCAATATCGGCTCGATGGCCGGACTCGAGAAAATGCTCCTGCTTGA 1548 0.4276 MTDSPSFSSSSSSDFDSANTVDQNLGQSGGVASDVVVISEQSRRWHDVFWLGIFLIHLIGLGFLMGLLGLNRFKKENRLNIDKYTARFSENKAGLTEDYWPLYAVAGGVGTILGWSWLLLLGSRGSQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVFFAIGATLQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWSLPEVMRLAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVFSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLIHGGREAESIPANSLVKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGFRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVHGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWIKWSDRVIMIGSTSMLMGMVLNDFSTGCFPLITKLMVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIHRWDAEFFNQMSETLHQRLQHRSARAREVLMQYRLDGRTRENAPA 515
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sto6g2811 515 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 27 502 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Sto6g2811 515 Pfam Plasma-membrane choline transporter 157 467 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Sto6g2811 515 PANTHER PLASMA-MEMBRANE CHOLINE TRANSPORTER FAMILY PROTEIN 27 502 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Sto6g2811 Sto-Chr6 35317242 35321451 Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Sto6g2811 6 35317242 35321451 Sto6g2811 6 35317242 35321451 ECH