Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca8g07916 ATGATGGATTCTCCTACTTTCTCTTCTTCCTCCTCCGAATTCGCTTCCATAGCCACCGCTGACCAGAATGCAACCCGAAGTCGGAGAAGTGGCGACGGCAGCGAAGTGGTGACGGCGGCGGAAGAATCGAGGCGGTGGCATGACGTTTTCTGGTTAGGAATATTTGTAATCCATTTGGTTGGGCTGGGATTCCTTCTGGGGGTTCTTGGCCTGAATAGGTTTGAGAAAGAAAATAGACTTAACATTGATAAGTACACATCTGGGCTTTCTGAGAATGAAGCCGGGTTGACAGAGACTTACTGGCCGCTCTATGCTGCTGCTGGTGGAATTGGGACTCTTCTTGGATGGATTTGGTTGTTGTTGTTGGGTTCCCAGGCTACTCAAATGATGAAATTCTCTGTTCACATCCTCACCACTTATCTTGCTGTCATTAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAGCAGATTTTCTGGGGGGTTGCTTTTGCTATTGGAGCTGCTCTGCAGTTCTTGTATGTCATATCCGTCATAGACAGACTTCCATTTACGATGTTGGTTCTGCAAAAAGCTGTGAAGATGGTTTGGAGTCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATATGCATTTATGTTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCAGCAGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTTTCTCAGTAAGTTTATTTTGGACAGGTGCTGTACTCTGTAATACTGTACATGTTATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTCGTTCTTTTCCATGGCGGTAGAGAGGCAGCATCTATTCCTGCTAACTCCTTAACAAAATCTCTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGCTCATTATTTACTGCTGCTATTAGGACACTGCGGTGGGAGATACGTGGATTGCGGTCAAAGATTGGCAACAATGAGTGTTTGCTTTGCTTTGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTTCGGTTTTTTAACAAGTATGCCTATGTTCAGTTGGTGAATGCATTGGTTCTTGGGAAACTCACTCTAGCATGGTTCATGGTCATGTCCTTACAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCATTCCGCTAGAGATGCCTGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCTCTTGTAGCCTATGATTGTTCAGGTGCTGTCCTGCTAATGGGCACCATTTTTGGTGGATTAATAACTGGAACTTGTTCTGGTGTTTGGGCATGGGTTAAATGGAGTGACAGAGTTATTATGATTGGGTCCACATCCATGCTGATGGGGATGGTACTGGTTGGGCTGGCAATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCGATATATATATGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATTCAAAGATGGGACGCTGAATTTTTCAACCAGATGTCTGAGACATTGCATCAACGACTTCAGTATAGGAGTGCTCGAGCGAGGGAAGTTTTAACCCACTATCGACTCGATAACCCTATACGAGAAAACGCTTCCTCTATTTGA 1572 0.4459 MMDSPTFSSSSSEFASIATADQNATRSRRSGDGSEVVTAAEESRRWHDVFWLGIFVIHLVGLGFLLGVLGLNRFEKENRLNIDKYTSGLSENEAGLTETYWPLYAAAGGIGTLLGWIWLLLLGSQATQMMKFSVHILTTYLAVISVLCFWAEQIFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWSLPEVMRVAYAFMFVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVFSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLFHGGREAASIPANSLTKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGLRSKIGNNECLLCFVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQLVNALVLGKLTLAWFMVMSLQIAVYGKSFNHSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWVKWSDRVIMIGSTSMLMGMVLVGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDAEFFNQMSETLHQRLQYRSARAREVLTHYRLDNPIRENASSI. 524
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca8g07916 523 Pfam Plasma-membrane choline transporter 159 474 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Seca8g07916 523 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 35 498 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca8g07916 Seca-Chr8 176829519 176833875 Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Seca8g07916 8 176829519 176833875 Seca8g07916 8 176829519 176833875 ECH