Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops6g03330 ATGGATTCTCCCACTTTCTCTTCTTCTTCCGCTGAGTTCGCTTCCATAGCCACCGCTGATCAGAATGCAGCAAGAAGTCTGAGAAGTGGTGACGGCAGCGAAGTAGCAGCGGCGGAACAGTCACGGCGGTGGCACGATGTTTTCTGGTTAGGAATATTTGTAATCCATTTGATTGGCTTGGGATTCCTTCTTGGGGTTTTTGGTCTCAATAGGTTTGAGAAAGAGAATAGACTTAACATTGATAAGTTCACTTCTCGGCTTTCTGAGAATGAAGCCGGGTTGACTGAGACTTATTGGCCACTCTATGCTGCTGCTGGTGGAGTTGGAACTGTTCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGTTGATGGGTTCTCAGGCTACTCAAATGATGAAGGTGTCTGTTCACATCTTGACCACTTATCTTGCTGTCATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAGCAGTTTTTCTGGGGGGTTGCTTTTGCTATTGGAGCTGCTCTGCAGTTCTTGTATGTCATATCCGTCATAGACAGACTTCCATTTACAATGTTGGTTCTGCAAAAAGCTGTGAAGATGGTTTGGAAACTTCCTGAGGTTATGAAAGTGGCATATGCATTTATGCTTGTTGTGCTTTTGTGGATGGCCTTATGGTCCTTTGGAGCAGCGGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCTTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACAGGTGCAGTGCTTTGTAATACTGTACATGTTATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGTTCTTCTCCATGGCGGTAGAGAGGCAGCTTCAATACCTGCTAACTCCTTAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGAAGCATTTGTTATGGTTCATTATTTACTGCTGCTATCAGGACACTGCGGTGGGAGATACGGGGATTTCGGTCAAAGATCGGAAACAATGAGTGTTTACTTTGTTGTGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACCCTTGTTCGTTTTTTTAACAAGTATGCCTATGTTCAGATTGCTGTTCATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCTGCTAGAGATGCCTGGGAATTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCACTTGTAGCCTATGATTGTTCAGGTGCTATCCTGCTAATGGGTACCGTTTTTGGTGGGCTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTATGGGCTTGGATTAAATGGAGAGACAGAGTCATGATGATTGGGTCCACATCCATGCTGATGGGTATGGTATTGGTTGGATTGGCAATGGTTGTAGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATATATATGCTATGCAGAAGACCCCTTAATGATTCATAGATGGGACGCTGAATTTTTCAACCAGATGTCTGAGACACTACATCAACGACTTCAATATAGGAGTGCTCGAGCAAGAGAAGTTTTAACACATATACGAGAAGAAAACTCCTCTATTTGA 1485 0.4364 MDSPTFSSSSAEFASIATADQNAARSLRSGDGSEVAAAEQSRRWHDVFWLGIFVIHLIGLGFLLGVFGLNRFEKENRLNIDKFTSRLSENEAGLTETYWPLYAAAGGVGTVLGWSWLLLMGSQATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWKLPEVMKVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVFSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLLHGGREAASIPANSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGFRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVHGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAILLMGTVFGGLITGTCSGVWAWIKWRDRVMMIGSTSMLMGMVLVGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPLMIHRWDAEFFNQMSETLHQRLQYRSARAREVLTHIREENSSI* 495
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops6g03330 494 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 35 475 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Rops6g03330 494 Pfam Plasma-membrane choline transporter 157 451 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops6g03330 Rops-Chr6 57771859 57776519 Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops6g03330 6 57771859 57776519 Rops6g03330 6 57771859 57776519 ECH