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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops6g03178 ATGAAGACCCTTTCCTTCAATGGATTTTGGTTTTTGTTGTGCCTTTTCTCTATGTTATTGTCTCTGAGCTCGATTTCAGCTTTACCTTCAAGTGGGTCGATCAAGCATCCCATAAAGTTTATTCTAGGAGAAGGAGAAGTGAATTTGGGTCCGTGGCAAAATGAAGTCACGCAAGTGGCTCCAGCCCCAGGACCTAATACTGAGGATACTCTTGTCCTGGCAGCAAAAAGGACCAAAAGGCCTGACATTCTACGAGAATTTCGACGTTATCGAGGTGGTTGGGATATTGCAGATCGGCATTACTGGGCTTCAGTTGGATTCACTGGTGCAGCTGGTTTCATTCTTGCCGTCCTATGGTTTATCTCATTTGGCTTGGCACTTGTGATTCATCTATGCTGTGGATGGGGAATTAACATCAAGAACAAAGGATCAAATCGTTCACAGAGGATTTGTCTTATACTGCTTTTATTATTTACCTTTGCTGCAGCGACTGGATGTATCCTCCTTTCTGTTGGACAGGATAAGTTCCATGGTGAGGCCTTGGATACCCTCCATTATTTTGTCAATCAGTCAGACTATACAGTGCAGATCCTAAGAAATGTCACAGAGTATCTCTCCCTTGCAAAGACTATCAATGTCACCCAGATTCTTCTTCCATCTGATGTCATGGATGGTATTGACAAGTTGAATGTGGATCTAAATACTGCAGCAGATACACTTTCCCAGAAGACTAATGAAAATTCTGTTAAAATTATAAGAGTATTCAATGATGTGCGTCTAGCTTTGTATGTTGTGGCAGCAGTGATGCTTCTCCTGGCTATAACTGGACTAGTCCTGTCTGTCCTTGGATATCAACATGCAATCCTCATATTTGTTGTCACTGGATGGTTACTGGTTGCAACCACATTCATTCTTTGTGGAGTGTTCATGATCCTTAATAACGCAATTTCTGATACCTGTATGGCTATGGGAGAATGGGTGGCAAATCCACACAGAGAATCTGCCCTTAGCGATGTCCTCCCATGTGTTGATCAGAGAACCACGAACAAAACACTTTTTCAAAGTGAACAAGTGGTCAACAATATTGCTAGTGTTGTCAATCAGTTCATCTATAATACTGCAAACACAAATGCAACACAAGGTACTCTGGGTTACTACAATCAGTCTGGGCCTGCAATGCCGCCTTTATGCTATCCCTATGACTCTCAGTTTCAAGAGCGCCAATGTACAGATCAAGAAGTTTCTTCTGCCAATGCTTCAATGGTTTGGAAGAACTATGAATGTGAAGTATCTGAATACGGTATTTGCACCACAGTTGGCAGGGTGACCCCAGAGGTTTACTCGCAGTTAGTAGCCGCAGTAAACGAAAGCTTTGCATTAGAACATTATACCCCACTTTTACTAAGCCTTCAGAATTGCAATTTTGTCAGGGATGCATTCACAGGAATCACTTCAAGTTACTGTCCTCCATTAAACCATTACCTTAAGATTATTAATGTAGGACTAGGCCTCATCTCAGTTGGTGTTCTGCTCTGCCTTGTTCTCTGGATACTCTATTCAAACCGCCCCCGAAGGGGAGAAGTGTTTGCGAAGTTATCCTTACCAGAAAAAATAAAAAACAGATTTAACAAGAACCACAACAGCACAAATTTTGCAGTGTCAAATGCAGATAGTGGAGTATAG 1683 0.4195 MKTLSFNGFWFLLCLFSMLLSLSSISALPSSGSIKHPIKFILGEGEVNLGPWQNEVTQVAPAPGPNTEDTLVLAAKRTKRPDILREFRRYRGGWDIADRHYWASVGFTGAAGFILAVLWFISFGLALVIHLCCGWGINIKNKGSNRSQRICLILLLLFTFAAATGCILLSVGQDKFHGEALDTLHYFVNQSDYTVQILRNVTEYLSLAKTINVTQILLPSDVMDGIDKLNVDLNTAADTLSQKTNENSVKIIRVFNDVRLALYVVAAVMLLLAITGLVLSVLGYQHAILIFVVTGWLLVATTFILCGVFMILNNAISDTCMAMGEWVANPHRESALSDVLPCVDQRTTNKTLFQSEQVVNNIASVVNQFIYNTANTNATQGTLGYYNQSGPAMPPLCYPYDSQFQERQCTDQEVSSANASMVWKNYECEVSEYGICTTVGRVTPEVYSQLVAAVNESFALEHYTPLLLSLQNCNFVRDAFTGITSSYCPPLNHYLKIINVGLGLISVGVLLCLVLWILYSNRPRRGEVFAKLSLPEKIKNRFNKNHNSTNFAVSNADSGV* 561
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops6g03178 560 Coils Coil 226 246 - -
Rops6g03178 560 PANTHER TRANSMEMBRANE PROTEIN DDB_G0292058 65 538 IPR040283 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops6g03178 Rops-Chr6 55407261 55411748 Dispersed/Transposed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops6g03178 6 55407261 55411748 Rops6g03178 6 55407261 55411748 ECH