Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops1g00479 ATGGAGCAACAACGGCGTTGGCACGATGTGTTCTGGTTAGGACTATTTGTGATCCAATTGATTGGTGTAGGTTTAGCTCTTGGGGTTTTAGGCCTCAACAGGTTCAAGATAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACCTACCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGGTTGACGGAGGATTACTGGCCACTTTATGCGGTTGCCGGCGGCATTGGGACCGCTCTTGGATGGAGCTGGTTGTTGCTGTTGGGTTCACGTGCCACCCAGATGATGAAAGTGTCTGTGCACATCCTCACCACTTATCTTGCAGTGATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAGCAGTTTTTTTGGGGTGTTGCTTTTGCTATTGGAGCAGCTCTTCAGTTCTTGTATGTGATATCAGTCATAGACAGACTTCCATTTACTATGTTGGTTCTGCAAAAGGCTGCCAAGATGGTATGGGATATTCCTGAGGTTATGAGAGTTGCATATGCGTTTATGCTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTCGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACAGGTGCTGTGCTTTGTAATACTGTACATGTCATAGTGTCTGGGACAGTTGTTCTTGTTAGTATCCATGGTGGAAGAGAGGCTGCATCAATTCCCACTAACTCCTTCATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACTTCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGCTCATTATTCACAGCTGCTATTAGGACACTGAGATGGGAGATAAGAGGAATCCGGTCAAAGATAGGCAACAATGAATGTTTGCTTTGCTTTGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTCTTTAACAAGTATGCTTATGTTCAGATTGCGGTTTATGGTAAAAGCTTCAACCGTTCTGCTAGAGATGCCTGGGAATTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGTTCAGGTGCTGTGCTGTTAATGGGAACCATTTTCAGCGGGCTGATAACTGGAACTTGCACTGGTGTTTGGGCATGGATTAAATGGAGTGACAGAGCTTTTATGATTGGATCCACATCTATGCTCATGGGGATGATATTGGTTGGAGTGGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATCTGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATTCAGAGATGGGACCCTGACTTTTTCAACCAGATTTCTGAGACACTGCAGCACCGACTTCAACATAGGAGTTCACGTGCAAGGGAAGTTTTAACCCGCAATCAACTTGGTAGCCCTATACGAGAAAACCCCTCTATTCGGTGGATCACATGA 1401 0.449 MEQQRRWHDVFWLGLFVIQLIGVGLALGVLGLNRFKIKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGIGTALGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAAKMVWDIPEVMRVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGTVVLVSIHGGREAASIPTNSFMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSKIGNNECLLCFVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFSGLITGTCTGVWAWIKWSDRAFMIGSTSMLMGMILVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDPDFFNQISETLQHRLQHRSSRAREVLTRNQLGSPIRENPSIRWIT* 467
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops1g00479 466 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 3 438 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Rops1g00479 466 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops1g00479 Rops-Chr1 12390330 12400712 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops1g00479 1 12390330 12400712 Rops1g00479 1 12390330 12400712 ECH