Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pvu3g0295 ATGGAGCAACCGCGGCGTTGGCACGATTTGTTCTGGTTAGGGATGTTTGTTATCCATTTGGTTGGTTTGGGTTTGGTTCTCGGGGTTTTAGGCCTCAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACCTACCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGTTTGACGGAGGATTACTGGCCGATTTACGCGGTGGCAGGAGGCATTGGAACTGCCCTTGGATGGAGTTGGTTGCTGCTGTTAGGCTCACGCGCTACCCAGATGATGAAGGTGTCTGTGCACATCCTCACCACTTACCTTGCAGTGATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAGCAGTTTTTCTGGGGTGTTGCCTTTGCTATTGGGGCAACCTTGCAGTTCTTGTATGTGATGTCTGTCATAGAGAGACTTCCATTTACTATGTTGGTTTTGCAAAAAGCTGTCAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAAGTTATGAGAGTAGCATATGCATTTATGCTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTGGTGGCTTCAAGCATAGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTATAAGCTTATTTTGGACAGGAGCTGTGCTGTGCAACACTGTGCATGTCATAGTGTCTGGGACAGTGGTTCGTGTTACTATCCATGGTGGTAGAGAGGGTGCATCAGTTCCTGCTAACTCCTTAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGATCATTATTCACAGCTGCAATTAGGACACTGCGATGGGAGATAAGAGGAATTCGGTCAAAGATTGGCAAGAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTCTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGATTCTTTAACAAATATGCATATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACAGATCTGCTAGAGATGCATGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCAATTGTGGCCTATGATTGTTCAGGTGCTGTGTTGCTAATGGGGACCATTTTTGGGGGCCTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCCTGGATTAAATGGAATGACAGGGCTTTTATGATTGGGTCAACATCTATGCTCATGGGGATGGTATTGGTTGGAATAGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCGATATACATATGCTATGCAGAAGATCCCTTATTGATTCAGAGATGGGACACTGAATTTTTCAACCACATGTCTGAGACACTGCACCAACGACTTCAGCATAGAAGTTCACGTGCGAGGGAAGTTTCAACCCACAATCACCTTGATTCACAAAAATTATCTATATAA 1380 0.4449 MEQPRRWHDLFWLGMFVIHLVGLGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPIYAVAGGIGTALGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGATLQFLYVMSVIERLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSIGDGGRWWLLVVLSISLFWTGAVLCNTVHVIVSGTVVRVTIHGGREGASVPANSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSKIGKNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEAIVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWIKWNDRAFMIGSTSMLMGMVLVGIAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFNHMSETLHQRLQHRSSRAREVSTHNHLDSQKLSI* 460
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pvu3g0295 459 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Pvu3g0295 459 MobiDBLite consensus disorder prediction 439 459 - -
Pvu3g0295 459 PANTHER PLASMA-MEMBRANE CHOLINE TRANSPORTER FAMILY PROTEIN 2 453 - -
Pvu3g0295 459 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 2 453 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pvu3g0295 Pvu-Chr3 2710379 2720649 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pvu3g0295 3 2710379 2720649 Pvu3g0295 3 2710379 2720649 ECH