Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pumo8g00691 ATGGAGCAACCACGGCGTTGGCACGACGTATTCTGGTTAGGTATATTTGTGATCCATTTGGTTGGTTTGGGTTTGGTTCTTGGGGTTTTAGGCCTCAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACATACCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGTTTGACGGAGGATTACTGGCCGCTTTACGCGGTGGCCGGAGGCGTCGGAACCGCCCTTGGATGGAGTTGGTTGCTGCTGTTAGGCTCACGCGCCACCCAGATGATGAAGGTGTCTGTGCACATCCTCACCACTTACCTTGCTGTCATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAGCAGTTTTTCTGGGGTGTTGCCTTTGCTATTGGGGCAGCCCTGCAGTTCTTGTATGTGATTTCTGTCATAGACAGACTTCCATTTACAATGTTGGTTCTACAAAAAGCTGTCAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATCTGCATTTATGCTTATTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGACGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTATAAGCTTATTTTGGACAGGTGCTGTGCTCTGCAACACTGTGCATGTCATAGTGTCTGGGACAGTGGTTCTTGTTAGTATCCATGGTGGTAGAGAGGGTGTGTCAATTCCCTCTAACCCCTTAATGAAATGTTTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGAAGCATTTGTTATGGCTCATTATTCACAGCCGCAATTAGGACACTGCGATGGGAGATAAGAGGAATCCGATCCAGGATAGGAAACAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTCTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTCTTTAACAAGTATGCTTATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCACTCTGCTAGAGATGCATGGGAGCTATTCCAGTCAACTGGAGTAGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGTTCGGGTGCTGTGCTGCTAATGGGAACCATTTTTGGTGGGCTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCCTGGATTAAATGGAATGACAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACATCCATGCTCATGGGAATGATATTGGTTGGAATGGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATATGCTATGCAGAAGATCCCTTATTGATTCAGAGGTGGGACACTGAGTTTTTCGACCAGATGTCTGAGACACTGCACCAACGACTTCAACATAGGAGTTCACGTGGTGCAAGGGAAGTTTTAACCCACAATCAGCTTGATTCACACGCCTCTATTTGA 1380 0.4601 MEQPRRWHDVFWLGIFVIHLVGLGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGVGTALGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVASAFMLIVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSISLFWTGAVLCNTVHVIVSGTVVLVSIHGGREGVSIPSNPLMKCLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSRIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNHSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWIKWNDRAFMIGSTSMLMGMILVGMAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFDQMSETLHQRLQHRSSRGAREVLTHNQLDSHASI 459
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pumo8g00691 459 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Pumo8g00691 459 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 3 442 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pumo8g00691 Pumo-Chr8 26383480 26388076 Transposed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pumo8g00691 8 26383480 26388076 Pumo8g00691 8 26383480 26388076 ECH