Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pumo3g00259 ATGATGGATTCCTCCTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCGAGTTCGCTTCCATAGCCACTGCTGATCAGAGTGCTGCCCGGAGCGCCGGAGAAGGTGTGGCGGAGCAGCAGTCGCGGCGGTGGCACGACTTGTTCTGGTTAGGAATATTTTTAATCCACTTGATTGGGCTGGGGTTACTTCTGGGGGTTCTTGGTCTGAATAGGTTTGAGAGAGAGAATAGACTTAACATTGACAAGTACACGTCCCGGTTTTCTGAGAATGGATCCGGGTTGACTGAGACTTACTGGCCACTATATGCTGCTGCTGGTGGGGTTGGGACTGTTCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGTTGTTGGGTTCACAGGCTACTCAAATGATGAAGGTGTCTGTTCACATACTCACCACTTACCTTGCTGTCATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGCCCAGATTTTCTGGGGGGTTGCTTTTGCTATTGGAGCTTCTATTCAGTTCCTCTATGTCATATCAGTCATAGACAGACTTCCATTTACGATGTTGGTTCTGCAAAAAGCTGTGAAGATGGTTTGGAATATTCCCGAGGTTATGAGAGTGGCATATGCATTTATGTTTGTCGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCAGCGGGTGTTGTGGCTACAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTCTCTCTGTGAGCCTATTTTGGACAGGTGCAGTACTATGTAATACTGTGCATGTTGTAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGTTCTTTTTCATGGTGGTAGAGATGCAGCTTCTATTCCAGCTAACTCCTTAATGAAATCTCTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGTTCATTATTTACTGCAGCTATTAGGATGCTACGGTGGGAGATACGGGGATTTCGGTCAAAGATTGGAAATAATGAGTGTTTACTTTGCTTGGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTTCGTTTTTTTAACAAGTATGCATATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCAGCTAGAGATGCATGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGGGTTGAAGCACTTGTGGCGTATGATTGTTCTGGTGCTGTCCTTCTAATGGTCACTGTTTTTGGTGGGCTGATAACTGGAACTTGCTCTAGTGTTTGGGCATGGCTTAAATGGAGTGACAGAGTTATCATGATTGGATCAACATCCATGCTGATGGGGATGGTACTGATTGGATTGGCAATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCAATATATATATGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATTCAGAGATGGGATGCTGAATTTTTCAACCAGATGTCCGAGACACTTCATCAGCGACTTCAATATAGGAGTGCTCGAGCAAGGGAAGTTTTAACCCACAATCGACTCGATGACCTTGTACAACAAAACGCACCTATTTGA 1488 0.4469 MMDSSSSSSSSSEFASIATADQSAARSAGEGVAEQQSRRWHDLFWLGIFLIHLIGLGLLLGVLGLNRFERENRLNIDKYTSRFSENGSGLTETYWPLYAAAGGVGTVLGWSWLLLLGSQATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAAQIFWGVAFAIGASIQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNIPEVMRVAYAFMFVVLLWMALWSFGAAGVVATSMGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVVVSGMVFLVLFHGGRDAASIPANSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRMLRWEIRGFRSKIGNNECLLCLVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMVTVFGGLITGTCSSVWAWLKWSDRVIMIGSTSMLMGMVLIGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDAEFFNQMSETLHQRLQYRSARAREVLTHNRLDDLVQQNAPI 495
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pumo3g00259 495 Pfam Plasma-membrane choline transporter 153 447 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Pumo3g00259 495 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 8 474 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pumo3g00259 Pumo-Chr3 3317451 3321618 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pumo3g00259 3 3317451 3321618 Pumo3g00259 3 3317451 3321618 ECH