Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste8g01146 CGTTAATATTATATATCTATGTTGATTTGATATGGATCGTGGCTAGGGCTGTATGTTGATTTTGGCTTCTGATGACCACCATTTCTCAGACAGTGATAACCTTTGTCTGGTGTTCCAATTCATTCCCCCCTTTCATCGAATGTTCCACAACAGTGTATCGATCTCCGTCTCCGATGACGAATCCGACGAGCTGGGTCGGATGCGGATTCGCGCGCGACGGAAGCGGAAGAAACTCGGCCACAAACGATTGCTGAGGAAGCTGCTCCTCAAATACTGGCTGCTACTCATCATTGTTCCCGTTGTGTGTTTGCTCATATTCGAGGCCACCAAAATTGGTCAAAGCTTCAATAATCTTAACAACAACACCCACACCCATATGGAAACACACAATATTAAAGTTGATAGATCTAGTCCCACATTGCCGAAGGAGCTCCCCGCCAACTTGAACCGCCTCGATCCTACCACCCGTGTTGTTGGTGGTGTCAGAGAACGTAAGTCCTTTTCTCTATTTCTGTACCGTCCCTCTTGGATTCTCCCTTCAGCATCCATCCGCCCATTATATGCTGTTAACTACGGACTAAATGAATGTTGCTTGAAACTCCTACCACCTGAAAAGCTCGAGCATTTGGATATTCCTGTGGAAGAAAAATCTTTTAGTTTTCCTGTTGGTGAAGTTTTATACATGTCAGATAGCAATAGGTCTATTGAAGGAGGGAATGTTACGCTGTCCCAATTGCGTACAGAGGACATGAGGTTTAATTTATTTACTGGAAATCAAACATTTGAGCAGAGAGATAAAAGTTTTGAGTTGAAAGAAACTATGATGGTACACTGTGGGTTCTACAGTTTGAATGGAGGGTTTAAGATATCTGATGAAGATAAAAATTACATGCAAGGTTGTGAAGCCGTGGTATCTACTTGTGCATTTGGTGGTGGAGATGATCTCTATCAACCAATCGGATTGTCGGAGGCTTCGCTTAAGAAGGTTTGCTATGTTGCATTCTGGGATGAAATCACCCTAAAAGCGCAGGAGTTGGTGGAACGCAGAATTGGGGAAAATAGATTTATTGGAAAGTGGCGTGTTGTTGTTGTTCGGGATCTTCCTTTTGCTGATCAAAGGTTGAATGGTAAAATTCCCAAGATGTTAAGCCATCGCCTTTTCCCTCGAGCAAAATACTCAATTTGGGTAGACTCAAAGTCCCAATTTCGGAGAGATCCCCTAGGTGTGTTGGAAGCACTCCTATGGCGCTCAAATTCTATACTTGCGATATCAGAACATGGAGCTCGCAGTAGTGTCTATGATGAGGCTAAGGCTGTTGTCAAGAAGAACAAAGCCAAGCCAGATGAAGTTGAAGTGCAACTGAATCAATACAGAAAAGATGGCCTACCTGAAGACAAGAGATTTAATGGAAAAAAAGCTCTATGTGAAGCCTCTGTTATCGTGAGGAAGCATACACCACTCACGAATCTACTAATGTGCGTCTGGTTTAATGAAGTGGTTCGTTTCACTTCTAGGGATCAGCTTAGCTTCCCATATGTCTTGTGGCGGCTGAAAGCATTAAAAAATATCAATACTTTCCCTGTTTGTACTCGCAAGGATCTTGTTAATAGTATGGGCCATATCCGCAAGGCCAAACCTTTGCAAAGCTCAATTTAATTAATTTGGTCGAAAGCAATGTTTACCTGCATTTATCTAACTTACTCCTTTCTTCAGTAATTTCTTTTCTTTAGCCAATCTGAATCAGGTGTGTGTTGTTTTTCTAACCTTTCTCTCGTAGATCGGGAATGGTCATAAGCTTTTATAATTTGTATATGAAATCTTTGGTTAGATTATTTCAGACAGGAGCAAGTTGATATGGAAAGGCAAATCAAACAGAGAAAGGATTTTTGCTTTGGACCTGTTTCCCAACATAAATTTATATTATAACATCAATGTTTTCATAAATTGTGAGATTTGTTGTGCCGTTATATTTAGTGAAAATAAATAAATGCAGCCATATGTGATTGTTGACATAGATATCTCCTGTCAGACATTTAGCAATTCCTCCAGAGGTAGCTAATAATTATGGCAAGGAAAATGGTCATGAGTGAAGAACAAAGCCAAATCTATTGTAGTGTTTGTGTAAAGTCCTGCAACACATTGAGACTCCTGCTTCTGGCAATGTCTAAGGGTTTTCCAATTTCTGACTTCTGTTTGTTTTTATCTGTCATTTTGTTTACTATTGTAGTTTTTTTTATATTATCTCCATCGTCTCTTTCAGACTGAAGATTTAATGATCAAAGATATTTTGTACAATGGTTGATACTGCAAAGTTAAACGGCTGACAGCTCCAGATAATTAATTTCTTTGAAAGGATTCCTCTTGAATTATTCTATTTCTCTGGACTTGATCACATAACATATAGATTTAATCGTGATCCTGTTTTTCCACATTCTAGTGTTTGTGTAAAGTCCTGCAACACATTGAGACTCCTGCTTCTGGCAATGTCTAAGGGTTTTCCAATTTCTGACTTCTGTTTGTTTTTATCTGTCATTTTGTTTACTATTGTAGTTTTTTTTTTATATTATCTCCATCATTTCCACTTGGGCCTTACAGGGAAGATAATCAAATGGATGTTTGTGCAAGCAGTTGTGGATGATTATTGTTGGAAAAGTTGATATCTTAGGTTTTATTACCCTTATTTCATTCAATTTCTTATGTTCTTGTTCTGGAATGGCTATGCTTTCTTGTTGGTTGAATCTGACTGTGTACAGTAATCTGATAGTGTCA 2770 0.3906 MLILASDDHHFSDSDNLCLVFQFIPPFHRMFHNSVSISVSDDESDELGRMRIRARRKRKKLGHKRLLRKLLLKYWLLLIIVPVVCLLIFEATKIGQSFNNLNNNTHTHMETHNIKVDRSSPTLPKELPANLNRLDPTTRVVGGVRERKSFSLFLYRPSWILPSASIRPLYAVNYGLNECCLKLLPPEKLEHLDIPVEEKSFSFPVGEVLYMSDSNRSIEGGNVTLSQLRTEDMRFNLFTGNQTFEQRDKSFELKETMMVHCGFYSLNGGFKISDEDKNYMQGCEAVVSTCAFGGGDDLYQPIGLSEASLKKVCYVAFWDEITLKAQELVERRIGENRFIGKWRVVVVRDLPFADQRLNGKIPKMLSHRLFPRAKYSIWVDSKSQFRRDPLGVLEALLWRSNSILAISEHGARSSVYDEAKAVVKKNKAKPDEVEVQLNQYRKDGLPEDKRFNGKKALCEASVIVRKHTPLTNLLMCVWFNEVVRFTSRDQLSFPYVLWRLKALKNINTFPVCTRKDLVNSMGHIRKAKPLQSSI 534
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste8g01146 534 PANTHER ALKALINE CERAMIDASE-RELATED 33 529 IPR006852 -
Pste8g01146 534 Pfam Protein of unknown function (DUF616) 229 523 IPR006852 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste8g01146 Pste-Chr8 6001366 6006971 Dispersed/Transposed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste8g01146 8 6001366 6006971 Pste8g01146 8 6001366 6006971 ECH