Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g04066 AAAAAATTATTAAATAATTTCAAACTATCATGTTATTTGCAATCTCAATCAATTATGGTGTAATATTTGATTAATACAATTTATAATATAAATTAGTTAATTAATTATATAATAAGTAATTGAAAATGAGAGAGAGTTTGTATATTAATTTGATCTAATAATTGTTTATGTGAGAGAGAGTTTGAATATAACATTTCTCTACCTTTTAATTTGCCATTGAAAATGAAAAATTATTAATAGGAGTTGAGTTGGTGACCATAATAAATTGTGACAATATCGTCTCTTCCTCAACCTCTGAACTTTCTTGTGCAGCGCAGACCCGTGCTGGCGCACCAAACTAACCTCTTCACGTAACACCACATTTTCCCCAAATTCATCTCTCGAAACCCTAATTCTCGATTCCCGATGGCCGTCTTGCTCAGCGAAATTCTTCAATCCGTCGAACTCTGGCTCAAATTGACCAAAAAACCGCAGCTACAGACCTACGTCAACCCTAATCTGGACCCCGTTTTGTTGGTCCCCGGCATCGGTGGCTCCATCTTGCACGCCGTTAACGACAGCGACGGCTCCTACGAACGCGTTTGGGTTCGCTTCCTCAGCGCCGAGTACAAGCTGAAAACCAAGCTTTGGGCGCGTTACGATCCTTCCACTGGAAAAACCGAGTCCATAGATCCAAATTCAACAATTAAGGTTCCTGAAGATAGGCATGGACTCTATGCAATTGATATTTTGGACCCTGACTTGATGGTTGGAAGTGAAGCTGTGTATTATTTCCACGACATGATCGTTGAAATGCGCAAGTGGGGGTTTGAAGAGGGAAAGACTCTTTTTGGCTTTGGATATGATTTTCGCCAAAGCAATAGGTTGCAGGAAACAATGGATCGGTTAGCTGCAAAATTAGAATCAATTTATAATGCTGCAGGAGGGAAGAAGATAAACATTATAACTCATTCTATGGGTGGTCTTCTGGTGAAATGTTTCATGGGCCTGCAAAGTGATGTAACACATCTGTCATGCTTTTTGAATCTTTATTATATGTTACTTTGTAGTTTCTATCTAATCTTATGTTTATATTTTGTCAAGTTATGGTTTATACTTTATACACTTCAATTTTGGAATTTATCTGCTGCTGAAACATGTCTACATTTTTTCTTCTCTCTTCAGATTTTTGAAAAATATGTTAAGAATTGGATTGCAATTTGTGCACCGTTCCAGGGTGCACCTGGAACCGTCAATTCTACCTTTTTGAATGGAATGTCATTTGTGGAGGGATGGGAACAAAACTTCTTTATTTCCAAATGGTGCATGCACCAGTTGCTGATTGAATGTCCATCGATATACGAATTGATGGGTTGCCATAATTTCCATTGGCAACATGTTCCTGTTCTGGAATTGTGGCGTGAGAAACATGATTCTGATGGAAAATCACATATTATTCTGGAGTCATATCCACCATGTGATAGTGTTGATATTTTGAAGAAAGCGCTTGTTAATTGTGATGGTGAGGATTTGCCCCTGCCCTTCAACTTGGACATCTTGAAATGGGCAAACAAAACATGGGAAATTCTGTCTTCTGCCAAACTTCCCTCACAAGTTAAATTTTACAATATTTATGGGACCAATCTTGAGACGCCTCATAGTGTTTGCTTTGGAAGTGGGGACAAGCCTGTCACAGATCTGCAACAGCTACGTTATATTCAGGCCAAATACGTATGTGTTGAAGGAGACGGAACAGTTCCTATAGAATCAGCTAAGGCTGATGGTCTCAATGCGGAGGCAAGGGTTGGAGTGCCGGGTGAACATCGCGGTATCCTCTGTGAGCCTCACATGTTTCGGCTTCTAAAGCACTGGCTGAAGGCTGGAGAGCCTGATCCGTTTTACAATCCTGTCAATGATTATGTGATTCTTCCTACTGCTTTTGAAATGGAAAGGCACAAAGAGAAGGGTGTTGAAGTAGCATCCCTTAAAGAGGAATGGGAAATTATTTCCAAAATCCCAGATGACCAAAGCAATACAACAGATAAAGTGTGCACCATTTCGGTTTCACAAGAAGGAACCAATCATTCTTACTCTGAAGCTCATGCTACCGTCACTGTTCACCCTGACAATCAGGGCAAACAGCACGTTCAACTCAATGCCTTGGCTGTTTCAGTTGACGCCTCATGAAAACCACATTCTGTTGAAGTATGACGAATGTGAAGGGAATACTTTTTATAGCAGTGGATTATGGTTGGCATCACTTGTATATATAACCATATTCGTTTGATGTTGCTGTTCCAATGTGCTCCCATGTATCATATGTAAAGCGTTTGTCTCGGTTATGAAAGTGAATACCATCTTTCTGACGTTCTTGTATATATAATGAAATTCGCTTGATGTTGCTGTGCCTTATTCCTCCCTGTTTTATGTGTCATAGTGAAGCGTATGTATCAGTCCTTAAGATGAATATGTGTCATATATGTGAGAATGAAGATGAATACTACCCTTATGACATTCTCAACCTATGTTAAGAGCAACATGCTATGTAGTATTGCACAAAGGTGCTGCTGTGTACTAGTATTTGTAATAATTAATAAATAATATTTTTTAATATATG 2596 0.3898 MAVLLSEILQSVELWLKLTKKPQLQTYVNPNLDPVLLVPGIGGSILHAVNDSDGSYERVWVRFLSAEYKLKTKLWARYDPSTGKTESIDPNSTIKVPEDRHGLYAIDILDPDLMVGSEAVYYFHDMIVEMRKWGFEEGKTLFGFGYDFRQSNRLQETMDRLAAKLESIYNAAGGKKINIITHSMGGLLVKCFMGLQSDVTHLSCFLNLYYMLLCSFYLILCLYFVKLWFILYTLQFWNLSAAETCLHFFFSLQIFEKYVKNWIAICAPFQGAPGTVNSTFLNGMSFVEGWEQNFFISKWCMHQLLIECPSIYELMGCHNFHWQHVPVLELWREKHDSDGKSHIILESYPPCDSVDILKKALVNCDGEDLPLPFNLDILKWANKTWEILSSAKLPSQVKFYNIYGTNLETPHSVCFGSGDKPVTDLQQLRYIQAKYVCVEGDGTVPIESAKADGLNAEARVGVPGEHRGILCEPHMFRLLKHWLKAGEPDPFYNPVNDYVILPTAFEMERHKEKGVEVASLKEEWEIISKIPDDQSNTTDKVCTISVSQEGTNHSYSEAHATVTVHPDNQGKQHVQLNALAVSVDAS 586
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g04066 586 Gene3D alpha/beta hydrolase 68 304 IPR029058 -
Pste3g04066 586 PANTHER LECITHIN-CHOLESTEROL ACYLTRANSFERASE-RELATED 11 512 - -
Pste3g04066 586 Coils Coil 151 171 - -
Pste3g04066 586 Pfam Lecithin:cholesterol acyltransferase 77 450 IPR003386 GO:0006629|GO:0008374
Pste3g04066 586 SUPERFAMILY alpha/beta-Hydrolases 29 501 IPR029058 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g04066 Pste-Chr3 35421572 35427833 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g04066 3 35421572 35427833 Pste3g04066 3 35421572 35427833 ECH