Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Phco8g03132 ATGGAGCAACCGCGGCGCTGGCACGATGTGTTCTGGTTAGGGATGTTTGTTATCCATTTGGTTGGTTTGGGTTTGGTTCTTGGGGTTTTAGGCCTCAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACCTACCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGTTTGACGGAGGATTACTGGCCGCTTTACGCTGTGGCAGGAGGCGTTGGAACTGCCCTTGGATGGAGTTGGTTGCTGCTGTTAGGCTCACGCGCTACCCAGATGATGAAGGTGTCTGTGCACATCCTCACCACTTACCTTGCAGTGATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAGCAGTTTTTCTGGGGTGTTGCCTTTGCTATTGGGGCAACCTTGCAGTTCTTGTATGTGATGTCTGTCATAGACAGACTACCATTTACTATGTTGGTTCTGCAAAAGGCTGTCAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAAGTTATGAGAGTAGCATATGCATTTATGCTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATAGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTATAAGCTTATTTTGGACAGGAGCTGTGCTGTGCAACACTGTGCATGTCATAGTGTCTGGGACAGTGGTTCGTGTTACTATCCATGGTGGTAGAGAGGGTGCATCAGTTCCTGCTAACTCCTTAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGATCATTATTCACAGCTGCAATTAGGACACTGCGATGGGAGATAAGAGGAATTCGGTCAAAGATTGGCAACAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTCTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTTCGATTCTTTAACAAGTATGCATATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACAGATCTGCTAGAGATGCATGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCAATTGTGGCCTATGATTGTTCAGGTGCTGTGTTGCTAATGGGGACCATTTTTGGGGGCCTAATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCCTGGATTAAATGGAATGACAGGGCTTTTATGATTGGGTCAACATCTATGCTCATGGGGATGGTATTGGTTGGAATAGCCATGGTTGTGGTAGAAAGTGCTGTTACATCGATATACATATGCTATGCAGAAGATCCCTTATTGATTCAGAGATGGGACACTGAATTTTTCAACCACATGTCTGAGACACTGCACCAACGACTTCAGCATAGAAGTTCACGTGCGAGGGAAGTTTTAACCCACAATCACCTTGATTCACGTATAGAAGAACACTCTTCTATTTCAGTAATCTCATGA 1401 0.4468 MEQPRRWHDVFWLGMFVIHLVGLGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGVGTALGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGATLQFLYVMSVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSIGDGGRWWLLVVLSISLFWTGAVLCNTVHVIVSGTVVRVTIHGGREGASVPANSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEAIVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWIKWNDRAFMIGSTSMLMGMVLVGIAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFNHMSETLHQRLQHRSSRAREVLTHNHLDSRIEEHSSISVIS 466
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Phco8g03132 466 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Phco8g03132 466 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 3 443 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Phco8g03132 Phco-Chr8 45833257 45837784 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Phco8g03132 8 45833257 45837784 Phco8g03132 8 45833257 45837784 ECH