Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mepo7g01315 ATGACAATTACCATGATGGATTCTTCCACTGCCACCAACAATCAGGAGAAGTATAGGAAAAGTGGCAACAACAACATCAGTGAAGTGGTGAACATGGAGCAAAAAAGGCGTTGGCATGATGTCTTCTGGTTAATACTATTTGTGATCCAATTGATTGGTGTGGGTTTTGTCCTTGTGATTCTTGGCGTTAACAGGTTCAAGAAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACATACCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGTTTGACAGAGGATTACTGGCCACTCTATGCTGTCGCTGGCGGCGTTGGTACTGCTCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGCTGTTGGGTTCACGCGCAATCCAGATGATGAAGGTGTCGGTCCATATTCTTACCACTTATCTTGCTGTGATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTCACCAGTTTTTCTGGGGTGTTGCTTTTGCTATTGGAGCAGCTCTGCAGTTTTTGTATATTATATCTGTCATAGATAGACTTCCATTTACAATGTTGGTTCTGCAAAAGGCTGTTAAGATGGTATGGAATCTTCCAGAGGTTATGAGAGTCGCATATGCGTTTATGGCTGTCATGCTCTTATGGATGGCTTTGTGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTAGCTTCAAGCATGGGTGACGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACAGGTGCTGTGCTTTGTAATACAGTACATGTCATAGTGTCTGGGTCACTGGTTCGTGTTAGTATCCATGGTGGTTGCGAGGCTGCATCAGTTCCGGCTAACTCCATAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACGACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGCTCATTATTCACAGCTGCTATTAGGACACTGCGATGGGAGATAAGAGGAATCCGGTCAAAGATAGGGAAGAATGAGTGCTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCAGATTCTTTAACAAGTATGCTTATGTCCAGATTGGTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCTGCTAGAGATGCCTGGGAGTTATTTCAATCAACGGGAGTTGAAGCACTTGTGGCGTATGATTGTTCAGGTGCTGTGCTGTTAATGGGAACCATTTTAGGTGGGCTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATGAAATGGAGTGATAGAGCTTTTATGATTGGATCTACATCTATGCTCATGGGCATGATATTGGTTGGAGTGGCAATGGTTGTGGTGGAAAGTGCAGTGACATCCATATATATTTGTTATGCGGAAGACCCATTATTGATTCAGAGATGGGACCATGAGTTTTTCAACCAGATTTCCGAAACATTGCACCAGCGACTTCAACATAGGAGCTCACGTGCAAGGGAAGTTTTAACCCACGATCACCTTGATTCTCGTATACCAGAACACACCTGA 1476 0.4377 MTITMMDSSTATNNQEKYRKSGNNNISEVVNMEQKRRWHDVFWLILFVIQLIGVGFVLVILGVNRFKKKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGVGTALGWSWLLLLGSRAIQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAHQFFWGVAFAIGAALQFLYIISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMAVMLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGSLVRVSIHGGCEAASVPANSIMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSKIGKNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIGVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTILGGLITGTCSGVWAWMKWSDRAFMIGSTSMLMGMILVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDHEFFNQISETLHQRLQHRSSRAREVLTHDHLDSRIPEHT 491
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mepo7g01315 491 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 18 474 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Mepo7g01315 491 Pfam Plasma-membrane choline transporter 151 445 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mepo7g01315 Mepo-Chr7 20951422 20956887 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Mepo7g01315 7 20951422 20956887 Mepo7g01315 7 20951422 20956887 ECH