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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lja2g1348 ATGGCAACCGTCGTGGATCAAGATCAACAATGGCTGCTCAATTGCTTGTCTGCCACACTCGACCCTAACCAGGAGGTTCGCCGTTTCGCTGAAGCTTCCCTCGATCAAGCCTCTCACCAACCAGGTTTTGGGAGTGCATTATCAAAAGTTGCTGCAAATAAGGAGCTTGCCGTAGGATTGCGCCAGTTAGCTGCAGTCCTTCTTAAGCAATTTGTTAAAAAGCATTGGCAAGAGGGTGAGGACTCTTTTGAACCTCCTGTTGTTTCTAGCGATGAAAAGGAAATCATCCGCAGAATGCTTTTAATGACATTGGATGACCCTCATAGGAAAATTTGTACAGCTATTGGTGTGGCTGTGGCATCCATTGCAATGTATGACTGGCCAGAGTTATGGTCAGATTTGTTACCGTTTCTCCTGAATTTGATTAACAATCAAACCAAATTGAATGGAGTGCATGGAGCTATGAGATGCTTGGTTCTTCTCTCTGCGGACTTGGATGATAAAATGGTTCCAACATTAATACCTGCTTTGTTCCCAAGTTTGCTGACAATTGTATCCTCTCCCCAGATATATGATACATACCTTCGAACCAAGGCCCTTTCAATAGTCTATTCTTGCTCTTCTATGCTTGGGACGATGAGTGGTGTCTATAAGGCAGAAACAAGTTCTCTGATAGTTCCTTTGCTTAAACCATGGATGGAACAATTTTCTTCTATTCTAGAAACTCCAGTTCAATCTGAAAATCCAGATGATTGGAGTATCCGAATGGAGGTTTTGAAGTGCCTGAATCAGTTTGTTCAAAATTTCTCAAGCCTCATTCAAAGTGATTTTGAGGTTATATTGGGCCCATTATGGAATACTTTTGTCTCCTCTTTGAGAGTTTATGAGCAAGCCTCTATTCAAGGAACAGAAGATTCATATGAGGGAAGTTATGATTCTGATGGTTCAGAGAAAAGCCTTGATTCATTTGTTATGCAGCTTTTTGAACTTCTGTTGACTATTGTGGGTAATCCAAGATTGGGAAAGGTTGTTATGGCTAATGTCAAAGACTTGGTTTACTACACAATTGCTTTTCTTCAAATGACGGAACAGCAGATTCACACATGGACTATGGATGCTAACCAGTTCATTGCAGATGAAGAGGATGCCACTTATAGCTGTCGCATTTCTGGTGTGCTTCTACTGGAAGAGGTTGTCAATTCTTTCCATGGTGAAGGACTTCTGGCCATCATAGATGCTGCAAAACAATGGTTCACTGAGTCTCAAATAAGAAAAGTGTCTGGCAGTGCAAGCTGGTGGAGGATAAGAGAAGCCACTCTTTTTGCCTTATCATCACTTTCAGAACAACGGCTTGAGATAGAGGAGTCAGGGTTTGACACAAGTAGCTTGAAGACCCTGGTTGAGCAGATCATCACTGAGGACTCTCTAATTGATCCTTTTGAATACCCCTTTCTATTTGCTCGTATTTTTACTTCGGCTGCTAAATTCTCCTCTTTGTTGAGCCATGGAGTACTAGAGCACTTTCTCAATGCTGCAATGAAGGCTATTACAATGCATACGCCTCCCCCTGTAAAAATAGGTGCCTGCCGGGCACTTTCTCAGCTCCTCCCTGAAGCAAAGGATAAAATTGTCCAACCACAATTATTGGGTTTATTTTCATCACTCACAGAACTTCTTAATCAAGCATCAGATGAAACCTTGCACATGGTACTTGAAACATTGCATGCAGCAGTCATGACAGGTCATGAATCATCAACATTGGTAGAAAGCATTATTTCTCCAGTAATCCTTAATGTATGGGCTTCACATGTTTTGGATCCTTTTATCAGCATTGATGCACTTGAAGTTCTTGAGGCAATCAAAAACATTCCTGGATGTATACATGCATTGGTTTCCAGAGTTTTGCCATATATTGGACCAATTTTAAATAAACCCCAGGAGCAGGCTGATGGTTTGGTAGCTGGATCATTAGATCTGGTAACAATATTACTAAAGAATGCCCCCGGCGATGTAGTCAAAGCAATATATGATGTTTCTTTTAATGCTGTTATCAGAATAATCCTTCAAAGTGATGAGCATAGTGAAATTCAGAATGCTACGGAATGTTTATCCGCTTTTATATCTGGGGGAAGACAAGATATTCTTAATTGGGGATCTGATTCTGAATCCACTATGAGAAGTTTACTTGATGTAGCTTCAAGATTACTGGACCCCAATTTGGAAAGCTCTGGATCTCTTTTTGTAGGCAGTTACATCCTTCAACTTATATTGCATTTACCATCACATATGGCTATACATATACGAGATCTGGTAGCCGCTCTAGTCAGACGTATGCAATCTGCTCAAATTGCTTCCTTGAGAAGCTCCTTGCTAGTTGTCTTTGCCAGATTGGTACACTTGAGTGTTCCTAATGTTGGACAATTTATTGATTTGCTGATCTCAATTCCTGCTGAAGGACATGATAATTCCTTTGCTTATGTAATGTCAGAATGGACTAAGCAGCAAGGTGAGATACAGGGGGCCTATCAAATAAAAGTTACAACAAGCGCCCTGGCCTTGTTGCTAACCAGTAGGCACAATGAACTGGCAAAAATTCATGTCAATGGCCATCTGATTAAGTCTGGTATGGGAATAACCACAAGATCCAAAGCTAAATCAGCTCCCGACCAGTGGGTGATGTTGCCACTTCCTACAAAGATTGTGGGTTTACTGGCCGATTCATTAACTGAAATACAAGAACAAGTTTTGGCTGGTGATGATGAGGATAGTGACTGGGAAGAAGTTCAAACAGATGGCATTGAAAATGATAGAGAGTTTCTTTATTCAGTATCTACATCAACTTCGGGAAAACCCACATATGAACATCTTGAAGCAATGGCCGAAGTATTTAACAAGGATCAAGATGATCAGTATGAAGATGACCTGTTAAGTATTGCCGATCCTCTTAACCAGATAAATCTGGTAAATTACCTTGTGGATTTCTTTGTTAACTTTTCACAGTCCGACAGACAGCTCTTAGATCACATTTGCAAGAGCTTGACCGAGTCTCAACGAAATGCGATTAAACTGGTGCTACAGAGATGA 3084 0.4089 MATVVDQDQQWLLNCLSATLDPNQEVRRFAEASLDQASHQPGFGSALSKVAANKELAVGLRQLAAVLLKQFVKKHWQEGEDSFEPPVVSSDEKEIIRRMLLMTLDDPHRKICTAIGVAVASIAMYDWPELWSDLLPFLLNLINNQTKLNGVHGAMRCLVLLSADLDDKMVPTLIPALFPSLLTIVSSPQIYDTYLRTKALSIVYSCSSMLGTMSGVYKAETSSLIVPLLKPWMEQFSSILETPVQSENPDDWSIRMEVLKCLNQFVQNFSSLIQSDFEVILGPLWNTFVSSLRVYEQASIQGTEDSYEGSYDSDGSEKSLDSFVMQLFELLLTIVGNPRLGKVVMANVKDLVYYTIAFLQMTEQQIHTWTMDANQFIADEEDATYSCRISGVLLLEEVVNSFHGEGLLAIIDAAKQWFTESQIRKVSGSASWWRIREATLFALSSLSEQRLEIEESGFDTSSLKTLVEQIITEDSLIDPFEYPFLFARIFTSAAKFSSLLSHGVLEHFLNAAMKAITMHTPPPVKIGACRALSQLLPEAKDKIVQPQLLGLFSSLTELLNQASDETLHMVLETLHAAVMTGHESSTLVESIISPVILNVWASHVLDPFISIDALEVLEAIKNIPGCIHALVSRVLPYIGPILNKPQEQADGLVAGSLDLVTILLKNAPGDVVKAIYDVSFNAVIRIILQSDEHSEIQNATECLSAFISGGRQDILNWGSDSESTMRSLLDVASRLLDPNLESSGSLFVGSYILQLILHLPSHMAIHIRDLVAALVRRMQSAQIASLRSSLLVVFARLVHLSVPNVGQFIDLLISIPAEGHDNSFAYVMSEWTKQQGEIQGAYQIKVTTSALALLLTSRHNELAKIHVNGHLIKSGMGITTRSKAKSAPDQWVMLPLPTKIVGLLADSLTEIQEQVLAGDDEDSDWEEVQTDGIENDREFLYSVSTSTSGKPTYEHLEAMAEVFNKDQDDQYEDDLLSIADPLNQINLVNYLVDFFVNFSQSDRQLLDHICKSLTESQRNAIKLVLQR* 1028
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lja2g1348 1027 Pfam Importin-beta N-terminal domain 30 105 IPR001494 GO:0006886|GO:0031267
Lja2g1348 1027 PANTHER IMPORTIN-9 6 1026 - -
Lja2g1348 1027 Gene3D - 7 1020 IPR011989 -
Lja2g1348 1027 SMART IBN_N_2 30 106 IPR001494 GO:0006886|GO:0031267
Lja2g1348 1027 PANTHER IMPORTIN-7, 8, 11 6 1026 - -
Lja2g1348 1027 ProSiteProfiles Importin-beta N-terminal domain profile. 30 106 IPR001494 GO:0006886|GO:0031267
Lja2g1348 1027 SUPERFAMILY ARM repeat 8 1021 IPR016024 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lja2g1348 Lja-Chr2 12876559 12899247 Dispersed
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lja2g1348 2 12876559 12899247 Lja2g1348 2 12876559 12899247 ECH