Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Gma01g00825 ATGGAGCAACAACGGCGTTGGCACGACGTGTTCTGGTTAGGGATATTTGTGATCCATTTGGTTGGTATGGGTTTGGTTCTTGGGGTTTTAGGCCTCAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACCTACCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGTTTGACGGAGGATTACTGGCCGCTTTATGCAGTGGCCGGTGGCCTAGGAACCGCCCTTGGATGGAGTTGGTTGCTGCTGTTAGGCTCGCGCGCCACCCAGATGATGAAGGTGTCTGTGCACATACTCACCACTTACCTTGCTGTGATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCAGAGCAGTTTTTCTGGGGTGTTGCCTTTGCTATTGGGGCAGCCCTTCAGTTCTTGTATGTGATTTCTGTCATAGAAAGACTTCCATTTACAATGTTGGTTCTGCAAAAGGCTGTCAAGATGGTATGGAATATTCCTGAAGTTATGAGAGTAGCATATGCATTTATGCTTGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGACGGTGGACGCTGGTGGCTTCTAGTGGTCCTCTCTATAAGCTTATTTTGGACAGGTGCTGTACTCTGCAACACTGTGCATGTTATAGTGTCTGGGACAGTGGTTCTTGTTAGTATCCATGGTGGTAGAGAGGCTGTATCAATTCCCGCTAACTCCTTTATGAAATGTCTACAATATGCTTTAACGACTTCTTTTGGGAGCATTTGTTATGGTTCATTATTCACAGCTGCAATTAGGACACTGCGATGGGAGATAAGAGGAATCCGATCCAGGATAGGCAATAATGAATGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCGTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTCTTTAACAAGTATGCTTATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCCGCTAGAGATGCGTGGGAGCTATTCCAGTCAACTGGAGTAGAAACACTTGTGGCCTATGATTGTTCGGGTGCTGTGCTGCTAATGGGAACCATTTTTGGTGGGCTAATAACCGGGACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATTAAATGGAATGATAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACGTCTATGCTCATGGGAATGATCTTGGTTGGAGTTGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATATGTTATGCAGAAGATCCCTTATTGATTCAGAGGTGGGACACTGAGTTTTTCAACCAGATGTCTGAGACACTGCACCAACGACTTCAACATAGGAGTTCACGTGGTGCAAGGGAAGTTTTAACCCACGATCAGCTTGATTCACACGCCTCTATTTGA 1380 0.4536 MEQQRRWHDVFWLGIFVIHLVGMGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGLGTALGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIERLPFTMLVLQKAVKMVWNIPEVMRVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSISLFWTGAVLCNTVHVIVSGTVVLVSIHGGREAVSIPANSFMKCLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSRIGNNECLLCCVDFVFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVETLVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWIKWNDRAFMIGSTSMLMGMILVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFNQMSETLHQRLQHRSSRGAREVLTHDQLDSHASI 459
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Gma01g00825 459 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Gma01g00825 459 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 2 454 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Gma01g00825 459 PANTHER PLASMA-MEMBRANE CHOLINE TRANSPORTER FAMILY PROTEIN 2 454 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Gma01g00825 Gma-Chr1 25836772 25846939 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Gma01g00825 01 25836772 25846939 Gma01g00825 01 25836772 25846939 ECH