Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cca06g00381 ATGGAGCAACCACGGCGTTGGCACGACGTGTTCTGGTTAGGGATATTTGTGATCCATTTGGTTGGTATGGGATTGGTTCTTGGGGTTTTAGGCCTCAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACCTATCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGTTTGACGGAGGATTATTGGCCGCTTTACGCGGTGGCCGGAGGCGTTGGAACCTCCCTTGGATGGAGTTGGTTGCTGTTGTTAGGCTCACGCGCCACCCAGATGATGAAGGTGTCTGTGCACATCCTCACCACTTACCTTGCTGTCATCAGTGTTTTGTGTTTATGGGCTGAGCAGTTTTTCTGGGGTGTTGCCTTTGCTATTGGGGCAGCCCTGCAGTTCCTGTATGTGATTTCTGTCATAGACAGACTTCCCTTTACAATGTTGGTTCTACAAAAAGCTGTCAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATATGCATTTATGCTTGTTGTGCTTTTATGGCTGGCCTTGTGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATCGGTGACAGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTCTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACAGGTGCTGTGATTTGCAACACTGTGCATGTCATAGTGTCTGGGACAGTTGTTCGTGTTACTATCCATGGTGGTAGAGAGGCTGGGTCAGTTCCTGCTAACAACTTAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGTTCATTATTCACAGCTGCAATTAGGACTCTGAGATGGGAGATAAGAGGAATCCGGTCAAAGATAGGCAATAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTCTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTCTTTAACAAGTATGCTTATGTTCAGATTGCTATTTATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCTGCTAGAGATGCATGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCACTTGTGGCCCATGATTGTTCGGGTGCTGTACTGCTAATGGGTACCATTTTTGGTGGGCTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATTAAATGGAGGGACAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACATCTATGCTCATGGGGATGATATTGGTTGGCGTGGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATATGCTATGCAGAAGATCCCTTACTGATTCAGAGCTGGGACACTGAGTTTTTCAACCAGATGTCTGAGACACTGCATCAACGACTTCAACATAGAAGTTCACGTGCAAGGGAAGTTTTAACCCAAAATCAGCTTGATTCACGTATAGGAGAACACACATCTATTTGA 1389 0.4528 MEQPRRWHDVFWLGIFVIHLVGMGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPLYAVAGGVGTSLGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCLWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMLVVLLWLALWSFGAAGVVASSIGDSGRWWLLVVLSVSLFWTGAVICNTVHVIVSGTVVRVTIHGGREAGSVPANNLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAIYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAHDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWIKWRDRAFMIGSTSMLMGMILVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQSWDTEFFNQMSETLHQRLQHRSSRAREVLTQNQLDSRIGEHTSI 462
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cca06g00381 462 PANTHER PLASMA-MEMBRANE CHOLINE TRANSPORTER FAMILY PROTEIN 2 453 - -
Cca06g00381 462 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Cca06g00381 462 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 2 453 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Cca06g00381 Cca-Chr6 11848593 11854604 Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Cca06g00381 06 11848593 11854604 Cca06g00381 06 11848593 11854604 ECH