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4748
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cca06g00061 4748 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 4676 4747 IPR013083 -
Cca06g00061 4748 Gene3D - 22 174 IPR036890 -
Cca06g00061 4748 PANTHER - 2493 2578 - -
Cca06g00061 4748 PANTHER - 2606 4748 - -
Cca06g00061 4748 PANTHER - 5 2483 - -
Cca06g00061 4748 Coils Coil 4658 4699 - -
Cca06g00061 4748 Pfam Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) 4702 4741 - -
Cca06g00061 4748 ProSiteProfiles Zinc finger RING-type profile. 4702 4736 IPR001841 -
Cca06g00061 4748 SMART ring_2 4702 4735 IPR001841 -
Cca06g00061 4748 SUPERFAMILY ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase 31 135 IPR036890 -
Cca06g00061 4748 MobiDBLite consensus disorder prediction 4596 4627 - -
Cca06g00061 4748 SUPERFAMILY RING/U-box 4701 4742 - -
Cca06g00061 4748 SUPERFAMILY ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase 1383 1501 IPR036890 -
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Cca06g00061 4658 4746 C3H Transcription Factor Family AT1G73950 31.111 1.73e-08 58.5
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Cca06g00061 06 1314116 1349395 Cca06g00061 06 1314116 1349395 ECH