Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cca05g00206 ATGGGTTCTAGTAAGCAGTCTGCTGGTATTCTTGATACGCTGAAAATGGAGAGGGTTAGAACTATTCTAACCCACACTTATCCTTACCCTCATGAACATTCCCGCCATGCTGTAATTGCTGTTGTTGTGGGTTGCCTCTTTTTCATCTCATCTGACAATATACACACTCTTGTAGAAAAATTAGACAACAATGTTAAATGGTGGTCTATGTATGCCTGTTTGTTTGGGTTCTTTTATTTCTTCTCGTCACCATTTATAGGCAAGACTTTCAAACCCAGCTATTCAAATTTCAGTAGATGGTACATAGCTTGGATTTTAGTGGCAGCTGTGTATCATCTTCCTAGCTTTCAGTCAATGGGAGTAGATATGAGGATGAATCTATCTTTGTTTTTGACAATATATGTCTCTTCAATCTTGTTTCTTCTTGTCTTTCACGTTATATTTCTTGGCCTCTGGTACATCGGCCTTGTTTCTCGTGTGGCTGGAAAGAGACCAGAGATCTTGACCATTCTTCAAAATTGTGCAGTACTTAGCGTGGCGTGCTGTGTATTTTATAGTCATTGTGGTAATCGTGCCATGTTAAGAGAGAGACCACTTGACCGAAGAAATTCTAACTGGTTTTCTTTCTGGAAGAAAGAGGAGAGGAACACATGGCTGGCAAAGTTTCTTCGGATGAATGAATTGAAAGACCAGGTTTGCTCATCTTGGTTTGCTCCAGTTGGATCTGCAAGTGATTATCCTCTCTTGTCGAAGTGGGTTATTTATGGCGAGATTGCTTGCAATGGATCATGTCCTGGTTCATCAGATGAAATTTCTCCCATCTACTCACTTTGGGCTACATTTATTGGGCTTTACATAGCAAATTATGTGGTGGAAAGGTCCACAGGGTGGGCTCTCACTCATCCATTATCTGTTAAAGAATATGAGAAGTTGAAGAAGAAGCAAATGAGGCCTGATTTTTTAGACATGGTTCCTTGGTACTCTGGAACATCTGCTGATTTATTCAAAACAGTTTTTGACCTCATTGTATCAGTGACGGTCTTTGTTGGGCGTTTTGACATGCGTATGATGCAGGCAGCAATGAATAGGGTTAGTGATGGAAATCAACATGTTGACCTTCTATATGATCATTTTAGTGAGAAGGATGATTTTTGGTTTGACTTTATGGCGGATACTGGTGATGGTGGGAACTCATCTTATGCTGTTGCACGGCTACTTGCTAAGCCTTTCATTCGGACACTGAAAGATGATTCTGAGCTTACCTTACCACGTGGAGACTTGCTACTTATTGGGGGTGATCTTGCGTATCCGAATCCATCAGCATTCACATATGAAAGGCGTCTTTTTGTTCCTTTTGAATATGCTCTTCAACCCCCTCCTTGGTATAAAGCAGAGCAGATAGCTGTGAAGAAGCCGGAGGTGCCTTTTGGGGCTCAATTAAAACAGTATAATGGACCTCAGTGTTTTGTTATTCCTGGAAACCATGACTGGTTTGATGGGCTCCAGACCTTTATGAGGTATATATGTCATAGAAGTTGGTTAGGTGGATGGCTCATGCCCCAGAAGAAGAGTTATTTTGCTTTGCAACTCCCTAAACGGTGGTGGGTGTTTGGGTTTGATCTGGCTCTTCATGGTGATATTGATGTGTACCAATTCAAGTTCTTTACAGAACTGATAATGGAGAAAGTTCAAGAGGATGACTCTGTGATCATTATAACTCATGAACCTAATTGGCTCACGGACTGGTATTGGAATGATGTTACTGGAAAGAATATTTCACACCTGATTTGTGATTATTTAAAAGGAAGATGTAAGCTTCGAATGGCTGGGGACTTGCATCATTACATGCGTCATTCTCATGTAAAGTCAGATGGACCTGTACATGTTCACCATCTTCTTGTTAATGGTTGTGGTGGTGCATTTCTACATCCTACCCATGTTTTCAGTAAATTTAACAAACTTCTTGGAGTTTCCTATGAATGCAAAGCCGCATATCCTTCCTTTGAAGATTCAAGCAGGATTGCATTGGGAAATATCCTAAAATTTCGAAAGAAGAACTGGCAATTTGATTTTATTGGTGGGATTATATATTTTCTATTAGTCTTTTCAATGTTTCCACAATGTGAGCTGAATCACATCCTCCAAGATGATACATTTTCTGGTCACATAAGGAGTTTCCTTGGTACTGTGTGGAATGGATTTATATATATTCTGCAGCACTCTTGTGTGTCACTAGTGGGATCTATACTATTACTAATTGCTGCATATTCTTTTGTTCCGCCCAAATTGTCACGGAAGAAACGAGCAATAATTGGAGTTCTTCATGTTTCTGCTCACCTTGCTGCAGCACTGATTCTTATGTTGCTTCTTGAAGTAGGCATTGAAATATGCATCCAACACAATTTGCTGGCAACTTCAGGGTATCACACTTTATATCAGTGGTATAGATCAGTTGAAAGTGAGCACTTTCCCGATCCAACTGGACTCAGAGCTCGTATTGAACAATGGACATTTGGACTTTATCCAGCATGTATCAAGTATTTAATGTCTGCTTTTGATGTGCCAGAGGTCATGGCAGTCTCTCGGAGCAATATTTGCAAGAATGGATTAGAGTCAGTTTCCCGAGGGGGTGCTATAATATATTATGCTTCTGTCTTCCTTTATTTTTGGGTCTTCTCTACTCCTGTTGTTTCCTTAGTGTTTGGGAGCTACTTATACATTTGCATCAACTGGCTTCACTTACACTTCGATGAAGCTTTTTCATCTCTTCGAATAGCTAATTACAAATCATTCACACGCTTTCACATCAATTCTGACGGTGATCTTGAAGTTTTTACTCTGGCTGTTGATAAGGTTCCAAAGGAGTGGAAGCTTGATCCTGATTGGGACGGAGAGGCGAAACATCCACAAGAGTTGGGTCATTTGAGAGAATTTCCCAGTAAATGGAGGGCAGCCACTCCCCACCAGGATCCGGTACATACGGTCAAAATTGTTGATCATTTCGTTATTGGACGGACAGATAACAATGACTCTGATACTGCGCCAGTTCAATGA 3054 0.4057 MGSSKQSAGILDTLKMERVRTILTHTYPYPHEHSRHAVIAVVVGCLFFISSDNIHTLVEKLDNNVKWWSMYACLFGFFYFFSSPFIGKTFKPSYSNFSRWYIAWILVAAVYHLPSFQSMGVDMRMNLSLFLTIYVSSILFLLVFHVIFLGLWYIGLVSRVAGKRPEILTILQNCAVLSVACCVFYSHCGNRAMLRERPLDRRNSNWFSFWKKEERNTWLAKFLRMNELKDQVCSSWFAPVGSASDYPLLSKWVIYGEIACNGSCPGSSDEISPIYSLWATFIGLYIANYVVERSTGWALTHPLSVKEYEKLKKKQMRPDFLDMVPWYSGTSADLFKTVFDLIVSVTVFVGRFDMRMMQAAMNRVSDGNQHVDLLYDHFSEKDDFWFDFMADTGDGGNSSYAVARLLAKPFIRTLKDDSELTLPRGDLLLIGGDLAYPNPSAFTYERRLFVPFEYALQPPPWYKAEQIAVKKPEVPFGAQLKQYNGPQCFVIPGNHDWFDGLQTFMRYICHRSWLGGWLMPQKKSYFALQLPKRWWVFGFDLALHGDIDVYQFKFFTELIMEKVQEDDSVIIITHEPNWLTDWYWNDVTGKNISHLICDYLKGRCKLRMAGDLHHYMRHSHVKSDGPVHVHHLLVNGCGGAFLHPTHVFSKFNKLLGVSYECKAAYPSFEDSSRIALGNILKFRKKNWQFDFIGGIIYFLLVFSMFPQCELNHILQDDTFSGHIRSFLGTVWNGFIYILQHSCVSLVGSILLLIAAYSFVPPKLSRKKRAIIGVLHVSAHLAAALILMLLLEVGIEICIQHNLLATSGYHTLYQWYRSVESEHFPDPTGLRARIEQWTFGLYPACIKYLMSAFDVPEVMAVSRSNICKNGLESVSRGGAIIYYASVFLYFWVFSTPVVSLVFGSYLYICINWLHLHFDEAFSSLRIANYKSFTRFHINSDGDLEVFTLAVDKVPKEWKLDPDWDGEAKHPQELGHLREFPSKWRAATPHQDPVHTVKIVDHFVIGRTDNNDSDTAPVQ 1017
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cca05g00206 1017 Pfam Calcineurin-like phosphoesterase 385 590 IPR004843 GO:0016787
Cca05g00206 1017 Gene3D - 384 693 IPR029052 -
Cca05g00206 1017 PANTHER - 2 1013 - -
Cca05g00206 1017 SUPERFAMILY Metallo-dependent phosphatases 382 648 IPR029052 -
Cca05g00206 1017 PANTHER CALCINEURIN-LIKE METALLO-PHOSPHOESTERASE SUPERFAMILY PROTEIN 2 1013 - -
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Cca05g00206 05 4405191 4416407 Cca05g00206 05 4405191 4416407 ECH