Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bach3g02232 CGCGGAGGTTATCTGAATACGTTCGTCGGTCGTTGTTTTCTCCTGGAACCGAGGCTGCTGCAGGTCAGAGCAATAATTATTCTTCTTTGCGCTCTGGTCCTACAGCTTCATCTGAAGCTAGGATTTTCGCAGCTGATGCTAGTAGCCAGGGACACAATCAGTCACATCCGAGATCATCTTCGTGGATGGAGAGGCAAGGTGATGCTGAATTTGGAATACCCTATTCATTGCGTTCTTTGGCTGTTACTGGTGAAGGAAGCAGCAGAATTGTGTCTGAGCTTCGCAATGTTTTGGGCCTCATGCGTAGGGGTGGGAGCCTGCGATTTGAGGATGTCATGATCCTTGACCAGTCAGTATTTTCTGGAATGGCTGATATTCACGATAGACACAGGGATATGAGACTTGATGTTGATAACATGTCTTACGAGGAGTTACTGGCTCTTGAAGAGCGCATTGGAAATGTGAGTACCGGCTTGAGCGAGGAAACGATATTGAAACTTTTGAAACAGAAGAAGTATTCAGTTGAAACTGGAGCCCAGCTTGCGGCAGAACCCTGCTGTATTTGCCAGGAAGAGTATAATGATGGAGACGATATGGGAACGCTTGATTGCGGGCATGATTACCATGCCGACTGTGTTAAACAGTGGTTAAAGCAAAAGAATCTGTGTCCCATTTGCAAGACAACGGGCTTGGCAACATGAGATGTGCCCTTTGATTCTCAGGCAGTTAGTTTGATCCATCTCGGAAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGAAGGGAATTAGCACAATTACCCTGGAAGATTTGGTTAATTGATGCAGAATTCTTTGGTGCTTTGCTGCCTTGTTCCTATTTGTTTCCTTAAATACATGACTGACAAAGTTCTATCTCTCTCCCTGCCCTCCTCTCAATTTCTTTTCATTTTGTTTATTTATATAAGCCAATGATGTCGTGGTCGAAGTAACAGATAATTGTGGATGAAGGAAGCATTATTGGCCTTAACTCAGTAGTTGACAATGACAAGGCTTGGTTTTTGCTATCTTTATAAAAAAAAATATATACATTGCCGAGAATGTGTCAAGTGGTGCTGCGATTTCGCTTCATACTGATTTATGCATGAAAGGAAACTAGTGTATTATGGTTGGAATGAATTAGCATAACACATTTGATATAATTCTTCCATCCGTTTTGAAGTAGCTTAAAAGTATGTTTGGATTAAGAAAAAGCTGTCCACATATTTTAATGTATTTAAACATTTTCTCTGCGGAAACGCTTTCATCAATGTTTTCGATTATGAACAATTAGTTATTTAATATTATTTTAAATTGATGATAAAAGTGATCTTAAACACAATTTAAAAGAAAAATAATTATAAAAATGTTTCTGAGTTTAGATTTTCAAGTGAAAAACATTTTTAATACTTAAGTTTGTTTTATTAACGATTATATAATAAATAATTTTTTAATTGAATAATAATAATAATAATAATATTGCTTCATGTAGCTGGACTATGCAAGCATGGTTGCTCTGCATTTAACTGCAGCTGCCTTGCGCAAAAGATAGGAAGAGAGTGAAAAAGATAATTAGGAGATAAAATGGTTTATTTCATTCTCTATTATAAACTTGTAATCTGTTTTAAATTTGTTTTATGATTATAATATAATATTATTTTATTACTATTTTTACTAATCACAATATTACTATACGAGAAGGTTTGAGACGGTGTGTAAAAGAAAAGATTTTGTCCCTTGCACCCCACCCCTTCTGGTTATATCTCACTCTAAAGAGTCTATGGTCTTGTATAGATAACATGGCAGACACAGAGAGCGTGTTTTCTTTTCTAACATACCACGCTACGAAATCCAAAAGTAGCATCGGGAATTGTACATTTTGGTTCCGTAAAATAATAAATTGTTGTTGCTGGCTGTTTGGTTGGATAAGACGATGAAGATTATTATGACGTCTTTGACTTTTGCTTTTTTTGTTTTTCTTATTTATTTATTTTTCCTTCAAATTCAGAATTACCACCCATGTGTTTGAAAATTGAAAAGAAAAGCCTCAGTCAAACAACTCAACTGGATCAAAATTCAATCTCAATCTCACCCTGCAATCACTCCATTTTAGTATGAAAATATACGGGAACGAAGATTAAACTGACTAGGGGAACCGACGTAACTGAGGCGGGAGAGTAATCAAATTTTGATAACCACCCTAAACGACCTGGTACCAAGATTATAAAACCTCCATCATCAACGTTAAACCCTCTTATAAATGCGAGACATAACCCATGGTAGAGACAGTGAGAATCCTAGAGAAGAAAAAGAAAAGTAGGGAGAAATTTAAGGTGTAAAGATGAGCGAAGGAATTTCTGTGGAGGTTGGAAATGCAAGCAACAAAATCTTTCTAAGCTGTTGATTGCTCAACTATTAACTATACAATTTCCCTCTCTTGCATTCCAGTTTTCTGGTTTTCTCTGATCTATTTAATGTTCATGGCTAATATGTATGGAACCCATCCATCTTTAGTCCCGGGACTTCTTCTGATTACTGCAGAGGTGCTATCTTGTTGAACCAACTCATCCACTACAACTCATAATAAAAAGGCTGTAATTGGTTCATCCGTCTACTTATTCTAGAGGAACAATTTTAGTTCAAGAAAAACAACTCAAGTTCAAGAGGAAGTAAACTTACTTTATTTGGGTTCAATAAAGACAATTTGAGTGTTTTAGGCCATTAACAAGAAGAAAACACAGTAAATTAATAATATAACAAAAAAAAGTTATAAGTAAAAAGGTGGGAAGGAATTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTTAAATGAAGTCATCTCCAATAACATCTTTTAATTTTTTTTTTTAAAGATCATTATTTTAAATTGCGTCTTTACTTGTATGCTAATCAAAATAAAATTATTTTAGATTGAGAAATAATTTTAAAATAAACTGTTTTAATAAATAATTTAAATTTTATATTTTATTTTTTGAGATTTGATCCATGCATCATCCCCCAGCCTTCTTTGTTCTTCGTTTGTGTCCATTTTAATGCTTACGTAACCGACATGAGGGTGCCTTTATATTATCTTGTTTACAAATCAACTATAATCTCGTTATCCCAGAGAAGTATCCTTTGGAAACTTTTTATAAAAGATTGAATTATCATTTTCTATAAATATTTTGTTCAATTTAATGAAAAAAAAATGCTTTAATCACCCAAAAAAGAGAGAAAATAAATCAGTTAACTATGGAATTATATGATATTATGATGTTCTGGGAAGGTTTGTTAAAGAAATTAAATATATAAAGCATCGAAGTAAGCTTGGTTCTGCATAATGATTAATGGCTTCAGATAAAAAAAAAAAAACAATGAAAATAAAATACTTCTTTTGTTACTAATTTTAGGGACCATCCTTTTATTCTGCTTTAATATGTCTGTTTGTCTTACTTTCCTTTTGAACGTGAAAGATTAAATATTTTTTAAAAAAATAAAAATTTGAGAACAAAAGTTTAACCGTTGTTATTGGTAAGTACAGTATTTTCTCATAGAAAATGAATTCTTGGTTCTTTTGATTCTTTGAACATTCACGTCCATTTTCAAGGAGAAAATTCAGTTTTTCTTCTCTTGAAGAATTAATTTATTTCCATTAACTCCTCTCACTGAGCATAGAGTAATATACATTCTTTTGACAGATTGTTGTACTTAACAGTCAAGTCTCAAGAGTAGAGTAAACATTTTTCAACCAATAATGACTGCTATAATAGGGTGTTTTCATTTGCATTAACAACATCTCTTTACAGCCATTGTTATTGCTAAAATGTGGGTATTAATGCTTCAAAGCTGATTAAAAAAAAAAAAAAAGTATGGTGAAGGTGAATTATTTGACACGAGTACACTTTCGTTAATGGGTGTGTGTGAGCTGTTCCCATGTGTATAGGTTTCATATGTGTGACTTTGATATCTACCGGTTGGTCCAACATCTTGATGGCCAGTTACTTTCAGAGGAAAAGTCATTTGTTATGAATAAAAATGTTTCTTTGATTGATCAGCTTGCTTCAATTTGAGCCAAGCATCTTGTGGTAGCAATAGATTATGGTAGATAAGTAGCAATCTTGTTCTCTCCCTAAGATTTTAACCATCCTATTTTTTTCCTCTATATATAATTACAAGCTCCAAACAACTACCTTCCCTAGTGTCTCTTTCGTATAAGCTCAAGACATAAAATAAGCACATCCAATGGTAGTGCAAGACTGCGAGTGGCCCAGTTGTGCATCTCAAAGTTTTTCTTCTTCCTGACCCGTAGGCCCTTAACCCTCTTCGTGTTAGGTGTCTTGGCTCATGTTTACTACCATATTTCATACCATACCCTACAATCCCCGCTGTCCTGGCAAAAGCTCCTGCACACCTTCTACCCTATGCACCTAACTGCACAAGCAGAATATTAAGCTTTTTCTCTTTATATTGAACTTCTCCAATGATTTTTATTTGATTTTCAAAAGGGTATATTGCGCAATAAATAATCCAAGGGTAGGGATCCAAATGGACAATTTGGGAGTTCTAATATATATATTTAGTGGAAAAAGATGAAAAGCAAAGCAAACCCATTTGGAATTGGAAGGTTTTGGATGCAAATAAAAAAGTGGGAGAAAGGCAGCTCAAGGATGATCAAATACCAGAATTGGTACATGAGATTGAGCGGTAACTCTAACAAACACCACTTGAACAAGATCAGAATCCGACAGTTGAACCTCTTCCCACCTTCTCTATTCATAGTGAAACCGTAAAAGACATAAATAAATGAAAGAGAAAGAAAAGAGGTGGTGTGCTGGTCGAAGCTGCCGAGGTACTGGGGGACTTTTAGGTCCACGTATTCACACATCTTTAAAGCAAAGTAAAATCACGTCTAAATTGGTTGCCTACCAAGACCCAAGACCCAAGACCCAAGACCCAAAAGCCACAAGCCCCTCCCCTGTCATCATCCGCACCAGGTAGGCACAGACATACATTTAACGCTACTATTCTGTTAAGTTCCACCCAAAATTGTGTCAGCAAAAAATTTAGCCACCCTGTGTCTTGTTTCATCTTGGGTCTTTTTTTGTTCACTGCTCAGGCAAGAGATTGTGGTAAAGGAAAAAAAAAAAAAGGCCAATCTTCAAAATTCAAACAAGCAAGAATCCAGATTTTTTGCACATAACAAGCAAGAAAGAAAATTGCAAGTCATACAAGTGTGGGCCTGGATATTATAACTAAAGCCACGTGAATAATCATAAATTCCTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGGTTCCAAACCAAAACAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAGAGAAGGGGGAAGAGGTGCATGTGAATGTGATGGTAAAAGAGAAAAGAGATGTGGTGCTTGGCGTGAAGATGGCAACAGAAGCCAAAGGGGGAGTGGGGCTGTGTTCGGCGCGCGCATTGGGAGCCGGGTCTTTAATAGTGTCATTTATTATCATTATTATTTGTCGTTATGATGATACCGTAATGGCAACCTCTATTTATTTGACTGTAGACAGAAAGAGAGAGAGGGGTTGGACAGGGAATAGGGGGATGGATGGATTAGAGAGCAAATAAGAAATGAAGACCACAGCCTCGGCCTCGCCCATTTGGTAAGCGGCCAAACAGGGCAGCCTTTGGCATCTTCTACCATTCCCTAACCTTATTATTCTATATGCTAATTACTATTCGTTAGCCAAAGAAATTTACTTGATGCTCTTTGTGCTACTAAATGCTGTTATTAGTGTGTATTATTAATTAATTAATCATTAAATATTATTCATTTCTTTGTTGGAAACTGCATACATTCCTCCAAGGCATGGCTGACTTTTACTCCCTCTCTCTATTGGGCTGTTTCGTAAATTAAAGATTACTGTCCTCTTTTAGCTCTCTTTACATATTGTTGATTTCACCATCTCATTTTTTATATCCTCCAACACCCAAGAGCCTCCCTTCCCTTCCATTTTTTCATTCGGTATTTTTGCCTCTTTGTTTCCCAGAAAGCAAGGGGAACAAAGGAATGAAATAAAATCGGCCGCAGCCAACATGCTCCGTCTCACCATTTTTCATTGTTTCAGTTACTCATCCGATTATTTTCTGATAGATCGGTTTTTTTCTAAAATAATTGTTTTCATATGGTAAGTTTCGCGGACTTATCCTAGTTTGTTTTCGATTCTCTTTTGCTCTGATCAGTCCGCGAATCGGCTAGGTTTCCTAGAATATCAAGTTTGATTCCTTGGCCTGTTTTCATTTTCACGGGTTAATCAGACTATTTAATATTCTAATTATTTAGGTCTTGTTATGTAGCAATTGGACTTCTTACATCTTATTCTTAGGAAGTTTTATGCTAAACTATGTTGTTTTCTTGATAGGTCTTCCAGTCACTTGTTGGTAATTGGAATCTTTTGATATAAGCTGTGCTTGAATTGTTTAAACCTAATTTGATGTTATCAATCACCGAGATGATCTTGGGAAAAAATTTCAGTTACTTTTTCCTTTTGTTGCGTATATTCTGCCAAAGGAGTTGACTTTGTTGTATTTATGAGATATACTGTTTTCTATGGTGGTGCTCAATTCTCCGAGACTCTAATCGATTGGCATTGCCGTAATAGTGGGCATGTGATATCGAATATGTGTGCTGGATAGTTCTTTAGTTGATGAAAGAGTTGGAGGATTGTTGGTGGTTGTGTTCTCTGGAAATTCATTTCTATTCTATTTCCTTTGTTCAAGGGTCTAGAAGCATGCTCAACCCAACTTTTAGTGCCACATTGACTGTGTTAATGTTAAAAGACAATTATTTTGTTTCATTGTTGTAATACTAGAGTGTGTGTTTTGACAATGTACTAAACCAGATACAGATTACATATCATGTTAGTAAATACTCTTACTCTTGGATGCTTTGGGCTACCTGTGGGTTTTTGAGCTTTCAACATCATATATGGAGTTAATTGTGCTTGTTGCATTCATATTATCGTCATTACATTCACTTCCAATTCCTATGTTCGAACAGCACCACTGTGTAATTCACTATAAAGTTGTATAGATGAATTGGAACAATACTAAGAAGCATTACATAGAGTTAGCATCTTAGAACTGTAAGCCAGTTTGGTAGATGTCAAATCTCATTGGTTATAAGTGTTTTACGTAGGTTTTATTTGTATAGGAAGGTTAATGGGCAGTCAATCATTACCATCTTATGTAAAATATGGTGGATTATTAATGATATTGAGTTCCATTGGATACATGCAGTCTCAATATCTAATGATCATTTTCTGGTTTTGTTGTAGAGATCTGGAAAAATGTTTCATGAGATGTGGCATTGTTGAGGAATTTCTTCCAAAACCTTCCTGGTATTGAGGGTACTTATAGAGGTCCCCCAATGCAAGGGCAGAGGGGTGCACTTGGTTCTTTGCCTGAAACCTTACAATTCGACTGTGGATCTACATCAAGTAATGCCACAGTGGATCAGCAGATTTGCTGGAATAATATGAGGAGTCCTGCAGAAAACCAAATACCTGAATATATACTTGCGCCTGGTGATATGAACGCATCATATTTGAATTCTATAAACCATGAATGGCAGAACTTGAGTGGATGGAGCTTAGGTGAGCCAAGTTCTATTAATACGCAGAATGAGATTAACCATAATGAGCAGAAAAGAGAACTTGGATGGTCTTCTTCAGTAAGTAATGGTACTGTTCCTGGTCCAAGATTGGAAGAAAGGCGCTTTGAATCAACTAATATTCTTCCATCGGACAGTGCCAATGCTAGGCCAATCTACAGGCCGGGTTCCCATTCACACCCTGTATCACAGAATTTTAACTTAAATGCAGGTGTGGTGGACAATGACAATGATAGTGATTCTATTCAACATACAGAGCATCCTAGCATACACAAGTCTAGTGGGTCTGTAAATGAGCGTCCTCCGCCTCCTGTTGGTTCTGGTCCTTCTCTGCTTCCTTCTGGAAGTAACGGCTTCTTGGTAGAAGATAATGATGGTAGGCCAGGTTGTTCTTTGGACACTCGCCGTGTATCGTGCAAAAGAAAGGCTGTTGAAGGGAGTATTGGACAATCTTCAGACGGCGGAAGTTCTAGCTACAGTCATCAGACAAATAGTAGTTCCTGGTCCACCCTTCCTACTCAGGGTAATGTAGGTAGCAGTTTAAGCAGATCTGCTTCATCAGAACAGGTAAATGCAAGACTTGGCCTGGGAGTGGGGGATGACTCCTCTGAAAACCTTCCTGATTCAAATGTTGCAGGCAGCTCAGAAAGCTTCCACCGAAATTTCCGTTTGAGGATAAACCCTTCAAACCAATATCCGATTCCTCCCACTACATTCTCAACTGGGAGTGTGATAAGGCATTCTAATTTTTCGTCCTTTCCAATGTCGCAAAGGTTTCCTGTTGATAATGCTCTGGACTTGAGGTCAGCACCAGCTGTGGATAACTTGATTCCCCAAAGCCAGCCCCTTATGGTTCATGTTCCTGCGTTGCCAAGGAATGTGCAATCATTTAGGTGGAGTGGTGGCTCCAGCTCAAGAAACAGCCATTCATCAAGCCCAATTATTTGTGCAGACAGGGATAGTGTGCAACATGAAGAAGCAAGCTCAAGAAATACACCTAGAAACATGTTAGAGCAACCATTGTTTGTACCTGCAACTGATTTAAGAGGTTTGGTTCGAAATCCAACATTTAGAGCTTCTAGTAGTGCAAATTTAAGTATTTCAGGAAATGTTGCTTCTTCATCACGGACTGGATCTAGTTCTACTCTCAATCCCTCATCTGCCTCAACCTGGGTTTCTCGTCCTAATCCTCCTCAATACCCGCGGAGGTTATCTGGATACGTTCGTCGGTCATTGTTTTCTCCTGGTTCTGAGGCTGCTGCAGGTCAGAGCAATAATTATTCTTCTTTGCGCTCTGGTCCTACGGCTTCATCTGAAGCTAGGATTTTTGCATCTGGTGCTAGTAACCAGGGACACAATCAGTCACATCCGAGATCATCTTCATGGATGGAGAGGCAAGGTGATGCTGAATTTGGAATTCCCTATTCATTGCGTTCTTTGGCTGTTACTGGTGAAGGAAGTAGCAGAATTGTGTCTGAGCTTCGCAATGTTTTGGGCCTCATGCGTAGGGGTGGGAGCCTGCGATATGAGGATGTCATGATCCTTGACCAGTCAGTATTTTCTGGCATGGCTGATATTCATGATAGGCACAGGGATATGAGACTTGATGTCGATAACATGTCTTACGAGGATTTACTGGCTCTTGAAGAGCGTATTGGAAATGTGAGTACCGGCTTGAGTGAGGAAACGATATTGAAACTTTTGAAACAGAAGAAGTATTCAGTTGAAACTGGAGCCCAGTTTGAGGCAGAACCCTGCTGTGTTTGCCAGGAGGAGTATAATGATGGTGACGATATTGGAACGCTGGATTGCGGGCATGATTACCATGCCGATTGTATTAAACAGTGGTTAATGCACAAGAATCTGTGTCCCATTTGCAAGACAACGGGCTTGGCAACATGA 9556 0.3758 MQGQRGALGSLPETLQFDCGSTSSNATVDQQICWNNMRSPAENQIPEYILAPGDMNASYLNSINHEWQNLSGWSLGEPSSINTQNEINHNEQKRELGWSSSVSNGTVPGPRLEERRFESTNILPSDSANARPIYRPGSHSHPVSQNFNLNAGVVDNDNDSDSIQHTEHPSIHKSSGSVNERPPPPVGSGPSLLPSGSNGFLVEDNDGRPGCSLDTRRVSCKRKAVEGSIGQSSDGGSSSYSHQTNSSSWSTLPTQGNVGSSLSRSASSEQVNARLGLGVGDDSSENLPDSNVAGSSESFHRNFRLRINPSNQYPIPPTTFSTGSVIRHSNFSSFPMSQRFPVDNALDLRSAPAVDNLIPQSQPLMVHVPALPRNVQSFRWSGGSSSRNSHSSSPIICADRDSVQHEEASSRNTPRNMLEQPLFVPATDLRGLVRNPTFRASSSANLSISGNVASSSRTGSSSTLNPSSASTWVSRPNPPQYPRRLSGYVRRSLFSPGSEAAAGQSNNYSSLRSGPTASSEARIFASGASNQGHNQSHPRSSSWMERQGDAEFGIPYSLRSLAVTGEGSSRIVSELRNVLGLMRRGGSLRYEDVMILDQSVFSGMADIHDRHRDMRLDVDNMSYEDLLALEERIGNVSTGLSEETILKLLKQKKYSVETGAQFEAEPCCVCQEEYNDGDDIGTLDCGHDYHADCIKQWLMHKNLCPICKTTGLAT 714
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 448 477 - -
Bach3g02232 714 FunFam E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 635 712 - -
Bach3g02232 714 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 630 711 IPR013083 -
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 379 398 - -
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 139 159 - -
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 209 223 - -
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 448 484 - -
Bach3g02232 714 Pfam Ring finger domain 667 708 IPR001841 -
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 230 272 - -
Bach3g02232 714 ProSiteProfiles Zinc finger RING-type profile. 667 708 IPR001841 -
Bach3g02232 714 SUPERFAMILY RING/U-box 666 710 - -
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 379 421 - -
Bach3g02232 714 MobiDBLite consensus disorder prediction 91 296 - -
Bach3g02232 714 PANTHER E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE RNF165 216 712 IPR045191 GO:0061630
Bach3g02232 714 SMART ring_2 667 707 IPR001841 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bach3g02232 Bach-Chr3 29233026 29245591 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Bach3g02232 1 714 C3H Transcription Factor Family AT2G15530 34.713 3.51e-90 295
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Bach3g02232 3 29233026 29245591 Bach12g00258 12 1733417 1736487 BWGD
Bach3g02232 3 29233026 29245591 Bach3g02232 3 29233026 29245591 ECH