Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Arst9g03707 ATGATGGATTCTCCCTCTTTCTCTTCCTCCTCCTCCTCTGAATTTGCTTCCATAGCCACCGCTGATCAGAATGCTGCCAGAAGTAGGAGAAGCGGTGATGGCAGTGAAGCTGCCAGTTTAGAACAATCACGGAGGCGGTGGCATGATGTTTTCTGGTTAGGAGTATTTGTGGTTCATTTGGTTGCCCTTGGTTTCCTTCTGGGGGTTCTTGGCCTCAATAGGTTCAAGGAAGAGAATAGACTTAACATTGACAAGTATACCTCCCGGTTTTCGGAGAATGAAGCTGGGTTGACCGAGACTTATTGGCCGCTTTATGCTGCTGCTGGTGGAGTTGGGACAGTTCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGTTGTTGGGCTCAAGGGCCACTCAGATGATGAAGGTGTCCGTTCACATCCTCACCACTTATCTTGCTGTGGTTAGTGTTCTGTGTTTCTGGGCAGGCCAGATTTTTTGGGGAATCGCCTTTGCTATTGGAGCTGCCCTGCAGTTCTTGTATGTCTTAGCAGTCATAGACAGACTTCCATTCACAATGTTGGTTCTGCAAAAAGCTGTGAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATACTTATTTATGGTGGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCAGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGTATCGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTGTTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACGGGTGCAGTACTCTGTAATACTGTACATGTTATAGTGTCTGGGATGGTATTTCTTGTTCTTTTCCATGGTGGTAGAGAGGCTGCATCAATTCCCGATGATTCCTTAATGAAATCTCTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGTATCTGCTATGGCTCACTATTTACTGCTGCTATTAGGACCTTGCGGTGGAAGATTCGTGGGTTTCGATCAAAGATTGGCAACAATGAGTGTCTGCTGTGCTGCGTCGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGATTTTTCAACAAGTATGCTTATGTTCAGATTGCTGTGCATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCGGCTAGAGATGCATGGGAGCTGTTCCAATCAACTGGGGTCGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGCTCAGGTGCTGTCCTGCTAATGGGCACCGTTTTTGGCGGGCTCATAACCGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCTTGGTTCAAATGGCAGGACCGAGTTATGATGATTGGGTCCACGTCCATGCTAATGGGAATGGTATTGGTTGGATTGGCAATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCGATATATATATGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATACAAAGATGGGACACTGAATTTTTCAACCAGTTATCAGAGACACTGCATCAGAGGCTTCAACATAGAAGTGCTCGAGCTAGGGAAGTTTTAACCCGCTATCGTCTCGATGGAAATGCTTCCATTTGA 1497 0.4603 MMDSPSFSSSSSSEFASIATADQNAARSRRSGDGSEAASLEQSRRRWHDVFWLGVFVVHLVALGFLLGVLGLNRFKEENRLNIDKYTSRFSENEAGLTETYWPLYAAAGGVGTVLGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVVSVLCFWAGQIFWGIAFAIGAALQFLYVLAVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYLFMVVVLLWMALWSFGAAGVVASSIGDGGRWWLLVVFSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLFHGGREAASIPDDSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWKIRGFRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVHGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTVFGGLITGTCSGVWAWFKWQDRVMMIGSTSMLMGMVLVGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFNQLSETLHQRLQHRSARAREVLTRYRLDGNASI 498
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Arst9g03707 498 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 36 482 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Arst9g03707 498 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 38 - -
Arst9g03707 498 Pfam Plasma-membrane choline transporter 159 454 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Arst9g03707 Arst-Chr9 113354932 113358588 Dispersed/Transposed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Arst9g03707 9 113354932 113358588 Arst9g03707 9 113354932 113358588 ECH