Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Apr7g1261 ATGGAGCAACCACGGCGTTGGCATGACGTTTTCTGGTTAGGGATATTCATGGTCCATTTGATTGGTTTGGGTTTGGTTCTTGGGGTGTTAGGTCTCAACAGGTTCAAGCAAAAGAACAGGCTTGACATTGATAAGTACACTTACCGGTTCATGGAGAATGAGGCTGGTTTGACAGAGGATTACTGGCCGTTTTATGCGGTGGCCGGAGGCGTTGGAACCGCCCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGCTGTTAGGCACACGCGCCACCCAGATGATGAAGGTGTCTGTGCACATACTCACCACTTATCTTGCTGTGATCAGTGTTTTGTGTTTTTGGGCTGAGCAGTTTTTTTGGGGTGTTGCCTTTGCAATTGGGGCAGCCCTGCAGTTCTTGTATGTGATTTCTGTCATAGACAGACTTCCATTTACGATGTTGGTTCTTCAAAAAGCTGTCAAGATGGTTTGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATATGCTTTTATGCTTATCGTGCTTTTATGGTTGGCCTTATGGTCATTTGGAGCTGCTGGTGTTGTTGCTTCAAGCATAGGTGACGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTCCTCTCTATAAGCTTATTTTGGACAGGTGCTGTTTTCTGCAATACTGTGCACGTGATAGTGTCTGGGACGGTGGTTCTTGTTAGTATCAATGGTGGTAGAGATGCTCAGTCAATCCCCACCAACTCCTTAATGAAATCTTTACAGTATGCATTAACAACATCTTTTGGAAGCATTTGTTATGGATCATTATTCACAGCTGCAATTAGGACTCTGCGATGGGAGATAAGAGGAATCCGGTCAAAGATAGGCAACAATGAGTGTTTACTTTGTTGTGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTCTTTAACAAGTATGCTTATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCTGCTAGAGATGCCTGGGAGTTATTCCAATCAACTGGAGTTGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGTTCGGGTGCCGTGCTGCTAATGGGAACCATTTTTGGTGGACTGATAACTGGAACATGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATTAAGTGGCGTGACAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACATCTGTGCTCATGGGGATGATATTGGTTGGAGTGGCTATGGTAGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATATATCTGCTATGCAGAGGACCCTTCATTGATTCAGAGATGGGACTCCGAGTTTTTCAACCAGATGTCTGAGACACTACATCAGCGACTTCAACATAGGAGTTCACGTGCAAGGGAAGTTTTAACCCACAATCAGCTTGATGCTGTTATAGGAGAAAATGCCTCAGTTTGA 1389 0.4485 MEQPRRWHDVFWLGIFMVHLIGLGLVLGVLGLNRFKQKNRLDIDKYTYRFMENEAGLTEDYWPFYAVAGGVGTALGWSWLLLLGTRATQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMLIVLLWLALWSFGAAGVVASSIGDGGRWWLLVVLSISLFWTGAVFCNTVHVIVSGTVVLVSINGGRDAQSIPTNSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGIRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTIFGGLITGTCSGVWAWIKWRDRAFMIGSTSVLMGMILVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPSLIQRWDSEFFNQMSETLHQRLQHRSSRAREVLTHNQLDAVIGENASV* 463
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Apr7g1261 462 Pfam Plasma-membrane choline transporter 120 414 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Apr7g1261 462 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 2 454 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Apr7g1261 462 PANTHER PLASMA-MEMBRANE CHOLINE TRANSPORTER FAMILY PROTEIN 2 454 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Apr7g1261 Apr-Chr7 19674897 19680424 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Apr7g1261 7 19674897 19680424 Apr7g1261 7 19674897 19680424 ECH