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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Aip08g02002 ATGATTTTTCAGGAATCTGTATCTGATGTTTTGGGAGCATTATTATGTATTCTTGAAGGCAAAAGTGGTCCCTTATTAAGCATGGCATCAAATGTTGCAGTGAAGTTAGTTAGTATTTTGCCGAATTCACTATTGCAATCTCGTATAGTGGAACTTGTCTGTTGCCTATCATCCTTAATCTCTTCGCACCAAGTAGAGGTTGCAATAGATTGTGCTAATGCCTTGAATTTGGTGGTCTCTAATTTGAGTGCTACAAGTGAGAGGACAGTTATGGAAGCCCTCAAAGACACAGGGATTGCCACTCATATTGTTGGAAATATAAAAGACTTTGCTGGTGGTGCAAAAAAAATTGAGTATTTTGAACAGATGGGTTCACTATTGAGCACAATCCTGTGGCGGTGGCCTCAATCTAGGTTCCCTGTTTTGAGTGATGTTAAACTTATGAAAGCTTTAGCAGACATGCACATGGTGACAGATAGTTCTATTAAACTTGTACTTTTAAAGATGTACACATCTTTAGCTTTATGCGATTTTGTAGCCAAAAAACTTATAGAAGATGGAGTATTTGTAGAGATGGTTGTGCAGGCCATGGAAAAATCAAACCCTCAGGTTGTTCGAATAGAGGGGTTTAAGCTCGCTCGATGTCTATTGAGATGCCAAGAGAATTTCATACGTATGAGGAATTTGTGTGGTGATGCACTTGTCAATGCCATAATTTGTGGGATGAGGGAAACAGGATTGAGTTCCAAAAAGGGAGGGATCAACCATGGTTCCTTATTATTGGAAGCATGTCAATTGGGTCTAATTACCCGTTGGGATGGTGATCATCATATCAGGTTTTGGGAACATGGTATTGATAGAGTCCTCCTTAATCTTGTACTAGAAAATATTCAAGATAAGCCATCTGAGCATGTCTTGTCTTTGGAAGAACAGATATCCACAGCAAACAAGGGTTTAAAATCTAATTATCATCTTGGTCTGAGGAGTTATCTGTGGGACATTCTTGGGTGCCTTATGATACATTGTGGAGAAAATTTCAACCCTTATACCTATGGAAGTGAGCTCCACATCAACACACTAATTACATGTGCATGTCTGACTTTTGTTGACACAATTCAAAAATGGTGCCGAATATGTCAAAATGATGATGATAGTTTCCAAAGTGAACCAGTATCAAGGGCTGTATTAATGATGATTTATTCTCCATGTAATCACATTTCTTCACATGCAAGGCTTGTATTATCTGATAGAATGAAAGTAATAGGTATTCCGTGCTTGAAAAGCTTAATACATACTCTAGATTACACATCGTCCCTGGCAAGCTTTGGGTCATCCGATAAACTTCAACTTGTTATTAACTTGATTGGGTTAAATTCTCTTTCAAGTTTACCTGAATATCAAAAATGTATCATCGAAAGCAAAGCAATGAAAGCAGTTGTTCTTATTGTCAAACGATGTTTAAGTAATGACATTCATATGGAAAGGCCTAGCATGGCTCCTCATTTGCTTACATCATTTCATGAAAGGTCATGTTGCTGCATTGATAAAGAAGATTGGGAAGGTTCCAATGTGCTCCATTTTTATGGTTTGTGGGCCTTGTCTTCATTTGTTCATCAGTGTAGCCTTTTACAAGATCATACTCAGAAATTCACCACAGCAGTGACATACATTAAAGCTCAATTACTCAACAAGCTTCATGAGACTTGTAGTAGCACCTGTTTAAGTCCTGGAGTGAGATGGTATGCTTCATATATTCTAAGCTATTTTGGATGTTATGGTTTCCCTAATGAATTAGCAAAATGGATTGGGAAATCCCTTAATCAGGAAGAATATGCGGATTTGCGACTCATTGTGGCAAATGGGGCTTCTGTCAATGTTAATGGTGTTATTCTTGCTGTCAGATGTCCATCGCTTCTGCCTCGTGAAATCTTGACTAGTAGCAAGAATTGTAAAGAGGGAACAGATAAATATGGAGAGACTATGAGAGAGGTTCGTTTATCTGCTCACGTTGATTATGAAGCATTGGTGCTGTTGTTGGAATATGTTTACTTCGGATGCTTGCAGGCAGAGGAAGATATGGTAAAAAAGTTGAAAATTCTTGCTAAACGCTGCAATCTGCAGCCCTTTCTGCAACTACTCTATAGACAATGTCCTGAGTGGGGCACACCTTTCCCCAGCTTGAATCTTACTTCAGCTCTCAATTCTGTTGGAAGTTGTTTTTCGTATGGTTTGCTTCTTGATCAGCTTCTTATGTACATTTAG 2262 0.3846 MIFQESVSDVLGALLCILEGKSGPLLSMASNVAVKLVSILPNSLLQSRIVELVCCLSSLISSHQVEVAIDCANALNLVVSNLSATSERTVMEALKDTGIATHIVGNIKDFAGGAKKIEYFEQMGSLLSTILWRWPQSRFPVLSDVKLMKALADMHMVTDSSIKLVLLKMYTSLALCDFVAKKLIEDGVFVEMVVQAMEKSNPQVVRIEGFKLARCLLRCQENFIRMRNLCGDALVNAIICGMRETGLSSKKGGINHGSLLLEACQLGLITRWDGDHHIRFWEHGIDRVLLNLVLENIQDKPSEHVLSLEEQISTANKGLKSNYHLGLRSYLWDILGCLMIHCGENFNPYTYGSELHINTLITCACLTFVDTIQKWCRICQNDDDSFQSEPVSRAVLMMIYSPCNHISSHARLVLSDRMKVIGIPCLKSLIHTLDYTSSLASFGSSDKLQLVINLIGLNSLSSLPEYQKCIIESKAMKAVVLIVKRCLSNDIHMERPSMAPHLLTSFHERSCCCIDKEDWEGSNVLHFYGLWALSSFVHQCSLLQDHTQKFTTAVTYIKAQLLNKLHETCSSTCLSPGVRWYASYILSYFGCYGFPNELAKWIGKSLNQEEYADLRLIVANGASVNVNGVILAVRCPSLLPREILTSSKNCKEGTDKYGETMREVRLSAHVDYEALVLLLEYVYFGCLQAEEDMVKKLKILAKRCNLQPFLQLLYRQCPEWGTPFPSLNLTSALNSVGSCFSYGLLLDQLLMYI 753
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Aip08g02002 753 ProSiteProfiles BTB domain profile. 612 691 IPR000210 GO:0005515
Aip08g02002 753 PANTHER OS06G0674800 PROTEIN 3 741 IPR044953 -
Aip08g02002 753 Pfam BTB/POZ domain 604 703 IPR000210 GO:0005515
Aip08g02002 753 Gene3D Potassium Channel Kv1.1; Chain A 594 717 IPR011333 -
Aip08g02002 753 SUPERFAMILY ARM repeat 5 610 IPR016024 -
Aip08g02002 753 SUPERFAMILY POZ domain 593 712 IPR011333 -
       

Transcription factors information


Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TR TRAF Aip08g02002 BTB 0.00032 CL0033
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Aip08g02002 08 60349206 60356128 Aip08g02002 08 60349206 60356128 ECH