Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Ahy19g3144 ATGATGGATTCTCCCTCTTTCTCTTCCTCCTCCTCTGAATTTGCTTCCATAGCCACCGCTGATCAGAATGCCGCCAGAAGTAGGAGAAGCGGTGATGGCAGTGAAGCTGCCAGTTTAGAACAATCACGGAGGCGATGGCATGATGTTTTCTGGTTTGGAGTATTTGTGGTTCATTTGGTTGCCCTTGGTTTCCTTCTGGGGGTTCTTGGCCTCAATAGGTTCAAGGAAGAGAATAGACTTAACATTGACAAGTTTACCTCCCGGTTTTCGGAGAATGAAGCTGGGTTGACCGAGACTTATTGGCCGCTTTATGCTGCTGCTGGTGGAGTTGGGACAGTTCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGTTGTTGGGCTCAAGGGCCACTCAGATGATGAAGGTGTCCGTTCACATCCTCACCACTTATCTTGCTGTGGTTAGTGTTCTGTGTTTCTGGGCAGGCCAGATTTTTTGGGGAATCGCCTTTGCTATTGGAGCTGCCCTGCAGTTCTTGTATGTCTTAGCAGTCATAGACAGACTTCCATTCACAATGTTGGTTCTGCAAAAAGCTGTGCAGATGGTATGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATACTTATTTATGGTGGTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCATTTGGAGCAGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGTATCGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTTTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACGGGTGCGGTACTCTGTAATACTGTACATGTTATAGTGTCTGGGATGGTATTTCTTGTTCTTTTCCATGGTGGTAGAGAGGCGGCATCAATTCCCGATGATTCCTTAATGAAATCTCTACAGTATGCTTTAACAACATCTTTTGGCAGTATCTGTTATGGCTCACTATTTACTGCTGCTATTAGGACCTTGAGGTGGAAGATTCGTGGGTTTCGTTCAAAGATTGGCAACAATGAGTGTCTGCTGTGCTGTGTCGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGATTTTTCAACAAGTATGCTTATGTTCAGATTGCTGTGCATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCGGCTAGAGATGCATGGGAGCTGTTCCAATCAACTGGGGTCGAAGCACTTGTGGCCTATGATTGCTCAGGTGCTGTCCTGCTAATGGGCACCGTTTTCGGCGGGCTCATAACCGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCTTGGTTCAAATGGCAGGACCGAGTTATGATGATTGGGTCCACGTCCATGCTAATGGGAATGGTATTGGTTGGATTGGCAATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCGATATATATATGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATACAAAGATGGGACACTGAATTTTTCAACCAGTTATCGGAGACACTGCATCAGAGGCTTCAACATAGAAGTGCTCGAGCTAGGGAAGTTTTAACCCGCTATCGTCTCGATGGAAATACTTCCATTTGA 1494 0.4598 MMDSPSFSSSSSEFASIATADQNAARSRRSGDGSEAASLEQSRRRWHDVFWFGVFVVHLVALGFLLGVLGLNRFKEENRLNIDKFTSRFSENEAGLTETYWPLYAAAGGVGTVLGWSWLLLLGSRATQMMKVSVHILTTYLAVVSVLCFWAGQIFWGIAFAIGAALQFLYVLAVIDRLPFTMLVLQKAVQMVWNLPEVMRVAYLFMVVVLLWMALWSFGAAGVVASSIGDGGRWWLLVVFSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLFHGGREAASIPDDSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWKIRGFRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVHGKSFNRSARDAWELFQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTVFGGLITGTCSGVWAWFKWQDRVMMIGSTSMLMGMVLVGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIQRWDTEFFNQLSETLHQRLQHRSARAREVLTRYRLDGNTSI* 498
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Ahy19g3144 497 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 28 488 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Ahy19g3144 497 PANTHER PLASMA-MEMBRANE CHOLINE TRANSPORTER FAMILY PROTEIN 28 488 - -
Ahy19g3144 497 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 37 - -
Ahy19g3144 497 Pfam Plasma-membrane choline transporter 158 453 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Ahy19g3144 Ahy-Chr19 154406813 154410473 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Ahy19g3144 19 154406813 154410473 Ahy19g3144 19 154406813 154410473 ECH
Ahy19g3144 19 154406813 154410473 Ahy9g2484 9 113923831 113927512 hybridization