Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele13g2019 ATGGGAAAATTTCTTGGTGGTTTCGTACTGCCTGTGCTCCTTTTAGCTGCTGCTCTAATCAACTGGAGTTTGATTTCTGTTGTTGATTTGATAGCTTTTCTCATCATTCAATTTAATGCACCAAAAATTGGATTTCATTCCTGCAGGCATTTGTTGCTATTGTGGTCAATAGTTGTCTTTTCTGTAATAGTCATACTTTCTCAAGGGACTTATCTAGTAATATGGGCTATTGAAGGAAGCTCATGGAGTATACCCGGTGTTTGGTGGGAAAAGCTGATTGGACTTATGATAGTTCAATCATGGAGATCCCCTTATGTAATTTATTTCTTGGCCGTGCAAATCCTTGTAACTTTTGTAGCTTTAGTGGATATACACAAAAATAAACTTTTTCTTGCAACATGGCAAGATTCATCTTGGGGCCAGTTCTTATCAATTATTGAACAATTAGGTACTCATCTTCAGGTTGCTTCTTGCTTGCTGTTACCTGCTATCCAACTAGTTGTTGGAATTAGCCATCCTTCCTGGGCTTCATTACCTTTTTTCATTGGTAGCTGTGTTGGTCTTGTGGACTGGTCTTTAACAAGCAATTTTCTTGGACTTTTCAGGTGGTGGAGGACTCTTCAACTGTATGCAGGTTTCAATATTTTCCTGCTTTACGTATATCAACTTCCTGTGGAACTTCCAAGTATAGTTGAAAGAGTGGCTGATTTGATTGGTCTCTTTAAAATATCTGTAAATTCTGAGTGGCCCAAGATTTGTTCCAGCCTTTCTCTCATATGTTTTTATATGATGCTGTCCTTCATCAAATCTGATTTGGAGGAGATGGATTTCATTATGTCTGGGACAGGGAGTAGCTTGACTGAGCAACTTCTTCCGTCTAAGCACTCATTTTTTATTCGTGAATCAAGATCTGGTGTGAAGCACACAAATGTTTTACTCAGAGGATCTGTTTTTCGAACATTCAGCATCAACTTTTTCACGTATGGTTTCCCGGTCTCCTTGTTTGCTCTTTCCTTTTGGAGTTTTCATTTTGCAAGCTTATGTGCATTTGGGCTACTTGCTTATGTTGGCTACATCATCTATGCCTTCCCTTCTTTGTTTCGCTTGCACCGATTGAATGGGATGCTTCTTGTCTTCATTCTCTTATGGGCTGTTAGCACCTATGTATTTAATGTTGCATTTGCATTCCTGAATTGGAAACTTGGACGGGACATGAAAATATGGGAGATGGTAGGTCTGTGGCACTATCCAATTCCTGGATTTTTTCTGCTTGCACAATTTTGTCTGGGAATATTGGTTGCCTTGGGTAATCTGGTGAACAACTCTGTATTCCTCTGCTTGTCAGATAATGGGAATTCTTCAAATGAATATTCCTCTGAGAATGTGGAGGGAGAGACTAAGGTATTGATTGTGGCCACAATAGCATGGGGTCTGCGCAAAAGCTCTAGAGCTATCATGCTGACTTTGATCTTTCTCATCGCCATTAAACCTGGTTTCATCCATGCTGTATATATGATATTTTTCTTGATATATCTTTTGAGTCACAACATCAGCAGAAAGATGAGGCAGGCTCTGATACTTCTTTGCGAAGTTCACTTTGCACTTTTGTACATTCTTCAAATTAATTTGATCTCTTCTGCTTTGGAGAAAAATGGCTCTATCAGTATGGAAGTCCTAATGCAGTTAGGTCTCCTTGAAGAAGATAGTTCTTGGGATTTCTTGGAAGTGACTTTACTTGCTTGCTTCTGTGCAATTCATAACCATGGTTTTGAGATGTTATTTTCATTTTCAGCAATTGTGCAGCATGCCCCTAGCCCTCCTATTGGATTCAGTATATTAAAAGCTGGTCTAAACAAATCAGTTCTGTTGTCTGTATATGCCTCCTCCTCTGTGAGATCCAGCCATGGCAGTTTCTCTTATGAGAGAAGAATAGCATCATATCTCAGTGCAATTGGGCAGAAGTTCCTATCTATTTATCGATCATGTGGAACCTACATTGCTTTCCTGACTATTCTTCTCACAGTATACCTGGTGAGACCTAATTGTGTATCATTTGGCTACATATTCCTTCTCCTTCTGTGGATTATTGGAAGACAACTTGTTGAGAGAACCAAAAGACGGCTATGGTTTCCATTAAAAGTTTATGCAATTTTGGTGTATATCTTTGTATATAGCTTGAGCAGTTTCTCAAGCCTCGAGAAGTGGTTGTCTAAATTAATTGAGCTCTATATTTATTTGGGATATGACTCAAAGGCATCACCTCTCAAAAATATTTGGGAGTCCTTGGCAGTCCTAATTGTCATGCAACTTTATAGCTATGAGAGGAGGCAGAGCAGGTATAATAGACTGGATGACTTTGATAAACTGGAGTCAGGGATTGTGGGGTTTGTCAGACGATTGCTTATTTGGCACAGTCAGAAGATCTTATTTATTGCATTGTTTTATGCATCTTTTTCTCCAATTAGTGCATTTGGACTTTTATATCTTCTTGGCCTTCTCATATGCTCCACTTTACCAAAAACTTCTAGGATCCCGTCCAAATCATTTTTAGCATACACGGGGTTTCTAGTAGCAGCTGAATATCTCTTCCAGATGTGGGGTAAGCAGGTTCAAATGTTTCCCGGGCAGAAGCACTATGATATATCTCTATTTTTGGGTTTCCGTGTATTCCAGCGAGGCTTTTGGGGTTTAGAATCAGGATTGAGAGGAAAAGTTCTGGTGATTGCAGCTTGTACCCTTCAGTACAATGTCTTCCGTTGGTTGGAGAGGATGCCAAATGCAGTTCTAAACAAAGAAAAGTGGGAAGAACCTTGTCCATTATTTGTTTCCCCAGAAGATGCATTCAGTAATGTTAAAGAATGCAATGATGAAAATAAACCATTGTATAATTCACATCCTCCGTCTGCAAGACAAGAAGGGGTTTTGAACAATTCGTCGCAGATTTTTTCCTCTAGCTTTTCTCAAATAGCTGATGCTACATCTTCTAAACCAGGAGGTTCTGACAGTAGAAAATATTCATTTGGGTTTATCTGGGGTAGCACAAAGGAGAGTCACAAGTGGAACAAGAAGAGGATTGTTGCTTTGAGAAAGGAGCGATTTGAAACACAGAAGAGTCTCTTAAAAATATATCTGAAATTTTGGATGGAGAATATGTTTAATCTGTTTGGTCTTGAGATAAACATGATAGCATTGCTATTAGCTAGCTTTGCTTTGTTGAATGCAATATCAATTTTGTATATTGCACTGCTTGCTGCTTGCATTCTTTTAAGTTGGCGAATTATACGGAAAGTCTGGCCCATATTTGTTTTCTTGTTTGCTTCCATTCTGATCCTGGAATATTTTGTCATCTGGATGGATAAATTGAATTCACAAGTCCCAAGTGAGATTCATTGCCATGACTGCTCGAGAAGTTCAACTAAGGATTTCCATTACTGTAAAAAGTGTTGGCTCGGACTTATTGTTGATGACCCCCGGATCTTTGTAAGCTATCTTGCGGTCTTCATGCTGGCTTGTTTTAAACTTCGTGCTGATAGCCATCCTGGTTTGTCAGGGTCTTCAACTTATCGTCAGATTATGTCCCAACGTAAGAACACATTTGTTTGGCGAGATCTCTCTTTTGAAACTAAAAGCATGTGGACATTTCTTGACTATTTGAGGCTTTACTGCTATTGCCATCTGCTGGATCTGGTGCTAATACTAATACTGATTACTGGAACACTTGAATATGACATTCTACATCTTGGTTATCTTGCCTTTGCTCTGGTATTCTTTCGCATGAGACTTGAAATACTGAAGAAGAAGAATAAAATATTCAAGTTCTTGCGCATATATAATTTTGTTGTAATTGTTCTCTCTCTAGCTTATCAGTCTCCTTTTGTTGGGGGATTTAGTGCGGGGAAATGTGCAACTGCAAACTACATTTTTGAGATCATTGGATTTTATAAATATGATTATGGTTTCCGGATTACAGCAAGATCTGCTTTAGTTGAGATCATCATTTTTGTGCTGGTATCACTTCAGTCGTATATGTTTTCTTCTCAAGAGTTTGATTACGTGTCTCGCTATCTGGAAGCAGAGCAAATTGGCGCGATTGTACATGAGCAAGAGAAAAAAGCTGCTTGGAAAACCGAACAATTGCAACAAATTCGTGAATCTCAGGAGAAAAAACGCCAGCGTAACATGCAGGTGGAAAAGATGAAATCTGAAATGCTCAACCTCCAATTACAACTCCACAGCATGAACTCATCCACTAATTGTGGTGATGGATTTTCTCATGGCAATGAAGGTCTACGAAGGAGGAGAAGCTCTTCTCTTGCATCAAATAATGACATTGGAACCCCTGATAAAGAAGAGCATATTCTACGGAAACTAGACCACACTATAAGAGAGAATTCCGTTTTTCCAATTGAACTGCACAAATCATCTGCTAACATGGATATGGAAACTCCATTAGCAGAAGAGTATATGAAGCATTTGGTGGATTCTTCTCGGTGTGAGATTACTGAAATAGAGGATGATACTTCTAGAGAGTTAGAATTAAAGGAAAAAATTAAAGGGCAAGCAAAAGAAAACCCATTAAAATCTGCTGTACAATTGATAGGGGATGGTGTTTCCCAGGTACAGTCCATTGGAAATCAGGCAGTCAATAACCTGGTGAGCTTTTTGAACATTGCACAAGAAGAATCTAATGTGAATGAGCAGACATCTATGGAGGATGGGATATATGATGATATTGAGAGTCAAAAGACCCGGCATGGGTATTTGGAACGTTCCTCATCTGTTCAATCTGATAAGAGTTCTGATGCTGCAAGTCTGCAGTTAGGAAGGATCTTCCGTCATATATGGTCTCAAATGCGTTCCAATAATGATATTGTGTGTTACTGTTGCTTTGTTCTTGTTTTCTTATGGAACTTCAGTCTGCTTTCAATGGTTTATCTTGCAGCTCTCTTCCTGTATGCTTTGTGTGTAAATACAGGCCCAAGTTACATCTTCTGGATTATCATGCTCATTTATACTGAGGTTTATATTTTACTTCAGTATCTGTACCAAATCATCATCCAGCATTGTGGGTTGAGTATTAATTCTCACTTATTACGTGAATTAGGTTTCCCCACAGACAAAATTACGTCATCCTTTGTTGTCAGTTCATTTCCTCTATTTCTTGTCTACATATTTACCCTCATTCAGAGCTCCATAACTGTAAAAGATGGTGAATGGATGACTTCTACAGACTTCAAGTTTTTTAATAGAAATGGTCGCTATGCCAAAGATGCCTCCACTAGTCATAACTGGCATGATAGAGCATGGAATCTGATAAATCAGTTAACCAATATGGTGAAACTGATAATCAGAAGCTTCTTTAGGTACTGGAAATCACTGACGCAAGGAGCAGAATCTCCTCCATATTTTGTCCAGGTGTCTATGGATGTCAATTTCTGGCCTGAAGATGGGATTCAGCCAGAGAGGATTGAGTCTGGAATTAATCAATTGCTCAGAAATGTCCACAACAATAGGTGCAAGGAAAAGAACCCCAATCTCTGCCCTGGTGCTAGTAGGGTTCATGTTCAAAGCATTGAAAGAAGCCTAGGAAATCCCAATGTCGCACTGGTTGTCTTAGAGGTAGTTTATGCCTCTCCTGTAATGGGGTGCTTTTCAGCAGAATGGTACAAGTCTTTAACTCCTGCAGCTGATGTAGCCAAGGAAATTCTCGAAGCGCAGCAAGTAGGTTTTTTGGAAGACTGGGGATTTCCTTACCATATACTGTCTGTAATTGGTGGAGGCAAAAGGGAACTTGATCTGTATGCCTACATATTTTGTGCAGATTTGATTGTGTTCTTTCTTGTTGCCATGTTCTATCAGTCTGTCATAAAAAATAAAAGTGAATTCCTTGATGTATATCAGCTTGAAGATCAGTTTCCGAAAGAGTTTGTCTTTATTTTAATGGTTATCTTCTTCCTGATTGTGCTTGATCGTATAATATACCTCTGTTCGTTTGCCACAGGGAAAGTGATTTTCTATATTTTCAACCTCATTCTCTTCACATATTCAGTTACAGAGTATGCCTGGCAATTGGAGCCTTTTCAGCAACATGCTGCTGGGCTTGCTCTCCGTGGCATATATTTTGCAAAAGCAGTTTCTCTTGCACTACAGGCTGTACAAATTCGTCATGGCATCCCTCACAAGAGCACTTTGTACCGGCAGTTTTTGACCAGTGAAGTTTCACGAATCAATTATTTAGGATATAGACTTTATCGTGCTCTACCTTTCCTTTATGAACTACGATGTGTGCTTGACTGGTCATGCACAACCACATCTTTGACCATGTACGACTGGCTAAAGCTGGAGGACATAAATGCAAGTTTGTACCTTGTAAAATGTGATGCACTTTTGAATAGAGCTACACACAAACAAGGAGAGAAGCAAACAAAATTGACCAAATGCTGCAATGGAATATGCCTGTTCTTCATATTAATCTGTGTTATATGGGCTCCTATGCTGATGTACAGCAGCGGTAACCCAACAAACATTGCAAACCCCATCAAAGATGCCAGTTTTCAGGTTGATATCAAGACAGTAAGTGGAAGGTTGAATTTGTATCAAACTACCCTGTGTGAGAAAACCCCATGGGATAATCTGGAGTCTTTTGCCAATCTTGATCCTCGTGGCTACTTAAATACATACAATAAGAATGATATCCAATTGATATGCTGCCAAGCTGATGCTAGTACACTGTGGCTTGTTCCAGCTGTTGTTCGGACCAGATTGATCCATTCACTGGATCGGTATAGATCATCTAATGAGATGGAAATATATGTTACCTGGTTACTTTGGCGGGACAGGCCAAAGGGGAAAGAATTAGTGAAATATGAAAAGCCAGTTGATTCACAAAATCTTCCAAGAGAGTCAGATGTTCAAAAGGTTCTTAATGGCTCTATGAACAGCTTTAGGATTTACAATGTCTATCCAAGATTTTTCCGGGTCACTGGTTCTGGTGATGTTCGACCACTGGAAGTAGAGGATAACTCTGTGAGTGCTGATCTCATGATAAATCATGAGAAATATGAGTGGTGGTCCTTTCATGATATAAATTCAACGGATTCAAGTGGATGTGGAGGTTTGACAGGACCTATGGCATTTATAATATCCGAGGAAACACCACCACAGGGTATTCTTGGTGACACTCTAAGCAAATTTAGCATATGGGGGCTCTACATAACCTTTGTTCTTGCTGTTGGCCGTTTTATCAGACTTCAGTGCTCTGACTTAAGGATGAGAATTCCCTATGAGAACCTACCTTCATGTGACAGGTTGATAGCCATCTGCGAGGATATATATGCAGCAAGGGCTGAGGGTGAGCTTGGAGTTGAAGAGGTACTATACTGGACCTTGGTGAAGATATATAGGTCCCCTCACATGCTACTTGAGTACACCAAACCAGACTAA 7443 0.3947 MGKFLGGFVLPVLLLAAALINWSLISVVDLIAFLIIQFNAPKIGFHSCRHLLLLWSIVVFSVIVILSQGTYLVIWAIEGSSWSIPGVWWEKLIGLMIVQSWRSPYVIYFLAVQILVTFVALVDIHKNKLFLATWQDSSWGQFLSIIEQLGTHLQVASCLLLPAIQLVVGISHPSWASLPFFIGSCVGLVDWSLTSNFLGLFRWWRTLQLYAGFNIFLLYVYQLPVELPSIVERVADLIGLFKISVNSEWPKICSSLSLICFYMMLSFIKSDLEEMDFIMSGTGSSLTEQLLPSKHSFFIRESRSGVKHTNVLLRGSVFRTFSINFFTYGFPVSLFALSFWSFHFASLCAFGLLAYVGYIIYAFPSLFRLHRLNGMLLVFILLWAVSTYVFNVAFAFLNWKLGRDMKIWEMVGLWHYPIPGFFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLCLSDNGNSSNEYSSENVEGETKVLIVATIAWGLRKSSRAIMLTLIFLIAIKPGFIHAVYMIFFLIYLLSHNISRKMRQALILLCEVHFALLYILQINLISSALEKNGSISMEVLMQLGLLEEDSSWDFLEVTLLACFCAIHNHGFEMLFSFSAIVQHAPSPPIGFSILKAGLNKSVLLSVYASSSVRSSHGSFSYERRIASYLSAIGQKFLSIYRSCGTYIAFLTILLTVYLVRPNCVSFGYIFLLLLWIIGRQLVERTKRRLWFPLKVYAILVYIFVYSLSSFSSLEKWLSKLIELYIYLGYDSKASPLKNIWESLAVLIVMQLYSYERRQSRYNRLDDFDKLESGIVGFVRRLLIWHSQKILFIALFYASFSPISAFGLLYLLGLLICSTLPKTSRIPSKSFLAYTGFLVAAEYLFQMWGKQVQMFPGQKHYDISLFLGFRVFQRGFWGLESGLRGKVLVIAACTLQYNVFRWLERMPNAVLNKEKWEEPCPLFVSPEDAFSNVKECNDENKPLYNSHPPSARQEGVLNNSSQIFSSSFSQIADATSSKPGGSDSRKYSFGFIWGSTKESHKWNKKRIVALRKERFETQKSLLKIYLKFWMENMFNLFGLEINMIALLLASFALLNAISILYIALLAACILLSWRIIRKVWPIFVFLFASILILEYFVIWMDKLNSQVPSEIHCHDCSRSSTKDFHYCKKCWLGLIVDDPRIFVSYLAVFMLACFKLRADSHPGLSGSSTYRQIMSQRKNTFVWRDLSFETKSMWTFLDYLRLYCYCHLLDLVLILILITGTLEYDILHLGYLAFALVFFRMRLEILKKKNKIFKFLRIYNFVVIVLSLAYQSPFVGGFSAGKCATANYIFEIIGFYKYDYGFRITARSALVEIIIFVLVSLQSYMFSSQEFDYVSRYLEAEQIGAIVHEQEKKAAWKTEQLQQIRESQEKKRQRNMQVEKMKSEMLNLQLQLHSMNSSTNCGDGFSHGNEGLRRRRSSSLASNNDIGTPDKEEHILRKLDHTIRENSVFPIELHKSSANMDMETPLAEEYMKHLVDSSRCEITEIEDDTSRELELKEKIKGQAKENPLKSAVQLIGDGVSQVQSIGNQAVNNLVSFLNIAQEESNVNEQTSMEDGIYDDIESQKTRHGYLERSSSVQSDKSSDAASLQLGRIFRHIWSQMRSNNDIVCYCCFVLVFLWNFSLLSMVYLAALFLYALCVNTGPSYIFWIIMLIYTEVYILLQYLYQIIIQHCGLSINSHLLRELGFPTDKITSSFVVSSFPLFLVYIFTLIQSSITVKDGEWMTSTDFKFFNRNGRYAKDASTSHNWHDRAWNLINQLTNMVKLIIRSFFRYWKSLTQGAESPPYFVQVSMDVNFWPEDGIQPERIESGINQLLRNVHNNRCKEKNPNLCPGASRVHVQSIERSLGNPNVALVVLEVVYASPVMGCFSAEWYKSLTPAADVAKEILEAQQVGFLEDWGFPYHILSVIGGGKRELDLYAYIFCADLIVFFLVAMFYQSVIKNKSEFLDVYQLEDQFPKEFVFILMVIFFLIVLDRIIYLCSFATGKVIFYIFNLILFTYSVTEYAWQLEPFQQHAAGLALRGIYFAKAVSLALQAVQIRHGIPHKSTLYRQFLTSEVSRINYLGYRLYRALPFLYELRCVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDINASLYLVKCDALLNRATHKQGEKQTKLTKCCNGICLFFILICVIWAPMLMYSSGNPTNIANPIKDASFQVDIKTVSGRLNLYQTTLCEKTPWDNLESFANLDPRGYLNTYNKNDIQLICCQADASTLWLVPAVVRTRLIHSLDRYRSSNEMEIYVTWLLWRDRPKGKELVKYEKPVDSQNLPRESDVQKVLNGSMNSFRIYNVYPRFFRVTGSGDVRPLEVEDNSVSADLMINHEKYEWWSFHDINSTDSSGCGGLTGPMAFIISEETPPQGILGDTLSKFSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGVEEVLYWTLVKIYRSPHMLLEYTKPD 2480
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele13g2019 2480 PANTHER PIEZO-TYPE MECHANOSENSITIVE ION CHANNEL HOMOLOG 2 2480 - -
Lele13g2019 2480 MobiDBLite consensus disorder prediction 1417 1449 - -
Lele13g2019 2480 Coils Coil 1382 1402 - -
Lele13g2019 2480 Pfam Piezo non-specific cation channel, R-Ras-binding domain 2086 2478 IPR031334 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele13g2019 Lele-ChrLele13 27450005 27467618 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele13g2019 13 27450005 27467618 Lele05g1514 05 9710722 9724345 CCT
Lele13g2019 13 27450005 27467618 Lele06g1367 06 8789522 8798634 CCT
Lele13g2019 13 27450005 27467618 Lele07g1574 07 9726491 9730826 CCT
Lele13g2019 13 27450005 27467618 Lele08g1364 08 8744006 8748094 CCT
Lele13g2019 13 27450005 27467618 Lele15g0387 15 2214330 2230490 hybridization