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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele08g1221 ATGGAGGAGGGACTCCGGTATGGTTCTAAACACAAGTATGCAAGGGATGCTCTTAAGAAGGAGGATTCATTCGATGGACTCAGAGACCCTCTATCTCTACATTTTCATTCTTCCTGGTTCATTGGAGGAGTCGGTATGTTTCTTGCACAAGGATTTGCCCTTTGGCTATGTCCTTTCGTTCCTCTGTTCCTTTTGCGGGACTGCTCTACTCAGCTATTGTTGCTTGATTACACCAATTTTGGATGATATTTGAGTTGCGGCTTGGGATGGCTACCCACAGAATTTGCTCATGCACACACCTCAGTTCGCTTAGAAGATGCATACGATGCCTTGAGAGTTTTTGAGATTCTTGCCGTTGAAAAGAAGCCAGATGTCAGCACAACTACTTGTCCGAGAGTATTGGAAAATCTTGGGTCATCGTCTCCTCTGAAGGATTTGTTCTATGCCTTAAAAGTTAATAGCTTACTAAAATGTGGGGTCGATGAGGAGGTTTTCAAGGATCATGCTTCTAATGCTGATGTCCTTTTGGCTGATGCTGATGGAACTTTTCGTTCTATTAAGGCTTTGAGCCAAAGTGATGGAAGATGGCGTTACAGCTCTACTAATCCAGACCCTAGTACCTATGCTGCTGGTAATGGATTAAATGGGTTAGCACTTGAAGCACTTGCTGGAGTGGTCTCACTGGCATCTTCAGAAATTGATCACTCTAGGATCAATGCAGTGAAAAATGATATATTGAAGCTATTTGACAGGATTGAATATTATGATGATGGAACCTTTTATTTCGATGAGAAGATAGTTGGTCCTGGTGAACAACTGGGTTCCCTTTTCACTACAGCTTCAGTTGTTCGAGGGCTTACAGCATTTGCAGCTGCAATTTCTGGAAAAATAAATCTTCCAGAGGATAAAATTTTGGGTTTAGCAAGATTCTTCCTGGGTATAGGAATCCCAGAGGATGCAAAGGATTTCTTCAATCAAGTAGAGGTTTCCATCCCATTAATATTGTCAGTTCCTACAACAGTTTACTCGTTGGCCCAGAAAGAGCAGCTTAAGGTTAGGGTGAATACAGTACTTGGTGGTGCTGCTCCACCTCTAACAGTTAAGCTTGTCCGAGCTTTCAGAACTGGGTCTAAAGGTTCAGCTGTTTTTGAGAGTAAAGTGAGTGATGACTATCTTGTGATATTCTTATCTCTGCTTTGTTCTATTTTATGTTGTTTGAGCACTCCTCCTTTTGCATGTGCACAGGAGCTCCAGTATGAGCCAACAAGTGGACTTCATGTCTTAGATGTTTTCTCAGAGAATGTAGATGTGGGGTCTTTTGTGTTTGTTTTTGAGATGGTCCTTGAAGATTCGAATAGAAGAAGTGATTATGCTACTGGGGGCCAAACTCATGCGCCAATATACATCACCGGAGTTATTGAAGTTGGCAATGCAGAAATTGCAGTATTGGACAGTGATCTTGGAAGCATTGAAACCCAAAACACGCTAGATTTAACTGGAAATGGTGTAGTTTCACTATCAGCTAACCACCTGGCAAAGTTACGGTTGTCTTTTCAATTGACGACATCTCATGGTCATGCTTTTAAGCCTCAACAGGCATTTCTCAAGTTGAGACATGAGACAAATGTTGAGCACATATTTGTGGACTTTCTTGGTTTGGTGGAGAAATTTTATTATCTCTCTGGCAGATATGACATTGAGCTGACAATTGGAGATGCTGTCATGGAAAACTCTTTCCTGCGACCTCTTGGCCATGTTGAATTGGATCTTCCAGTAGCTCCTGAGAAGGCAGCCCGTCCCCCACCACCACCATTCGATCCTTACTCAAGATATGGGCCCAAAGCAGAGATAACTCACTTATTTAGGGCTCCTGAAAAGCGACCACCTCACAATGTGTCTCTCACTTTCTTGAGTTTGACCCTTCTGCCTTTTGTTGGCTTTTTGGTTGGGGTAAGTCTTGTTAAAATACTCAAAGCTGCTACACTATTACTCTTAGGAGTGAACCCTTCAGCAACAGTACCTGCTACATATGCCATCCTCTTCCATGCTGGCATTGCTGCAGTTCTGTTACTTTATTTATTTTTCTGGTTACAGCTGGACCTGTTCACTACGCTGAAAACACTGGGTATTTTGGGAGCCTTTTTAATGTTTGTGGGACATGGAATTTTATCTCATCTGGCTTCTTCATCAGCCAAGTCGAAGTCTGCCTGA 2211 0.4251 MEEGLRYGSKHKYARDALKKEDSFDGLRDPLSLHFHSSWFIGGVGMFLAQGFALWLCPFVPLFLLRDCSTQLLLLDYTNFGXYLSCGLGWLPTEFAHAHTSVRLEDAYDALRVFEILAVEKKPDVSTTTCPRVLENLGSSSPLKDLFYALKVNSLLKCGVDEEVFKDHASNADVLLADADGTFRSIKALSQSDGRWRYSSTNPDPSTYAAGNGLNGLALEALAGVVSLASSEIDHSRINAVKNDILKLFDRIEYYDDGTFYFDEKIVGPGEQLGSLFTTASVVRGLTAFAAAISGKINLPEDKILGLARFFLGIGIPEDAKDFFNQVEVSIPLILSVPTTVYSLAQKEQLKVRVNTVLGGAAPPLTVKLVRAFRTGSKGSAVFESKVSDDYLVIFLSLLCSILCCLSTPPFACAQELQYEPTSGLHVLDVFSENVDVGSFVFVFEMVLEDSNRRSDYATGGQTHAPIYITGVIEVGNAEIAVLDSDLGSIETQNTLDLTGNGVVSLSANHLAKLRLSFQLTTSHGHAFKPQQAFLKLRHETNVEHIFVDFLGLVEKFYYLSGRYDIELTIGDAVMENSFLRPLGHVELDLPVAPEKAARPPPPPFDPYSRYGPKAEITHLFRAPEKRPPHNVSLTFLSLTLLPFVGFLVGVSLVKILKAATLLLLGVNPSATVPATYAILFHAGIAAVLLLYLFFWLQLDLFTTLKTLGILGAFLMFVGHGILSHLASSSAKSKSA 736
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele08g1221 736 Pfam Oligosaccharyltransferase subunit Ribophorin II 98 728 IPR008814 GO:0006487|GO:0008250|GO:0016020
Lele08g1221 736 PANTHER RIBOPHORIN II 95 735 IPR008814 GO:0006487|GO:0008250|GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele08g1221 Lele-ChrLele08 7694351 7703571 Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele13g1905 13 26765390 26769149 Lele08g1221 08 7694351 7703571 CCT
Lele14g1842 14 25113262 25116662 Lele08g1221 08 7694351 7703571 CCT
Lele15g0503 15 2952971 2956724 Lele08g1221 08 7694351 7703571 CCT
Lele16g0524 16 2895514 2898938 Lele08g1221 08 7694351 7703571 CCT
Lele08g1221 08 7694351 7703571 Lele08g1221 08 7694351 7703571 ECH
Lele05g1364 05 8554221 8569824 Lele08g1221 08 7694351 7703571 hybridization
Lele06g1225 06 7726175 7735254 Lele08g1221 08 7694351 7703571 hybridization