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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele49g0687 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1469
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele49g0687 1469 ProSiteProfiles Phosphatidylinositol-specific phospholipase X-box domain profile. 548 599 - -
Lele49g0687 1469 PANTHER RABCONNECTIN-3B, ISOFORM A 3 1468 - -
Lele49g0687 1469 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 9 159 IPR036322 GO:0005515
Lele49g0687 1469 Pfam WD domain, G-beta repeat 543 588 IPR001680 GO:0005515
Lele49g0687 1469 Gene3D - 458 802 IPR015943 GO:0005515
Lele49g0687 1469 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 540 703 IPR036322 GO:0005515
Lele49g0687 1469 Gene3D - 2 261 IPR015943 GO:0005515
Lele49g0687 1469 SUPERFAMILY ARM repeat 953 1283 IPR016024 -
Lele49g0687 1469 SMART WD40_4 639 686 IPR001680 GO:0005515
Lele49g0687 1469 SMART WD40_4 540 588 IPR001680 GO:0005515
Lele49g0687 1469 SMART WD40_4 591 636 IPR001680 GO:0005515
Lele49g0687 1469 SMART WD40_4 1334 1370 IPR001680 GO:0005515
Lele49g0687 1469 SMART WD40_4 53 113 IPR001680 GO:0005515
Lele49g0687 1469 SMART WD40_4 5 44 IPR001680 GO:0005515
Lele49g0687 1469 ProSitePatterns Trp-Asp (WD) repeats signature. 575 589 IPR019775 -
Lele49g0687 1469 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 547 597 IPR001680 GO:0005515
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele49g0687 Lele-ChrLele49 4159184 4167591 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele49g0687 49 4159184 4167591 Lele49g0687 49 4159184 4167591 ECH
Lele49g0687 49 4159184 4167591 Lele51g0706 51 4251835 4260292 hybridization
Lele49g0687 49 4159184 4167591 Lele52g0711 52 4463207 4473465 hybridization