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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele26g0668 ATGGAGCCGGACGTGAGCATTGAGAGCTCGTCGAGGATCCAGGTGGCGGTACTGCCAATCGGGACGGTGCCGTCGAATATGCTACGGGACTATTATTCTATGCTGCTTTCTCTACACACGATACCTCTCTCGGCAATCAGCTCCTTCTACACAGAGCACCAGAAATCACCGTTCGGTCATCAGCCATGGGACTCGGGGTTCCTCCAGTTTAAATTTGTTCTGGGAGGGGCACAACCGAGCCCATGGGAGGACTTCCAATCTCATCGTAAGACCCTGGCGGTCATAGGCATTTGCCATTGCCCTTCCTCGCCCGATCTTGATTCTGTCATCGAACAATTTTCTAATTCCTGCAAGTCTTACCCTTCATCGCTTGTCGATCGCTGCTTTGCATTTTGCCCAGATGATTCGCAGCTTGAGGATGGAGGTAAAAAGGGCGGTAATTTAAGGTTGTTTCCCCCCGCTGATCGTCAAACACTGGAGTTCCACTTGAACACTATGATGCAAGAAGTTGCTGCCTCGTTATTGATGGAATTTGAAAAGTGGGTGCTTCAGGTCGAATCTTCAGGCACCATACTCAAGACCCCTTTGGATTCTCAAGCGAGTCTCAGCTCAGAGGAGGTCATTAAGGCTAAAAAACGAAGGCTTGGGCGTGCACAGAAAACAATAGGTGATTATTGCTTGCTGGCCGGATCGCCAGTTGATGCAAATGCCCATTATTCTACTGCATTGGAACTTGCCAGGCTGACCGGGGATTACTTCTGGTATGCCGGCGCACAGGAGGGGAGCGTTTGTGCCTTGCTCATTGATCGCATGGGCCAGAAAGATTCAATCTTGGAGGAGGAAGTTAGATACCGTTACAACAGCGTAATCTTGAATTACAAGAAGTCTCAAGATAATGCTCAGAGAGTCTCTCCCCTAAGTTTTGAACTTGAAGCTACTTTGAAATTGGCAAGGTTTCTTTGCAGGAGAAAGCTGGCGAAGGAGGTGACAGAGTTGTTGACCAATGCTGCAGATGGTGCTAAATCTTTAATAGATGCTAGTGATAGACTCATATTGTTTGTTGAAATGGCTCGTTTATATGGCAGTCTTGGTTACGAGAGAAAAGCTGCTTTTTTTACTAGGCAGGTTGCTCAATTATATCTGCAGCAAGATAATCGGTTGGCTGCAATTAGTGCTTTGCAAGTTTTGGCGCTGACCACTAAAGCTTATCATGTTCAAAGTAGAGCATCAGTAGTTGAGAATTCTGTACCTAATAAGGGAATCGGATCAAGTAATGCAGATAGTGGGAAAAAATACCCCCAATCAGCAGTCTCACTATTTGAGTCTCAGTGGAGCACCCTTCAGATGGTGGTATTAAGAGAAATTCTGCTTTCTGCTGTTCGTGCTGGAGATCCTCTTGCTGCATGGAGTGCATCAGCAAGACTACTCAGATCTTATTATCCTCTAATTACTCCTGTTGGGCAAAATGGCCTAGCTAGTGCACTTAAAAATTCAGCTGAAAGGCTGCCACCGGGGACTCGTGCTGCTGATCCTGCCTTACCTTTTATAAGGTTGCATTCTTTTCCTCTCCATCCAACACAAATGGACATTGTTAAACGCAACACAGCTAGGGAAGACTGGTGGGCAGGTTCTGCTCCTTCGGGCCCTTTCATTTATACACCATTTAGCAAAGGAGAGTCCAATAATGTTAAGAAGCAGGAGCTTATTTGGATTGTTGGAGAGCCTGTTCAAGTCTTGGTGGAATTGGCAAATCCATGTGGCTTTGATTTGAAGGTTGATAGCATCTATTTGTCTGTGCATTCAGGAAATTTTGATGCTTTCCCTGTGAGCGTAAGCCTTCCACCTAATTCGTCAAAAATGATCACCTTATCAGGAATCCCAACATCTGTGGGAGTAGTTACAGTTCCTGGGTGCATTGTTCATTGTTTTGGTGTTGTTACTGAACACCTTTTTAAAGATGTTGACAATCTGCTTCTTGGAGCAGCGCAAGGACTTGTCCTCTCTGATCCTTTCCGCTGCTGTGGATCTCCAAAGTTAAAAAATGTGTCTGTTCCAAATATTTCTGTTGTGCCACCACTTCCATTGCTGGTGTCACGTGTTGTTGGGGGTGATGGTGCTATCATTTTGTATGAAGGTGAAATTCGTGATGTGTGGATATGTCTGGCTAATGCAGGCACAGTTCCAATTGAGCAGGCACATATTTCATTGTCAGGAAAAAATCAAGATGCTGTGCTTTCATATTCTTTTGAAACTTTAAAGTCTTGCCTCCCCCTAAAGCCTGGAGCAGAAGTGACTTTACCAGTGACCTTGAGAGCTTGGCAGGTTGGTTTGGTGGATCCAGATACCAGTGCCGCGAAGGCTGCCTCTGGAAGCACTATGAGGCATGTTAAAGATGGAATCGGCCCATCATTATTGATACATTATGCTGGTCCGCTGCAAACCTCTGGCAATCCTCAAAGTAATGGATCTAATGTGCCCCCCGGTAGGCGCCTTGTTGTTCTTTTCCATATTTGTGTTTTGCCGGGCTTGTCTTTTGTTAAGGCTCGGCTGCTGTCAATGGAGTTTCCTGCTCATGTTGGTGAGAATCTTCCCAAGCTGGCTGATACAAATAGTAATTCCAACGGAGGGCATGTTGACTCTCAGACAAAAATGGACAGATTGGTGAAAATTGATCCTTTCAGAGGAAGTTGGGGACTGCGATTTCTTGAACTTGAGCTGTCTAACCCCACTGATGTTGTATTTGAAATTAGTGTTACTGTCAAACTGGAGCACTCTAGCAATGAGGACAATCTTTCTGGTGATCAGGATGCCGCTGAATATGGCTATCCTAAAACAAGAATAGATAGGGATTGCTCCGCCAGGGTTCTAGTGCCTCTTGAGCATTTTAAACTACCAGTTCTTGATGATTCCTTTTTCATGAAGGATATTCGGGCAGATGGTGTTGGTGGAGGCAGGAATACGACGTTCTCAGAGAAGAACACTAAAGCTGAACTTAATGCCTGTATCAAGAACCTTGTATCTAGGATTAAAGTTAGATGGCATTCAGGACGCAATAGCTCTGGAGAGTTGAATATTAAGGATGCCATCCAGGCTGCTCTTCAAACCTCAATTATGGATGTCCTGCTGCCCGATCCATTGACCTTTGGCTTCAGGCTTGTCAGAAATGATTTTGATTCAGAAAAAGAATCCAATGTTGATGATGTGCAATCTCGTGCATCAAAAGATTCTGTGCTTGCACATGAAATGACGCAAATGGAGGTTCTTGTCCGTAATAATACAAAGGATTTGATTAAAATGAATCTTAACATTACTTGCAGAGATGTAGCCGGGGAAAATTGTGTAGATGGGGCAAAGGCAACTGTTCTATGGACTGGTGTTCTAAATGATATTACTATGGAGATCCCCCCACTTAAAGAAGTCAAACATTCTTTCTGCTTGTATTTTCTTGTTCCGGGAGAGTATACCCTTGCAGCTGCAGCAGTGATCAATGATGCAAATGACATTCTCAGGACTCGAGCTAGGACCATTTCGGCTGACGAGCCAATCTTCTGTCGGGGACCACCGTATCATGTTCGTGTTCTTGGGACCGCATGA 3594 0.4499 MEPDVSIESSSRIQVAVLPIGTVPSNMLRDYYSMLLSLHTIPLSAISSFYTEHQKSPFGHQPWDSGFLQFKFVLGGAQPSPWEDFQSHRKTLAVIGICHCPSSPDLDSVIEQFSNSCKSYPSSLVDRCFAFCPDDSQLEDGGKKGGNLRLFPPADRQTLEFHLNTMMQEVAASLLMEFEKWVLQVESSGTILKTPLDSQASLSSEEVIKAKKRRLGRAQKTIGDYCLLAGSPVDANAHYSTALELARLTGDYFWYAGAQEGSVCALLIDRMGQKDSILEEEVRYRYNSVILNYKKSQDNAQRVSPLSFELEATLKLARFLCRRKLAKEVTELLTNAADGAKSLIDASDRLILFVEMARLYGSLGYERKAAFFTRQVAQLYLQQDNRLAAISALQVLALTTKAYHVQSRASVVENSVPNKGIGSSNADSGKKYPQSAVSLFESQWSTLQMVVLREILLSAVRAGDPLAAWSASARLLRSYYPLITPVGQNGLASALKNSAERLPPGTRAADPALPFIRLHSFPLHPTQMDIVKRNTAREDWWAGSAPSGPFIYTPFSKGESNNVKKQELIWIVGEPVQVLVELANPCGFDLKVDSIYLSVHSGNFDAFPVSVSLPPNSSKMITLSGIPTSVGVVTVPGCIVHCFGVVTEHLFKDVDNLLLGAAQGLVLSDPFRCCGSPKLKNVSVPNISVVPPLPLLVSRVVGGDGAIILYEGEIRDVWICLANAGTVPIEQAHISLSGKNQDAVLSYSFETLKSCLPLKPGAEVTLPVTLRAWQVGLVDPDTSAAKAASGSTMRHVKDGIGPSLLIHYAGPLQTSGNPQSNGSNVPPGRRLVVLFHICVLPGLSFVKARLLSMEFPAHVGENLPKLADTNSNSNGGHVDSQTKMDRLVKIDPFRGSWGLRFLELELSNPTDVVFEISVTVKLEHSSNEDNLSGDQDAAEYGYPKTRIDRDCSARVLVPLEHFKLPVLDDSFFMKDIRADGVGGGRNTTFSEKNTKAELNACIKNLVSRIKVRWHSGRNSSGELNIKDAIQAALQTSIMDVLLPDPLTFGFRLVRNDFDSEKESNVDDVQSRASKDSVLAHEMTQMEVLVRNNTKDLIKMNLNITCRDVAGENCVDGAKATVLWTGVLNDITMEIPPLKEVKHSFCLYFLVPGEYTLAAAAVINDANDILRTRARTISADEPIFCRGPPYHVRVLGTA 1197
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele26g0668 1197 PANTHER TRAFFICKING PROTEIN PARTICLE COMPLEX SUBUNIT 9 1 1191 IPR013935 -
Lele26g0668 1197 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 327 741 IPR013935 -
Lele26g0668 1197 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 201 278 IPR013935 -
Lele26g0668 1197 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 9 196 IPR013935 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele26g0668 Lele-ChrLele26 4244422 4250786 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele26g0668 26 4244422 4250786 Lele27g1428 27 20524706 20532109 hybridization
Lele26g0668 26 4244422 4250786 Lele28g0652 28 4164669 4171049 hybridization