Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vra9g0555 ATGCCTTTGAATTCGATTCTTTGGTGTCAACTCAACACGATTATTCTCAGTGTGTTGTTTCTTTTTTGTTGTTCTCTTGGCCTCAGCTCCGCTAACGATGAATTGGTTGGAGTCACTGATGATGTCTTCACTGTTTCCAGCTTTAGCTACCCTCAGACTACTCTCGGACCCTTTGATATGCGCTACATCAGAGTTGACATACCACCATGGTTTTCTGCAGTGTCCTTAGCATTGAACTCAGATGTAGACCTTGATGTTTCAAGAGTTGAAAGGATTCCAAAAAGCTCACTGCCGATCATATGCTTTAGAGATGGCAGCCCTCCTCTGCCAGATGCTTTAAACATATCTCTGAAGGATTCGGCTGTCATAGGAATAAATGGTCTTGACAACGAGCAGTGTTTTCCTATGGAGAAAAACATCACTATGAAATTGACAAACGAACAGATATCTCCAGGTGCATGGTATATTGGTCTTTTCAACGGAATTGGAGCTGCAAGAACACAATCGAGGATGATTATCCGTGGCTCAGCATACTCATTCAGTGCCAATATAAGTGTGGAAGCATGCTCAAATTCAATGATGAAAGGGGAGCTATGTAACAGTACAGTCTATCCACTTTCATGCACAGTATCTGATGCCTATAATTCCGTGAAGGCTACAGTGACGAAGCCACTGATGAAAAATGTGGTGACCTGTAAAAGTAATGTAGATACATTTTGTGCACAGGAAGGTGTACCAGAACTTTACTCTCTGGATGTAACAAATATGGCAGAAGAATTGACCATTACGGTAGCAAATGTCAAATTCAATACTACAACTTCAAATAACACTTCTAGTGCAAATGATGTCAGTTTAATGGGTTTTGTTCGCCATGGTGCAATTCCTTCAGAAACTTTGCATGATTATTCCGGTGATTTAAATAAGGCCCCTTTGATTATCCGTTATCCACTGATTGGACGTTTGTACATTAGTATAGTACCGGTTAATGTTTCAAAAAAGTTTGGAGGGACTTTGGATGGCAATTTAAAAGTTTGTTACTCCATGGAATCACAAGTACATCAGTGTGCACTTGGAAGAGCGGGACCAAATTGCACAATGGACAGCTACACACTTCAGACAGTTCTAAGGAGAGGAGGTCCAATTCCCTTTGAATCATATTTCTTACCTGTGGCTGGTGGTGAAGGAGCGTCTTCTGCCAATTTTCCTCTTGAGCCACTTTTAAAAAAGTCATCAAATGAGAGAAGAAATGATGACATTTGGACTTATTTTACTTTGGACATTCCCCGTGGTGCAGCTGGAAGGAACATTCACATACGATTATCAGCAGATGTGAAGATCAGTTATGAAGTCTATGCTAGATTTGGTGGTTTGCCTTCTCTTGATAACTGGGACTATTATTATGCTAACAGGACAAGGAAGAGTGACCAGTCCATGTTTTTCATGCTATATGATTCAAGTGATGACAAGATTGATTTTTACATTATTTATGCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTAGGTCTAAGGCATCTTTATACCAGTACTGATTCTATGAAAGCGCAAACATCTATGTCTGTTTCACTTGAAGGATGCCCAAAACAATGTTCCTTTAATGGAGACTGTAGATATTCTTTTGATGCCAGTGGATTGACATCGTTCAGCTTCTGCTCCTGTGATCGAAACCATGGTGGCTTTGACTGTAGCATTGAAATTGTATCACACAAAGGGCATATACTGCAATCCATTTTTCTCATTGGATCAAACGCTGCAGCCATACTTCCTGCCTATTGGTCCCTTAGGGAAAAGGCATTTGCGGAATGGATTTTATTCACATCCAGTGGAATCGCTAGTGGGATATATCACGCATGTGATGTTGGCACCTGGTGTGCATTGAACTATAATGTTTTACAGTTCATGGATTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTGGTTAGCACTTTTGTATACCTGGCAACCATTGATGAAGTATATAAGAGGGCAATCCACACAGCTGTTGCTATCCTCACTGCCCTCTTGGCTGCAACTAAGGCAACTAGGTCTTCCAATATTATTCTTGTCATTGTGATTGGAGCTCTTGGTCTTCTTGTTGCATGGTTGATTGAAATCTCAAAAAGATATAGGTCCCTCTCCTTTTCATCTGGATTATCACTAAGTTTCCTTCAAAGCATGCAAACTATGAAGCAATGGTTCTGCAATTTGGTGAAGACACTTTTGAGACGGTTTCGCTGGGGTTTTATAGTGGTTGGTTTCATTGCATTGGCCATGGCAGGATTAAGCTGGACACTTGAAACAAGTGCAAACTACTGGTTTTGGCACAGCTTTTGGCATGCTACAATATACACATCTTCTTTCTTCTTCCTTTGCTCAAAAGCAAACATTGTTGATGATGAAGTTTCACCACCTTCAAGTGGAAATTATGCACTGACTCGTCAGGATTCATTTTCAAGAGGTATTTAG 2466 0.4063 MPLNSILWCQLNTIILSVLFLFCCSLGLSSANDELVGVTDDVFTVSSFSYPQTTLGPFDMRYIRVDIPPWFSAVSLALNSDVDLDVSRVERIPKSSLPIICFRDGSPPLPDALNISLKDSAVIGINGLDNEQCFPMEKNITMKLTNEQISPGAWYIGLFNGIGAARTQSRMIIRGSAYSFSANISVEACSNSMMKGELCNSTVYPLSCTVSDAYNSVKATVTKPLMKNVVTCKSNVDTFCAQEGVPELYSLDVTNMAEELTITVANVKFNTTTSNNTSSANDVSLMGFVRHGAIPSETLHDYSGDLNKAPLIIRYPLIGRLYISIVPVNVSKKFGGTLDGNLKVCYSMESQVHQCALGRAGPNCTMDSYTLQTVLRRGGPIPFESYFLPVAGGEGASSANFPLEPLLKKSSNERRNDDIWTYFTLDIPRGAAGRNIHIRLSADVKISYEVYARFGGLPSLDNWDYYYANRTRKSDQSMFFMLYDSSDDKIDFYIIYAREGTWGLGLRHLYTSTDSMKAQTSMSVSLEGCPKQCSFNGDCRYSFDASGLTSFSFCSCDRNHGGFDCSIEIVSHKGHILQSIFLIGSNAAAILPAYWSLREKAFAEWILFTSSGIASGIYHACDVGTWCALNYNVLQFMDFWLSFMAVVSTFVYLATIDEVYKRAIHTAVAILTALLAATKATRSSNIILVIVIGALGLLVAWLIEISKRYRSLSFSSGLSLSFLQSMQTMKQWFCNLVKTLLRRFRWGFIVVGFIALAMAGLSWTLETSANYWFWHSFWHATIYTSSFFFLCSKANIVDDEVSPPSSGNYALTRQDSFSRGI* 822
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vra9g0555 821 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 15 819 IPR021910 GO:0016021
Vra9g0555 821 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 575 779 IPR021910 GO:0016021
Vra9g0555 821 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 554 565 IPR000742 -
Vra9g0555 821 PANTHER TRANSMEMBRANE PROTEIN-LIKE PROTEIN 15 819 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vra9g0555 Vra-Chr9 6096355 6104034 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vra9g0555 - - gmx:100777848 1405.58
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vra4g0794 4 14776652 14784899 Vra9g0555 9 6096355 6104034 PCT