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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun8g00780 ATGTCTAAAGTTCTCGGCTTTTCCGGAGGTGATGACTTTTGCCCTGGGGGATCAATATACGCCAACCCCAAGGAAGCAAGTTTCTTCCTTCCCCTTGGCCCTCAAGTTGATGTGTACTTTCCTCCTAGGAAGAGATCACGCGTCAACGCTCCGTTCGTTTTGGATGGAGAATGGTTTGAGCAAAAGCAAAAAACCTCTATTGAAGGCTTACCAGATGAGTGTCTCTTTGAGATCTTCAGAAGGTTGCCCGCTGGCGAGGACAGGAGTGCATGTGCTTGCGTTTCCAAGCGCTGGCTTATGCTTCTGAGCAGTATTTGCAAAGATGAAATCTGTGCCAAGAAAAACACCAGCGCAGAAAACATCGAAAAGGATGGTGATGATGTAGAATTTGGAGGTGAGGGATACCTCTCTCGGAGCTTGGAAGGAAAGAAGGCCACGGATGTTAGACTGGCTGCCATAGCTGTTGGAACTGCATCTCGCGGAGGATTGGGGAAGCTTTCCATCCGAGGAAGCAACATGTGCCGCGGGGTGACTAGTCTTGGTCTCAGAGCAGTTGCTCATGGATGCCCTTCTTTGAAGTCTTTTTCTCTATGGAACGTTTCTAACGTTGGTGACGAAGGCCTAACCGAGATTGCTAACGGTTGTCACCAGCTAGAAAAGCTCGACCTTTGCAAGTGCCCTGCTGTTACTGATAAGGCTTTGGTTGCAATTGCAAAGAACTGCCAGAATCTGACTGAGCTTTCTTTGGAATCATGCCCTAATGTTGGTAATGAAGGTCTGCGAGCTATTGGCAAGTTCTGCCCCAACCTAAGATCCGTAACCATCAAGGACTGCACAGGTGTTAGCGATCAGGGAATTGCTGGATTGTTCTCAAGTTCTTTGGTTCTGACAAAGGTGAAGCTCCAAGCACTGTCTGTGTCAGATCTCTCTCTAGCCGTTATTGGACATTATGGGAAGTCTGTTACTGATCTTGTCCTTAATTGCCTCCCAAATGTCAGCGAGAAGGGGTTCTGGGTAATGGGAAACGGTAGTGGGTTGCAGAAGCTGAAGTCACTCACAGTTTCATCATGCAGGGGAGTAACTGATATTGGACTTGAAGCTGTGGGAAAGGGTTGCCCAAATCTGAAAATTGCACACCTTCACAAGTGTGCCTTTCTGTCAGACAATGGGTTGATTTCGTTTGCTAAGGCTGCTTCATCACTCGAGAGCCTTCGATTGGAAGAGTGCCACAGAATCACCCAATTTGGGTTTTTTGGTGTCCTTTTTAACTGTGGTGCAAAATTGAAGTCACTCTCGTTGGTGAGGTGCTACGGAATCAAAGACCTGAACTTGGTGCTGCCCACCATATCTCCTTGTGAATCACTTAGGTCATTGACCATCTCCAACTGCCCTGGATTTGGCGACGCCTCCCTCTCTGTACTGGGAAAGCTGTGCCCTAAGCTTCAGCATGTTGAACTGAGTGGACTAGATGGAGTGACCGATGCCGGGGTTGTTCCACTGCTAGAGAGTTCTGAGGCTGGTTTGGTTAAAGTGAATCTCAGTGGCTGCACAAACGTCACAGACAAAGTAGTTTCATCCTTGGCCAATCTTCATGGTTGGACTCTTGAGAACCTAAACCTTGATGGTTGTAAAAACATCAGTGATGCTAGCTTGATGGCAATTGCTGAAAACTGTGCATTGCTATGCGATCTTGATGTCTCCAAGTGCTCAATCACAGATGCTGGGATAGCAGCCCTGGCAAATGCCCAACAGATTAATCTGCAAATTCTCTCTTTGTCAGGTTGCGCTTTGGTCTCAGACAGGAGCTTACCCGCCTTGAGAAAATTGGGTAGGACCCTTTTGGGATTGAACATCCAGCACTGCAATGCAATTAACAGTGGCACCGTTGACATGCTTGTAGAGCTTCTCTGGAGGTGTGACATCCTCTCATAA 1932 0.4762 MSKVLGFSGGDDFCPGGSIYANPKEASFFLPLGPQVDVYFPPRKRSRVNAPFVLDGEWFEQKQKTSIEGLPDECLFEIFRRLPAGEDRSACACVSKRWLMLLSSICKDEICAKKNTSAENIEKDGDDVEFGGEGYLSRSLEGKKATDVRLAAIAVGTASRGGLGKLSIRGSNMCRGVTSLGLRAVAHGCPSLKSFSLWNVSNVGDEGLTEIANGCHQLEKLDLCKCPAVTDKALVAIAKNCQNLTELSLESCPNVGNEGLRAIGKFCPNLRSVTIKDCTGVSDQGIAGLFSSSLVLTKVKLQALSVSDLSLAVIGHYGKSVTDLVLNCLPNVSEKGFWVMGNGSGLQKLKSLTVSSCRGVTDIGLEAVGKGCPNLKIAHLHKCAFLSDNGLISFAKAASSLESLRLEECHRITQFGFFGVLFNCGAKLKSLSLVRCYGIKDLNLVLPTISPCESLRSLTISNCPGFGDASLSVLGKLCPKLQHVELSGLDGVTDAGVVPLLESSEAGLVKVNLSGCTNVTDKVVSSLANLHGWTLENLNLDGCKNISDASLMAIAENCALLCDLDVSKCSITDAGIAALANAQQINLQILSLSGCALVSDRSLPALRKLGRTLLGLNIQHCNAINSGTVDMLVELLWRCDILS 643
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun8g00780 643 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 255 440 IPR032675 -
Viun8g00780 643 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 136 254 IPR032675 -
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Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 215 240 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 452 477 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 372 397 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 267 292 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 505 530 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 398 423 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 478 503 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 189 214 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 346 371 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 532 557 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 558 582 IPR006553 -
Viun8g00780 643 SMART LRR_CC_2 584 609 IPR006553 -
Viun8g00780 643 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 446 643 - -
Viun8g00780 643 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 442 643 IPR032675 -
Viun8g00780 643 Pfam F-box domain 69 107 IPR001810 GO:0005515
Viun8g00780 643 SUPERFAMILY RNI-like 174 294 - -
Viun8g00780 643 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 254 443 - -
Viun8g00780 643 PANTHER UNCHARACTERIZED 534 626 - -
Viun8g00780 643 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 135 253 - -
Viun8g00780 643 Gene3D - 60 111 - -
Viun8g00780 643 CDD F-box_AtTIR1-like 70 104 - -
Viun8g00780 643 SMART fbox_2 70 111 IPR001810 GO:0005515
Viun8g00780 643 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 60 109 - -
Viun8g00780 643 SUPERFAMILY RNI-like 311 639 - -
Viun8g00780 643 Pfam Leucine Rich repeat 347 368 IPR001611 GO:0005515
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Viun8g00780 643 Pfam Leucine Rich repeat 564 580 IPR001611 GO:0005515
Viun8g00780 643 SUPERFAMILY F-box domain 63 104 IPR036047 GO:0005515
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun8g00780 Viun-Chr8 6821254 6824846 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Viun8g00780 K14515 - gmx:100820247 1160.98
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Viun8g00780 8 6821254 6824846 Viun8g00780 8 6821254 6824846 ECH
Viun8g00780 8 6821254 6824846 Viun9g03080 9 38403670 38407239 PCT