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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun7g01181 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4302 0.4335 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1433
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun7g01181 1433 ProSiteProfiles HEAT repeat profile. 83 121 IPR021133 -
Viun7g01181 1433 PANTHER CLASP 32 1419 - -
Viun7g01181 1433 MobiDBLite consensus disorder prediction 1026 1052 - -
Viun7g01181 1433 FunFam Protein peg1 266 513 - -
Viun7g01181 1433 Pfam HEAT repeat 160 187 IPR000357 GO:0005515
Viun7g01181 1433 Gene3D - 792 1016 IPR011989 -
Viun7g01181 1433 MobiDBLite consensus disorder prediction 607 628 - -
Viun7g01181 1433 Gene3D - 1 222 IPR011989 -
Viun7g01181 1433 Gene3D - 1218 1425 IPR011989 -
Viun7g01181 1433 Pfam CLASP N terminal 798 992 IPR024395 -
Viun7g01181 1433 Pfam CLASP N terminal 285 500 IPR024395 -
Viun7g01181 1433 SUPERFAMILY ARM repeat 290 1423 IPR016024 -
Viun7g01181 1433 ProSiteProfiles HEAT repeat profile. 160 198 IPR021133 -
Viun7g01181 1433 SMART TOG_3 282 514 IPR034085 -
Viun7g01181 1433 SMART TOG_3 3 224 IPR034085 -
Viun7g01181 1433 SMART TOG_3 779 1024 IPR034085 -
Viun7g01181 1433 SMART TOG_3 1202 1425 IPR034085 -
Viun7g01181 1433 Coils Coil 10 30 - -
Viun7g01181 1433 Gene3D - 267 507 IPR011989 -
Viun7g01181 1433 SUPERFAMILY ARM repeat 2 402 IPR016024 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun7g01181 Viun-Chr7 13389480 13409696 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Viun7g01181 K16578 - gmx:100775793 2514.95
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Viun7g01181 7 13389480 13409696 Viun7g01181 7 13389480 13409696 ECH
Viun1g02214 1 33201118 33212787 Viun7g01181 7 13389480 13409696 PCT