Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu9g01602 ATGGTTTTTAATTTTTATCCAATAAATTTGGCAAGCATTTTCCAACACAACATGGCTCCTAATCCGAGGCCCAAGTTGGTTGTTCCATTCTTCATGTTACTGTTAATGCTTCTTTCCTTTGGTTGTTCCAATGCTGAATTGGAACAGGAGCTCGGAGCTGCTCCTCATACGAAGGTAATTGTTGGCACTGCTGGGGAGAATTCCCTCAAGTTAGAGGAAATCAATGGCAGAAAAGGTGGAGGCAGTAGTAGAGTTTCCGTTTCCACGGTTGCATTGTTCACCTTAGCAATGGCAGCTGCCACTGGTTTAGGGGCTCTGCCCTTCTTCTTTGTGGAGCTTGATCCACGATGGGCAGGGTTGTGTAATGGAATGGCAGCTGGTGTTATGTTGGCTGCAAGCTTTGATCTCATACAGGAAGGTCAATATTATGGTACTGGAAACTGGGTTGTCATTGGAATTCTAGCTGGTGGCACCTTTATTCGGCTGTGTAAGAAGTTTCTTGAGCTATATGGGGAAGTAAGCATGTTGGATATAAAGGGTGCCGATGCAACTAAAGTTGTTCTTGTAATTGGAATAATGACTCTCCATTCTTTTGGGGAAGGATCTGGGGTTGGGGTCTCCTTTGCTGGCTCAAAGGGTTTCTCTCAAGGTTTATTGGTAACTTTGGCTATTGCTGTGCATAACATTCCAGAGGGATTGGCTGTGAGCATGGTGCTGGCATCAAGGGGTGTCTCTCCACAGAAAGCTATGTTGTGGAGCGTTATTACATCTTTACCTCAGCCAATTGTAGCCGTTCCTTCATTTATTTGTGCTGATGCATTTAGTAAGTTCCTGCCATTTTGTACTGGGTTCGCTGCTGGATGCATGATCTGGATGGTTGTTGCAGAAGTGCTTCCTGATGCATTCAAGGAAGCCTCTGCTTCACAAGTTGCATCGGCTGCAACAATTTCGGTAGCATTTATGGAAGCTCTAAGCACCCTTTTTCAGAATTTCAACCGTGACAACAACTCTGAGGATGCTTCTGGCTTCTTTGTTTCATTACTTTTTGGCCTTGGCCCATTACTTGGTGGGATTATTCTGGTTGTATTTGCTCTTGCTCTTCGTCTTCGGCATACTATCCTGATGGGTATAGCATGTGGTATTGCCTTTGTTCTTGGTGCCTGGCGACCAGTGCAGCTAATTTTGTCTTCAAAATTAGGATTTGTTCCTGTTTTGTTACTCCTTGCAACGGGCGCTGCTTTAGTTCATTTTTCCAGCTCTGGTGTATTGAAGGTGGCAGCTCGCAAGAAAACCTCAGTCAATGACTTGCCTTCATTAACAGGCTTCCCTGTGAGTGTTCAAACCCTTCAATCATTTGTATCATGTGGTGCAGTTGCTCTACATGCTTTGGCTGAAGGACTTGCGCTTGGAGTAGCTGCACCAAAAGCTTATGGATTTGGTCGTCACATGGTCGTTCCAGTCTCTCTACATGGTCTCCCCCGAGGTGCAGCTGTTGCTAGCTGCATCTATGGTGCTACTGATAGTTGGCATGGTTCTCTTGCAACAGCTGCCATAATTGGATTTATGGGTCCAATATCAGCAATTGGATCTATTCTTGCTGGGATTGACTACAGTGGCCTTGATCACATAATGGTCCTGGCTTGTGGTGGAATAATTCTAAGTTTTGGAAATGTAGTTAGGAGAGCACTTAGCTTGGACAAGAAAAAAAGCACATGTGGCCTCGTTATGGGAATTGGGTTTGCTACCTTATGCCTAACGTTCACTAAATTAGTTTGCTTGCACACACCTTACTGCAATTCTGCACCAGAGGCTGTCAGATAA 1821 0.4481 MVFNFYPINLASIFQHNMAPNPRPKLVVPFFMLLLMLLSFGCSNAELEQELGAAPHTKVIVGTAGENSLKLEEINGRKGGGSSRVSVSTVALFTLAMAAATGLGALPFFFVELDPRWAGLCNGMAAGVMLAASFDLIQEGQYYGTGNWVVIGILAGGTFIRLCKKFLELYGEVSMLDIKGADATKVVLVIGIMTLHSFGEGSGVGVSFAGSKGFSQGLLVTLAIAVHNIPEGLAVSMVLASRGVSPQKAMLWSVITSLPQPIVAVPSFICADAFSKFLPFCTGFAAGCMIWMVVAEVLPDAFKEASASQVASAATISVAFMEALSTLFQNFNRDNNSEDASGFFVSLLFGLGPLLGGIILVVFALALRLRHTILMGIACGIAFVLGAWRPVQLILSSKLGFVPVLLLLATGAALVHFSSSGVLKVAARKKTSVNDLPSLTGFPVSVQTLQSFVSCGAVALHALAEGLALGVAAPKAYGFGRHMVVPVSLHGLPRGAAVASCIYGATDSWHGSLATAAIIGFMGPISAIGSILAGIDYSGLDHIMVLACGGIILSFGNVVRRALSLDKKKSTCGLVMGIGFATLCLTFTKLVCLHTPYCNSAPEAVR 606
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu9g01602 606 Pfam ZIP Zinc transporter 182 306 IPR003689 GO:0016020|GO:0030001|GO:0046873|GO:0055085
Vimu9g01602 606 PANTHER ZINC/IRON TRANSPORTER 92 316 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu9g01602 Vimu-Chr9 25319921 25323616 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu9g01602 - - vra:106772981 1007.67
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu6g00220 6 2756683 2760704 Vimu9g01602 9 25319921 25323616 PCT