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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu9g00276 ATGCCTTTGAATTCGATTCTTTGGTGTCAACTCAACACGATTATTCTCAGTGTATTGTTTCTTTTTTGTTGTTCTCTTGGCCTCAGCTCCGCTAACGATGAATTGGTTGGAGTCACTGATGATGTCTTCACTGTTTCCAGCTTCAGCTACCCTCAGACTACTCTCGGACCCTATGATTTGCGCTACATCAGAGTTGACATACCACCGTGGTTTTCTGCAGTGTCCTTAGCATTGAACTCAGATGTAGACCTTGATGTTTCAAGAGTTGAAAGGATTCCAAAAAGCTCACTGCCGATCATATGCTTTAGAGATGGCAGCCCTCCTCTGCCAGATGCTTTAAACATATCTCTGAAGGATTCAGCTGTCATAGGAATAAATGGTCTTGACAACGAGCAGTGTTTTCCTATGGAGAAAAACATCACTATGAAATTGACAAACGAACAGATATCTCCAGGTGCATGGTATATTGGTCTTTTCAACGGAATTGGAGCTGCAAGAACACAATCGAGGATGATTATCCGTGGCTCAGCATACTCATTCAGTGCCAATATAAGTGTGGAAGCATGCTCAAATTCAATGATGAAAGGGGAGCTATGTAACAGTACAGTCTATCCACTTTCATGCACAGTATCTGATGCCTATAATTCCGTGAAGGCTACAGTGACGAAGCCAGTGATGAAAAATGTGGTGACCTGTAAAAGTAACGTAGATACATTTTGTGCACAGGAAGGTGTACCAGAACTTTACTCTCTGGATGTAACAGATATGGCAGAAGAATTGACCATTACGGTAGCAAATGTCAAATTCAATACTACAACTTCAAATAACACTTCTAGTGCAAATGATGTCAGTTTAATGGGTTTTGTTCGCCATGGTGCAATTCCTTCAGAAACTTTGCATGATTATTCCGGTGATTTAAATAAGGCCCCTTTGATTATCCGTTATCCACTGATTGGACGTTTGTACATTAGTATAGTACCAGTTAATGTTTCAAAAAAGTTTGGAGGGACTTTGGATGGCAATTTAAAAGTTTGTTACTCCATGGAATCACAAGTACATCAGTGTGCACTTGGAAGAGCGGGACCAAATTGCACAATGGACAGCTACACACTTCAGACAGTTCTAAGGAGAGGAGGTCCAATTCCCTTTGAATCATATTTCTTACCTGTGGCTGGTGGTGAAGGAGCGTCTTCTGCCAATTTTCCTCTTGAGCCACTTTTAAATAAGTCATCAAATGACAGAAGAAATGATGACATTTGGACTTATTTTACCTTGGACATTCCCCGTGGTGCAGCTGGAAGGAACATTCACATACGATTATCAGCAGATCTGAAGATCAGTTATGAAGTCTATGCTAGATTTGGTGGATTGCCTTCTCTTGATAACTGGGACTATTATTATGCTAACAGGACAAGGAAGAGTGATCAGTCCATGTTTTTCATGCTATATGATTCAAGTGATGACAAAATTGATTTTTACATTATTTATGCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTAGGTCTAAGGCATCTTTATACCAGTACTGATTCTGTGAAAGCGCAAACATCTATGTCTGTTTCACTTGAAGGATGCCCAAAACAATGTTCCTTTAATGGAGACTGTAGATATTCTTTTGATGCCAGTGGATTGACATCGTTCAGCTTCTGCTCCTGTGATCGAAACCATGGTGGCTTTGACTGTAGCATTGAAATTGTATCACACAAAGGGCATATACTGCAATCCATTTTTCTCATTGGATCAAACGCTGCAGCCATACTTCCTGCCTATTGGTCCCTTAGGGAAAAGGCAAGTTTTGTTCCTTTGTCATCTATTTTTCCTCTAAACTATTTTGTTGCATTTGCGGAATGGATTTTATTCACATCCAGTGGAATCGCTAGTGGGATATATCACGCATGTGATGTTGGCACCTGGTGTGCATTGAACTATAATGTTTTACAGGTTACTGCTCTGCCTTTACTGTTCATGGATTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTGGTTAGCACTTTTGTATACCTGGCAACCATTGATGAAGTATATAAGAGGGCAATCCACACAGCTGTTGCTATCCTCACTGCCCTCTTGGCTGCAACTAAGGCAACTAGGTCTTCCAATATTATTCTTGTCATTGTGATTGGAGCTCTTGGTCTTCTTGTTGCATGGTTGATAGAAATCTCAAAAAGATATAGGTCCCTCTCCTTTTCATCTGGATTATCACTAAGTTTCCTTCAAAGCATGCAAACTATGAAGCAATGGTTCTGTAATTTGGTGAAGACACTTTTGAGACGGTTTCGCTGGCGCTTTATAGTGGTTGGTTTCATTGCATTGGCCATGGCAGGATTAAGCTGGACACTTGAAACCAGTGCAAACTACTGGTTTTGGCACAGCTTTTGGCATGCTACAATATACACATCTTCTTTCTTCTTCCTTTGCTCAAAAGCAAACATTGTTGATAGTGAAGTTTCACCACCTTCAAGTGGAAATTATGCACTGACTCGTCAGGATTCATTTTCAAGAGGTATTTAG 2535 0.4055 MPLNSILWCQLNTIILSVLFLFCCSLGLSSANDELVGVTDDVFTVSSFSYPQTTLGPYDLRYIRVDIPPWFSAVSLALNSDVDLDVSRVERIPKSSLPIICFRDGSPPLPDALNISLKDSAVIGINGLDNEQCFPMEKNITMKLTNEQISPGAWYIGLFNGIGAARTQSRMIIRGSAYSFSANISVEACSNSMMKGELCNSTVYPLSCTVSDAYNSVKATVTKPVMKNVVTCKSNVDTFCAQEGVPELYSLDVTDMAEELTITVANVKFNTTTSNNTSSANDVSLMGFVRHGAIPSETLHDYSGDLNKAPLIIRYPLIGRLYISIVPVNVSKKFGGTLDGNLKVCYSMESQVHQCALGRAGPNCTMDSYTLQTVLRRGGPIPFESYFLPVAGGEGASSANFPLEPLLNKSSNDRRNDDIWTYFTLDIPRGAAGRNIHIRLSADLKISYEVYARFGGLPSLDNWDYYYANRTRKSDQSMFFMLYDSSDDKIDFYIIYAREGTWGLGLRHLYTSTDSVKAQTSMSVSLEGCPKQCSFNGDCRYSFDASGLTSFSFCSCDRNHGGFDCSIEIVSHKGHILQSIFLIGSNAAAILPAYWSLREKASFVPLSSIFPLNYFVAFAEWILFTSSGIASGIYHACDVGTWCALNYNVLQVTALPLLFMDFWLSFMAVVSTFVYLATIDEVYKRAIHTAVAILTALLAATKATRSSNIILVIVIGALGLLVAWLIEISKRYRSLSFSSGLSLSFLQSMQTMKQWFCNLVKTLLRRFRWRFIVVGFIALAMAGLSWTLETSANYWFWHSFWHATIYTSSFFFLCSKANIVDSEVSPPSSGNYALTRQDSFSRGI 844
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu9g00276 844 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 554 565 IPR000742 -
Vimu9g00276 844 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 7 842 IPR021910 GO:0016020
Vimu9g00276 844 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 575 802 IPR021910 GO:0016020
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu9g00276 Vimu-Chr9 3342520 3349715 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu9g00276 - - gmx:100777848 1386.32
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu6g00563 6 6813259 6822051 Vimu9g00276 9 3342520 3349715 PCT