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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Ssu4g2814 atgtctttgcATTCGATTCCGTGGTGTCATCTCAACCTTATTCTTGTCAGTGCGTTGTTACTTTTTTGTTGTTCTCTTGGCCTCTGCTCTGCAAACGATGAACTGGGAGCCACTGATGATGTCTACGCTGTTTCCAGCTTCAGCTACCCTGAGACTACGCTCAGACCCTATGATTTGCACTACATCAGAGTTGATATACCGCCATGGTTTTCTACAGTGTCCATAGCATTGAACTCAGATGTAGAACTTGATGTTACAAGAGCTGAAAGGGTTCCAAAAAGCTCACTGCCAATAATATGCTTTAGAGATGGCAGCCCTCCTCTGCCAGATGCTTTAAACACGTCTCTGAAGGATTCAGCAGTCACAGGAATAAATGGTCTTGATGTCGAACAGTGCTTTCCTATGGAGAAAAATACCACTATGAAATTGACAAACGAACAGATATCTCCAGGTGCTTGGTACATTGGTATTTTCAATGGCATTGGAGCTGCAAGAACACAATCGAAGATGATTATCCGAGGCTCATCATACTCCTTCACTGCCAATATAAGTGTGGAAGCATGCTCGAATTCAATGATGAGGGGGGAGTTATGTAACAGTACAGTCTATCCACTTTCATGCACAACATCTGGTGTCTATAATTCTGTGAAGGCTACTGTGAAGAAGCCAATGATGGAAAATGTGATGACCTGCAAAAGTAACTTGGAAACTTTTTGTGTTCAGGAAGGTGTACCGGAATTTTACTCTTTGGATATAACAAATGTGGCAGAAGAATTGACCATTACGGTGGCAAATGTTAGATTCAATACTACAGCTTCAAATAACATTTCTGGTGCAGATGatgttaatttaatatgttttgctCGCCATGGTGCAATTCCTTCAGAGACTTTGCATGATTATTCTGGTGATTTAAGTAAAGCCCCTCTGATTATCCGTAATCCTCTGATTAGTCGTTTGTACATTAGTATATTACCAGTTAATGTTACAAAAAAGCTTGGAGGGACTCAGGAtggcaatttaaaaatttgctaTTCGATGGAATCACAAGTGCTTCAGTGCCCACTTGGGAAAGCTGGACCAAATTGCACAATGGACAGCTACACACTTCAGACAGTTCTAAGGAGAGGTCCAACCCCCTTTGAATCATATTATTTACCTGTGGCTGTTGGTGAAGGAGCATCTTCTGCCAATTTTCCTCTTGAGCCACTTTTTAATAAGTCATCAAATGCAGGAGAAACTGATGACATTTGGACTTATTTTACATTGGATATTCCTCATGGTGCAGCTGGACGGAATATTCACATACAGCTATCCACAGATGTGAAGATCAGTTATGAAGTTTATGCTAGATTTGGTGGATTGCCTTCTCTTGATAGCTGGGACTATTATTATGCTAACAAAACAAGGAAGAGTGAACAGTCCATGTTTTTCATGCTATATGATTCAAGTgatgacaaaattgatttttacattatttatgcTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTAGGTCTAAGACATCTTTATACCAGCAGTGATTCTTTGAAAACGCAAACTGTCATGTCTATTTCACTTGAAGGATGCCCAAAACAATGCTCCTCTCATGGAGACTGTAAATATTCTTTTGATGCCAGTGGATTGACATCATACAGCTTCTGCTCTTGTGACCGAAACCATGGTGGCTTTGACTGTAGCATTGAAATTGTATCACATAAAGGGCATATACTGCAATCAGTTTTTCTCATTGGATCAAATGCTGCAGCCATACTTCCTGCCTATTGGTCCCTTCGGCAGAAGGCATTTGCAGAATGGGTTTTATTCACATCCAGTGGAATTGCTAGTGGGCTATATCATGCATGTGACGTTGGCACCTGGTGTGCATTGAACTTTAATGTTTTACAGTTCATGGACTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTGGTTAGCACTTTTGTATACCTAGCTACCATTGAAGAAGTATATAAGAGGGCAATCCACACAGCTGTTGCTATCCTTACCGCCCTCTTGGCTGCAACTAAGGCAACTAGGTCTTCCAATATTGTTCTTGTCATTATGATTGGGGCTCTTGGTCTTCTTATTGCATGGTTGATagaattctcaaaaaattatagGTCCCTCTCCTTTTCATTTGGATTACCGCTAAGTTTCCTTCAAAGCTTGCAAACTATAAAGCAATGGTTCTGTAATCTGGTCAAGACACTTTTGAGACGGTTTCGCTGGGGTTTTCTGTTGGTTGGTTTCATTGCATTGGCCATGGCGGGAATAAGCTGGACACTTGAAACCAGTGCAAACTACTGGTTTTGGCATAGCTTTTGGCATGTTACAATATACacatcttctttcttcttcctttgctCAAAAGCAAACATTGTTGATGCTGATAATTCGTCACCTTCAACTGGAAACTATGCACTGACTCGTCAGGATTCATTTCCAAGAGGTGATTAG 2460 0.3931 MSLHSIPWCHLNLILVSALLLFCCSLGLCSANDELGATDDVYAVSSFSYPETTLRPYDLHYIRVDIPPWFSTVSIALNSDVELDVTRAERVPKSSLPIICFRDGSPPLPDALNTSLKDSAVTGINGLDVEQCFPMEKNTTMKLTNEQISPGAWYIGIFNGIGAARTQSKMIIRGSSYSFTANISVEACSNSMMRGELCNSTVYPLSCTTSGVYNSVKATVKKPMMENVMTCKSNLETFCVQEGVPEFYSLDITNVAEELTITVANVRFNTTASNNISGADDVNLICFARHGAIPSETLHDYSGDLSKAPLIIRNPLISRLYISILPVNVTKKLGGTQDGNLKICYSMESQVLQCPLGKAGPNCTMDSYTLQTVLRRGPTPFESYYLPVAVGEGASSANFPLEPLFNKSSNAGETDDIWTYFTLDIPHGAAGRNIHIQLSTDVKISYEVYARFGGLPSLDSWDYYYANKTRKSEQSMFFMLYDSSDDKIDFYIIYAREGTWGLGLRHLYTSSDSLKTQTVMSISLEGCPKQCSSHGDCKYSFDASGLTSYSFCSCDRNHGGFDCSIEIVSHKGHILQSVFLIGSNAAAILPAYWSLRQKAFAEWVLFTSSGIASGLYHACDVGTWCALNFNVLQFMDFWLSFMAVVSTFVYLATIEEVYKRAIHTAVAILTALLAATKATRSSNIVLVIMIGALGLLIAWLIEFSKNYRSLSFSFGLPLSFLQSLQTIKQWFCNLVKTLLRRFRWGFLLVGFIALAMAGISWTLETSANYWFWHSFWHVTIYTSSFFFLCSKANIVDADNSSPSTGNYALTRQDSFPRGD 819
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Ssu4g2814 819 PANTHER TRANSMEMBRANE PROTEIN-LIKE PROTEIN 14 818 - -
Ssu4g2814 819 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 552 563 IPR000742 -
Ssu4g2814 819 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 14 818 IPR021910 GO:0016021
Ssu4g2814 819 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 573 778 IPR021910 GO:0016021
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Ssu4g2814 Ssu-Chr4 71650899 71660000 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Ssu4g2814 - - gmx:100777848 1461.82
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Ssu3g0699 3 16896420 16903534 Ssu4g2814 4 71650899 71660000 PCT