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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca2g00955 ATGGCTTTCTTCAATTTAATTCTCAGTGTTGTGTTGGTCTTGTTTTGTTCCTTTGGCCTCTTCTCTGCAAATGATGAACTGGGTACAGGTGAAAGTGAGACCTTTACTGTTTCAAGCTTCAGCTACCCTCAGACTAGACTCAGACCCTTTGATTTGCGCTATATCAGAGTTGACTTGCCGCCATGGTTTTCAGCAATGTCTATAGCATTGAACTCAGATGTAGACCTTGATGTCTCAAGAATTGAGAGGGTTCCAAAGAGCACACTGCCAATAATATGCTTTAGAGATGGAAGTCCTCCACTGCCAGACGCCTTAAACACATCTCTCAAAGAATCAGTCATCTCAGGGATAAATGGTCTTGATGTGGAGCAGTGCTTTCCTATGCAGAAAAATATCACTATGAAGCTGACAAACAATCAGATATCTCCAGGTGTTTGGTACATTGGTCTTTTCAATGGCATTGGACCTACAAGGACACAGTCGAAAATGATTATCAGAGGCCCTGCATACTCCTTCATTGCCAATATAACTGTTGAAGCATGCACAAATTCAATGATGAAGGGGGATTTCTGTAACAGTACAGTTTATCCACTTTCATGCACTGTATCTGATGTCAATAATGCTTTGGAGGCTATAGTGAACAAACCATTGTCAGAAAATTTAGTAACCTGCAAAAGTAATTTTGGAACTTTCTGTGTTCACGAAGGTGTAGCAAACTTCTTTTCCTTGGATATAATGAACGTGGCAGAAGAATTTACCATTATGGCAGCAAATGTCAGATTCAATGTTACACTTTCAAATAATACTTCTGGTGCAAATGATGTTAGTTTAATGTGTTTTGTTCGTCATGGTGCAATGCCTTCAGTAACTTTGCACGATTATTCCAGTGATTTAAATAAAGTACCCCTGGTTATTCATTCACCATTAATTGGTCGTTGGTACATTAGTATAGTACCAGTCAATCTCACAAAGACTCAGGATAGTGATGTAAGAGTTTGTTATTCAGTAAAATCTCTAGTGCTTCAATGCCCACTTGGGAAAGCTGGACCAAATTGTACAATGGATAGCTACATACTTCAGACGTTTGTAAGGAGAGGTTCAACCCCTTTTGAATCATATTATTTACCAGTTGCTGGAGGCGCATCCTATGATTCTGCCAATTTCCCTCTTGAGCCACTTTTAAGAAACTCATCATATGATGGAGGAACAGATAGCATTTGGACTTACTTTCTTTTGGACATTCCTCGTGGTGCAGCTGGAGGAAATCTTCACATACAGCTATCCTCAGATGTGAAGATTGGTTACGAAGTTTATGCTAGATTTGGTGGATTACCATCTCTTGATAACTGGGACTATTGTTATGTTAACAAGACAAAGAGAAGTGATCCATCTATGTTTTTCATGCTATATGATTCAAGTGATGACAAGGTTAATTTTTATATTATGTATGCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTGGGTCTAAGACATCTTAATACCAGCAGTTCTGCAAAAGGACCAACTATCATGTCTCTTTCACTTGAACGATGCCCAAAACGATGTTCCTCTCATGGTGACTGTAAATTTTCTTTTGATGCTAGTGGATTGACATCATACAGCTTTTGCTCTTGTGATCGAAACCATGGAGGCTTTGACTGTAGCACCGAAATTGTAACACATCAAGGGCATGTACGGCAATCAATTTTTCTCATTGTATCAAATGTTGCAGCCATACTTCCTGCCTATTGGGCCCTTCGGCAAAAGGCATTAGCAGAATGGGTTTTATACACATCCAGTGGAATTTCAAGTGGACTATATCATGCATGTGATGTAGGTACCTGGTGTGCATTGAACTATAATGTCTTACAGTTCATGGACTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTGATTAGCACTTTTCTTTATCTAGCCACCATTGATGAGGTATTTAAGAGGGCAATCCACACAGCTATCGCCATCCTTACTGCCCTAATGGCTGCAACAAAGGCAACTAGGTCTTCCAATGTTGTTCTTGTGATTGTGATTGGTGCTCTTGGTCTCCTTATTGGATGGTTGATAGAGATCTCAACAAAGTATAGGTCCCTTTCCTTTTCAATCAGATTCTCACTTAATTTCTCTCACAGTTTGCAAACTATAAAGCGATGGCTCTGTAATCTTGTCAAGACACTTATGAGACGGTACCACTGGGCTTTTGCATTGGCTGGTTTTGTTACATTGGCAATGGCAGCAATATGCTGGACACTTGAAACCAGTGAAAACTACTGGTTTTGGCATAGCTTTTGGCATATTACAATATACACATCTTCTTTCTTCTTCCTTTGTTCAAAAGCAAATGTTGAGGATAGTGAGAATCAGCTACCTACAAATGGAAACTATGAACTGACTCATCAGGATTCACTTCCAAGAAGTGGTTAA 2424 0.3965 MAFFNLILSVVLVLFCSFGLFSANDELGTGESETFTVSSFSYPQTRLRPFDLRYIRVDLPPWFSAMSIALNSDVDLDVSRIERVPKSTLPIICFRDGSPPLPDALNTSLKESVISGINGLDVEQCFPMQKNITMKLTNNQISPGVWYIGLFNGIGPTRTQSKMIIRGPAYSFIANITVEACTNSMMKGDFCNSTVYPLSCTVSDVNNALEAIVNKPLSENLVTCKSNFGTFCVHEGVANFFSLDIMNVAEEFTIMAANVRFNVTLSNNTSGANDVSLMCFVRHGAMPSVTLHDYSSDLNKVPLVIHSPLIGRWYISIVPVNLTKTQDSDVRVCYSVKSLVLQCPLGKAGPNCTMDSYILQTFVRRGSTPFESYYLPVAGGASYDSANFPLEPLLRNSSYDGGTDSIWTYFLLDIPRGAAGGNLHIQLSSDVKIGYEVYARFGGLPSLDNWDYCYVNKTKRSDPSMFFMLYDSSDDKVNFYIMYAREGTWGLGLRHLNTSSSAKGPTIMSLSLERCPKRCSSHGDCKFSFDASGLTSYSFCSCDRNHGGFDCSTEIVTHQGHVRQSIFLIVSNVAAILPAYWALRQKALAEWVLYTSSGISSGLYHACDVGTWCALNYNVLQFMDFWLSFMAVISTFLYLATIDEVFKRAIHTAIAILTALMAATKATRSSNVVLVIVIGALGLLIGWLIEISTKYRSLSFSIRFSLNFSHSLQTIKRWLCNLVKTLMRRYHWAFALAGFVTLAMAAICWTLETSENYWFWHSFWHITIYTSSFFFLCSKANVEDSENQLPTNGNYELTHQDSLPRSG. 808
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca2g00955 807 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 540 551 IPR000742 -
Seca2g00955 807 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 6 805 IPR021910 GO:0016020
Seca2g00955 807 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 561 766 IPR021910 GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca2g00955 Seca-Chr2 15399557 15408732 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca2g00955 - - gmx:100778959 1407.12
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Seca4g11329 4 251849053 251858004 Seca2g00955 2 15399557 15408732 PCT