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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops8g01098 ATGATAAAAAAGATGGCTTTTTTTAATTTGATTCTGTGGTGTCGTCCCAATCTGATTCTTCTCAGTGTTGTGGTGCTCTTTTGTTGTTCCTTTGGCATCTTCTCTGCAAATGATGAACTGGGCAAAGGTGAAACCTTTACTGTTTCAAGCTTCAGCTACCCTCAGACGAGACTCAGGCCCTTTGATTTGCGTTATATTAGAGTTGACTTGCCACCATGGTTTTCCACAGTGTCTTTAGCATTGAACTCAGATGTAGACCTTGATGTCTCAAGAATTGAAAGGGTTCCAAAGAGCATGCTGCCGATAATATGCCTTAGAGATGGAAGTCCTCCACTGCCAGATGCCTTAAACACTTCTCTGAAAGATTCAGTCATCTCAGGGATAAATGGTCTAGATGTGGAGCAGTGCTTTCCTATGCAGAAAAATATGACCATGAAGCTGACAAACAATCAGATATCTCCAGGTGCTTGGTACATTGGTCTCTTCAATGGCATTGGACCTACAAGGACACAGTCAAAGATGATTATCCGAGGCCCATCATACTCCTTCATTGCCAATATAACTGTGGAAGCATGCAGAAATTCAATGATGAGGGGGGATTTCTGTAACAGTACAGTTTATCCGCTTCCATGCACAGCATCTGATGTCAATAATGCTTTGGAGGCTACAGTGAACAAGCCAGTGTTGGAAAATTTGGTGACCTGCAAAAGTAATTTGGAAAATTTTTGTGTTCATGAAGGTGTACCAAACTTCTTTTCATTGGATATAATGAATGTGGCAGAAGAAATTACCATTACGGCAAAAAATGTCAGATTCAATGTTACACCTTCAAATAACACTTCTGGTGCAAATGATATTAGTTTAATGTGTTTTGTTCGCCATGGTGCAATGCCTTCAGTGACTTTGCACGATTATTCCAGTGATTTAAATAAAGTGCCCCTGGTTATTATTTCACCATTGTTTGGTCGTTGGTACATTAGTATAGTACCAGTCCATCTTACAAAGACTCGGGACAGTGATGTAAGAGTTTGCTATTCAGTGGAATCTCAAGTGCTTCAATGCCCACTTGGGAAAGCTGGACCAAATTGTACAATGGATAGCTACATGCTTCAGACATATGTAAGGAGAGGGTCAACCCCCTTTGAATCATATTATTTACCAGTTACTGGAGGTGCATCCTACGATTCTGCCAATTTCCCTCTTGAGCCACTTTTAAGTAACTCATCATACAATGGTGAACTCGATAACATTTGGACTTACTTTCTCTTGGACATCCCTCGTGGGGCAGCTGGAGGAAATATTCACATACAGCTATCCTCAGATGTGAAGATCAGTTATGAAGTATATGCTAGATTTGGTGGATTACCATCTCTTGATATCTGGGACTATTATTATGTTAACAAGACAAGAAGAAGTGATCCATCTATGTTTTTCATGCTATATGATTCAAGTGATGAGAAGGTTAATTTTTATATTATGTATGCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTTGGTCTAAGATATCTTAATACCAGCAGTTCTGCGAAAGGGCTAACTATCATGTCTCTTTCACTTGAGCGATGCCCGAAACGATGTTCCTCTTATGGGGACTGTAAATTTTCTTTTGATGCTAGTGGATTGACATCATACAGTTTCTGCTCTTGTGATCGAAACCATGGAGGCTTTGACTGTAGCATTGAAATTGTAACACATCAAGGGCATGTACGGCAATCAATTTTTCTTATTGTATCAAATGCTGCGGCCATACTTCCTGCCTATTGGGCCCTTCGGCAGAAGGCATTAGCAGAATGGGTTTTATTCACGTCCAGTGGAATTTCAAGTGGACTATATCATGCATGTGATGTAGGTACCTGGTGTGCATTGAACTATAATGTCTTGCAGTTCATGGACTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTGATTAGCACTTTTCTTTATCTAGCCACCATTGATGAAGTATTTAAGAGAGCAATCCACACAGCTGTTGCTATCCTTACTGCCCTAATGGCTGCAACAAAGGCTACCAGGTTTTCCAATGTTGTTCTTGTGATTTTGATTGGTGCTCTTGGTCTCCTTGTTGGATGGTTGATAGAGATCTCAACAAAGTATAGGTCACTTTCCTTTTCAATCGGATTCTCACTTAATTTATCTCACTGTTTGCAAACTATAAAGCGATGGCTCATTAATCTTGTCAAATCACTTTTGAGACGGTACCACTGGCCTTTTGCCCTGGCTGGTTTTACTGCATTGGCAATGGCAGCAATAAGTTGGACACTTGAAACCAGTGAAAACTACTGGTTTTGGCATAGCTTTTGGCATATTACAATATACACATCTTCTTTCTTCTTCCTTTGTTCAAAAGCAAATATTGTGGATAGTGAGAATCAGCGACCTCCAAATGGAAGCTATGAACTGACACATCAAGATTCACTTCCAAGAAGTGGTTAG 2457 0.4025 MIKKMAFFNLILWCRPNLILLSVVVLFCCSFGIFSANDELGKGETFTVSSFSYPQTRLRPFDLRYIRVDLPPWFSTVSLALNSDVDLDVSRIERVPKSMLPIICLRDGSPPLPDALNTSLKDSVISGINGLDVEQCFPMQKNMTMKLTNNQISPGAWYIGLFNGIGPTRTQSKMIIRGPSYSFIANITVEACRNSMMRGDFCNSTVYPLPCTASDVNNALEATVNKPVLENLVTCKSNLENFCVHEGVPNFFSLDIMNVAEEITITAKNVRFNVTPSNNTSGANDISLMCFVRHGAMPSVTLHDYSSDLNKVPLVIISPLFGRWYISIVPVHLTKTRDSDVRVCYSVESQVLQCPLGKAGPNCTMDSYMLQTYVRRGSTPFESYYLPVTGGASYDSANFPLEPLLSNSSYNGELDNIWTYFLLDIPRGAAGGNIHIQLSSDVKISYEVYARFGGLPSLDIWDYYYVNKTRRSDPSMFFMLYDSSDEKVNFYIMYAREGTWGFGLRYLNTSSSAKGLTIMSLSLERCPKRCSSYGDCKFSFDASGLTSYSFCSCDRNHGGFDCSIEIVTHQGHVRQSIFLIVSNAAAILPAYWALRQKALAEWVLFTSSGISSGLYHACDVGTWCALNYNVLQFMDFWLSFMAVISTFLYLATIDEVFKRAIHTAVAILTALMAATKATRFSNVVLVILIGALGLLVGWLIEISTKYRSLSFSIGFSLNLSHCLQTIKRWLINLVKSLLRRYHWPFALAGFTALAMAAISWTLETSENYWFWHSFWHITIYTSSFFFLCSKANIVDSENQRPPNGSYELTHQDSLPRSG* 819
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops8g01098 818 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 551 562 IPR000742 -
Rops8g01098 818 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 17 816 IPR021910 GO:0016020
Rops8g01098 818 MobiDBLite consensus disorder prediction 798 818 - -
Rops8g01098 818 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 572 777 IPR021910 GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops8g01098 Rops-Chr8 23351073 23359938 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops8g01098 - - gmx:100778959 1424.07
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops8g01098 8 23351073 23359938 Rops8g01098 8 23351073 23359938 ECH
Rops8g01098 8 23351073 23359938 Rops4g01508 4 37956482 37972168 PCT