Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops5g00364 ATGATCACGTTAACAGATTTCTACCATGTTATGACTGCAATGGTGCCACTTTATGTGGCTATGATATTAGCTTATGGCTCAGTGAAATGGTGGAAAATCTTCTCCCCTGATCAATGTTCTGGCATCAACCGTTTTGTGGCAATGTTTGCAGTTCCACTTCTTTCTTTCCATTTCATTGCTTCTAACAACCCTTATAAAATGAACCTTCGGTTCTTAGCTGCTGACACACTTCAAAAGATCATAGTCTTGGTTGTTCTTGCTATTTGGAGCAACCTTACTAAAAGGGGTTGTTTGGAATGGACTATAACCTTGTTCTCTCTTTCCACCCTTCCAAACACTCTTGTTATGGGAATCCCTTTGCTTAAAGGGATGTATGGTGAGTTCTCAGGGAGTTTAATGGTGCAAATTGTGGTCCTTCAATGCATCATATGGTATACTTTAATGCTATTCTTGTTTGAGTTCAGGGGTGCTAGAATGCTAATCTCTGAACAATTCCCTGACACTGCTGGTTCCATTGTTTCCATCCATGTTGATTCTGATGTTATGTCATTGGATGGAAGACAACCCTTGGAAACTGAAGCTGAGATCAAAGATGATGGGAAGCTTCATGTTACTGTGAGAAAATCCAATGCTTCAAGATCAGATATCTACTCAAGAAGGTCTCAAGGTCTTTCTTCAACAACACCTCGCCCTTCAAACCTTACCAATGCTGAGATATACTCTTTGCAATCATCTAGGAACCCCACACCAAGAGGGTCTAGTTTCAACCACACAGATTTCTATTCAATGATGGCTGGTGGAAGAAATTCAAATTTTGGTGCCTCTGATGTTTATGGTCTCTCAGCATCAAGAGGACCAACTCCAAGGCCTTCTAACTATGATGAAGATGGTTCTTTGGGTGCTAAGCCAAAGTTCCATTATGGTGGAACTGGTCACTACCCTGCACCAAATCCTGGGATGTTTTCTCCCACTACTGGGTCCAAAACTGTTGCTACTAATGCTAATGCTAATGCAAAGAGGCCTAATGGTCAAGCACAGCAGAAACAAGAGGATGGTAATAGGGACCTTCATATGTTTGTTTGGAGTTCAAGTGCTTCACCAGTTTCTGATGTGTTCGGTGGTGGACATGAATTTGGAGCTCATGATCAGAAAGAAGTAAAATTGAATGTTTCTCCAGGAAAAGTGGAGGGTCATAGAGATAATACTCAAGAGGACTACCTAGATAAAGAAGAATTTAGCTTTGGAAACAGAGGAATGGAGAGGGAAATGAATCAACATGAAGGTGAGAGAGTTGGAGATGGGAAACCAAAAACTATGCCTCCAGCAAGTGTGATGACAAGGCTTATATTGATTATGGTTTGGAGAAAACTTATCAGAAACCCCAACACCTACTCTAGCCTAATTGGTCTCACTTGGTCTCTTGTTTCATTCAAGTGGAATGTTGAGATGCCTGCTATAATAGCAAAGTCTATTTCCATATTGTCAGATGCAGGACTTGGCATGGCCATGTTCAGTCTTGGTCTGTTTATGGCTTTGCAACCAAGGATCATAGCATGTGGAAATTCCACTGCAGCTTTTGCTATGGCTGTGAGATTCCTTGCAGGTCCAGCTGTCATGGCAGCTGCTTCCATTGCTGTTGGACTCAAAGGTGTTCTCTTACATGTTGCAATTGTTCAGGCAGCTCTTCCCCAAGGAATTGTACCATTTGTCTTTGCTAAGGAATATAATGTACATCCTGATATTCTAAGCACAGCTGTCATTTTTGGGATGTTGATTGCATTGCCCATTACTCTTGTGTACTACATCTTGTTGGGGTTATGA 1821 0.4152 MITLTDFYHVMTAMVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVAMFAVPLLSFHFIASNNPYKMNLRFLAADTLQKIIVLVVLAIWSNLTKRGCLEWTITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGEFSGSLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEFRGARMLISEQFPDTAGSIVSIHVDSDVMSLDGRQPLETEAEIKDDGKLHVTVRKSNASRSDIYSRRSQGLSSTTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHTDFYSMMAGGRNSNFGASDVYGLSASRGPTPRPSNYDEDGSLGAKPKFHYGGTGHYPAPNPGMFSPTTGSKTVATNANANAKRPNGQAQQKQEDGNRDLHMFVWSSSASPVSDVFGGGHEFGAHDQKEVKLNVSPGKVEGHRDNTQEDYLDKEEFSFGNRGMEREMNQHEGERVGDGKPKTMPPASVMTRLILIMVWRKLIRNPNTYSSLIGLTWSLVSFKWNVEMPAIIAKSISILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPRIIACGNSTAAFAMAVRFLAGPAVMAAASIAVGLKGVLLHVAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTAVIFGMLIALPITLVYYILLGL* 607
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops5g00364 606 NCBIfam auxin efflux carrier 1 606 IPR014024 -
Rops5g00364 606 PANTHER AUXIN EFFLUX CARRIER COMPONENT 1B-RELATED 1 606 - -
Rops5g00364 606 MobiDBLite consensus disorder prediction 213 235 - -
Rops5g00364 606 MobiDBLite consensus disorder prediction 280 329 - -
Rops5g00364 606 Pfam Membrane transport protein 9 601 IPR004776 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops5g00364 Rops-Chr5 6345143 6349143 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Rops5g00364 1 597 Organic Solute Cotransporters AT1G73590 74.086 0.0 876
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops5g00364 K13947 - gmx:100499637 1124
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops2g00053 2 954886 958548 Rops5g00364 5 6345143 6349143 PCT