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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g03056 GATTGCCTCTCTTTTTATACGAAAAATAGCTCACATTAGATTCCACTCAAACCATTTTACCTATTTTGTCTGAGAAACCACCCACTTTGGTTTCTTTGCCTTTCTCAATACATTCTCTCCAATGGAGGTAGGAAGTGTTCTTAGTTTTCTTCAGGAAAAGACCATTTTAATTATTGGAGGCACGGGCTTTCTCGCAAAAATTCTTCTGGAGAAGATATTGAGGGTTCAACCAAATGTTAAGAAGCTTTTTCTTCTTTTAAGAGCTTCCGATGCCAAATCTGCTACTTATCGCTTGCATAATGAGATCATAGCGAAGGACTTATTTATCGTGCTAAAGGAAAAATTGGGTGCAAATTTTAAGTCCTTTATTTTGGAAAAAGTGACTGTGGTTCCGGGGGATATTTCTTACGAGGACTTGGGTTTGAAGGATTCAATTCTAAGGGAAGAGATTTGCAATCAGACAGATGTTATTGTCAATTTAGCAGCAACTACTAACTTTGATGAAAGGTACGATGTAGCGTTGGGTCTAAATACCTTTGGAGTGAAGCATGTGATGAACTTCGCTAAACAATGTAGCAAACTCAAAGTTCTTCTTCATGTATCAACAGCTTATGTATGTGGAGAGAGAGGAGGACTGATACTGGAGGATCCCTATCACTTTGGTGATTCACTAAATGGAGTGTCTGGACTAGACATTGATGCAGAAAGGACAATCGTGTGTGAAAATTTGGATGAACTACGAAAGCAGGGGGCCACAGAGCGTGAAATTAAAATAGCCATGAAAAATCTCGGTATTAGCAGGGCAAAGGTATATGGATGGCCAAACACATACGTATTTACGAAGGCAGTAGGAGAGATGGTCGTGGAACAATTAAAAGGAAGCCTCTCAGTCGTTATTATGCGTCCTACCATCGTTACAAGCACATTAAGAGAACCTTTCCCTGGTTGGGCCGAGGGTGTGAGGACCATTGACAGTTTAGCCGTTACATATGGGAAAGGAAAATTAACATGCTTCCTTGGAGATATCAACGGAGTTGTGGATGTGGTACCAGCAGACATGGTGGTAAATGCAATGCTAGTGGCCATGGTGGCTCGTGCAAAGCAGCCAAGTGATATCATATATCATGTGGGTTCCTCTTTTAATAATCCTCTAACATACTTAAAGCTCCAAGACTACGGATTAAAATATTTTACAGCAAATCCATGGATTAACAAGGATGGAACACCGGTCAAGGTTGGCAGAGTAACCGTCTTGACCGACATGGAAAGCTTCCAGAGATATATGTTCATTCGCTACCTGCTTCCATTAAAGGGGCTTGAGCTGGCCAACGCTGCACTTTGCCAGTATTTTCGAGGAACGTATCTTGAGCTCCACAGGAAGATCCAGGTTGTGATGCGAATGGTTGAACTTTACAGGCCTTACATGTTCTTCGATGGCATATTTGATGATATAAACACAGAGAAGTTGCGAATGGCAGCAAAACAAAGTGGGACAGAGACAGATCTGTTTTACTTTGATACAAAAGAGGTTAATTGGGATGAATACTTTATGAGCACACATATCCCCGGTATTGTCAAGTACATTTTCAAATGATGCTATAGTAATGGGTGAAACTAGCTAGTAACTTTATTAAGTTCATGTTTGGATAAAATTAATAAAATATTTATAGATTAAAAAATAAGAATGTAAAATGAAATAAATTTTTTCTATTAACTAAAATTAATTTATGTATTTTAACTTTAAAAAAAAAAAAGAGTTAAATGAAAGAACTTTTATAGAAGTTAAATACATAAATTGATTTTAGCTTTCAGAAGAAACACAAATTCATCTTACCTTCTTATTTCTCCTCTTATGTAAACGGCCGCTTGAGTTCAAACTTGTGCAAAGGCACTGCATTAGAGTAGCGGTGTCATTTGTTTCTTTAAATCAGTGTAATTGGTATTGGGCCTATTGGCCAGCTGCAAATGAAGTTTGAAAAGCTTGATAGTGTTCCCAAACATCAGATATCACCGCGCGCCAAAGTCTCATTTGATAATTTTGTTCAAACAGTGACGTCACAGTGGTTGGTTTGTTTTTATTATTTTACTACTGCATAATTAAATTTAACTAATACATAA 2118 0.3777 MEVGSVLSFLQEKTILIIGGTGFLAKILLEKILRVQPNVKKLFLLLRASDAKSATYRLHNEIIAKDLFIVLKEKLGANFKSFILEKVTVVPGDISYEDLGLKDSILREEICNQTDVIVNLAATTNFDERYDVALGLNTFGVKHVMNFAKQCSKLKVLLHVSTAYVCGERGGLILEDPYHFGDSLNGVSGLDIDAERTIVCENLDELRKQGATEREIKIAMKNLGISRAKVYGWPNTYVFTKAVGEMVVEQLKGSLSVVIMRPTIVTSTLREPFPGWAEGVRTIDSLAVTYGKGKLTCFLGDINGVVDVVPADMVVNAMLVAMVARAKQPSDIIYHVGSSFNNPLTYLKLQDYGLKYFTANPWINKDGTPVKVGRVTVLTDMESFQRYMFIRYLLPLKGLELANAALCQYFRGTYLELHRKIQVVMRMVELYRPYMFFDGIFDDINTEKLRMAAKQSGTETDLFYFDTKEVNWDEYFMSTHIPGIVKYIFK 490
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g03056 490 Pfam Male sterility protein 392 490 IPR033640 -
Pste3g03056 490 CDD FAR_C 390 489 IPR033640 -
Pste3g03056 490 PANTHER MALE STERILITY PROTEIN 2-RELATED 7 490 IPR026055 GO:0080019
Pste3g03056 490 CDD FAR-N_SDR_e 13 361 - -
Pste3g03056 490 Pfam Male sterility protein 18 318 IPR013120 -
Pste3g03056 490 SUPERFAMILY NAD(P)-binding Rossmann-fold domains 6 338 IPR036291 -
Pste3g03056 490 Gene3D - 8 371 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g03056 Pste-Chr3 23354038 23362222 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste3g03056 110 489 Acyl Lipid Metabolism Gene Families AT4G33790 58.158 4.15e-173 490
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g03056 3 23354038 23362222 Pste3g03056 3 23354038 23362222 ECH
Pste3g03056 3 23354038 23362222 Pste1g02862 1 12208733 12215717 PCT