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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g03286 CCTTCCTCTCCCTCACTTGATTTCAGGGAAGCACAACCAAGCTTCTCTGTTAGAAAAAATAAAAAAATTTGCGTCAAAAGGGCCGAAGGTGAAACTGAAATGGTTGGGAAGGATAATCTGAGGGCTGAGGACTTGAACCTGTGCTTTGAGAAGCTTATGATGGTGGCTGGGAGTGGGAACAGTGAGAAAGGGGTAAATTTGAAGGTTGGGGTGATCACCGAGTGGAAGGATATTCCTGTGGAACTTCTGATGCAAATTCTGTCCCTTCTGGATGATCAGACGGTGATCACAGCTTCTGGAGTTTGTCGTGGCTGGAGAGATGCTATTTACTTTGGCGTTGCTCGTTTATCACTCTCATGGTATTTTGTTTTCTCTCTTGATGCTCTGTATCTGTGCCTCGAGGATTCTTTTCTGCCTCTCTCCAATTGGGATTTTGTTGTAGTGATGTTTTCTCGCTTCTTTTGCTTGCCTGTCATATCCCTGAGATTGATGGTTAGTTTCCAATTTTTCAAGAATGAGCTGGGATTTTCTGATGATAATGTGATATTACTTGCTGTGGGTTGTTCAAATCTCAACTTTTTTTTTGTCAAGCTATGCTTTGTTGGGGAAAAGAAACTGATATTTGAAGTGCTTGTATTTATTGCGGAGTTCATGGAATGTAGTCATGGTTTATGTAATTCATCTCTCTTCAGGTGTAGCAAGAACATGAATAACTTGGTCCTATCGCTTGTTCCTAAATTCTCAAAACTGCAAACACTAATCCTCCGTCAAGACAAGCCTCAACTAGAGGATAATGCTGTTGAGACTATTGCAAAATGTTGTCATGAATTGCAGATCCTGGACCTCAGCAAAAGTTTCAAGCTAACTGATCGTTCACTCTATGCTATCGCCCTTGGTTGTCGCGATCTTACAAAACTCAACATTAGTGGATGTTCATCATTTAGTGACAATGCTCTGGCTTACCTTACTAGTTTCTGTAGAAAACTGAAAGTTCTAAATCTCTGTGGATGCGTTAGAGCTGCATCTGATACCGCATTACAGGCTATTGGACAATACTGCAATCAGTTACAATCTTTGAACCTTGGATGGTGCGATAATGTTGGTGATGTTGGAGTGACTGCTTTAGCATACGGGTGTCCTGATCTTAGGATAGTTGACTTGTGTGGCTGTGTCCGTATAACAGATGATAGCGTGATTGCTTTGGCAAACAGATGCCCCCATCTGAGGTCCCTTGGACTGTACTACTGCAAGAACATAACAGACAGAGCAATGTATTCCTTGGCACACAGCAAGGTGAATAAAAGGATGTGGGGATCTGTGAAAGGAGGAAATGATGAGGAGGGGTTAAGGACATTGAACATTAGCCAATGCACTGCACTGACCCCATCTGCTGTTCAAGCTGTTTGTGACTCATTCCCTTCCCTTCACACATGTTCAGGGAGGCATTCACTCATCATGAGTGGCTGCCTCAACTTGACATCTGTGCATTGTGCTTGTGCTGTCCATGCACACCGTGCATTCACCACTTTTCCTCATCCTGCTCATTAAGCTCATGCTTTTGATGTTCAACACACTTCGAGGAAGTTCCCTTGAAGGGCTCAGAGAAGTGAAATCCCCCCTTGTAGATATCTCATATGCCTGCATAAACAGACTTGAGTCTAGCTGATTATGTAAATCTTGAACTTGGTTTGTTTTAATCCTCCAATTGTGAAGCTGGAGACATTTTGCATGCAAAAACTGTGGCTTGTTCCTAGTAAGCTATTTAAGTTTATGGAAAAACATGGACTTTAAATTTGTATGGTTTTATGGAAATATATACACATGGTATTTTTTTGTG 1837 0.4192 PSSPSLDFREAQPSFSVRKNKKICVKRAEGETEMVGKDNLRAEDLNLCFEKLMMVAGSGNSEKGVNLKVGVITEWKDIPVELLMQILSLLDDQTVITASGVCRGWRDAIYFGVARLSLSWYFVFSLDALYLCLEDSFLPLSNWDFVVVMFSRFFCLPVISLRLMVSFQFFKNELGFSDDNVILLAVGCSNLNFFFVKLCFVGEKKLIFEVLVFIAEFMECSHGLCNSSLFRCSKNMNNLVLSLVPKFSKLQTLILRQDKPQLEDNAVETIAKCCHELQILDLSKSFKLTDRSLYAIALGCRDLTKLNISGCSSFSDNALAYLTSFCRKLKVLNLCGCVRAASDTALQAIGQYCNQLQSLNLGWCDNVGDVGVTALAYGCPDLRIVDLCGCVRITDDSVIALANRCPHLRSLGLYYCKNITDRAMYSLAHSKVNKRMWGSVKGGNDEEGLRTLNISQCTALTPSAVQAVCDSFPSLHTCSGRHSLIMSGCLNLTSVHCACAVHAHRAFTTFPHPAH 515
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g03286 515 Pfam Leucine Rich repeat 353 376 IPR001611 GO:0005515
Pste2g03286 515 Pfam Leucine Rich repeat 405 428 IPR001611 GO:0005515
Pste2g03286 515 CDD F-box_AtSKP2-like 74 120 - -
Pste2g03286 515 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 129 340 IPR032675 -
Pste2g03286 515 PANTHER UNCHARACTERIZED 378 494 - -
Pste2g03286 515 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 341 504 IPR032675 -
Pste2g03286 515 ProSiteProfiles F-box domain profile. 72 123 IPR001810 GO:0005515
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 247 273 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 446 471 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 300 325 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 379 404 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 353 378 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 326 352 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 405 430 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SMART LRR_CC_2 274 299 IPR006553 -
Pste2g03286 515 SUPERFAMILY RNI-like 228 429 - -
Pste2g03286 515 Gene3D - 72 112 - -
Pste2g03286 515 FunFam F-box protein SKP2B 221 439 - -
Pste2g03286 515 SUPERFAMILY F-box domain 75 139 IPR036047 GO:0005515
Pste2g03286 515 Pfam F-box-like 76 109 IPR001810 GO:0005515
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g03286 Pste-Chr2 32746590 32749658 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste2g03286 2 32746590 32749658 Pste2g03286 2 32746590 32749658 ECH
Pste8g02030 8 16466379 16481861 Pste2g03286 2 32746590 32749658 PCT