Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g00933 ATGGAATCTTGTGCGCAGTTTGGGTTGTGGGTGGCGTTGATCTTGTGTTTGGCATTTCAAATTCAACCCAGTTATGGTTTTTACCTTCCGGGTAGTTATCCCCACAAGTATGATGTCACTGATGATTTGTGGGTGAAGGTGAATTCCCTCACTTCCATTGATACTGAAATGCCCTTTAGCTATTACAGTTTGCCCTTTTGCAAGCCTGAGGGTGGTATCAAGGACAGTGCTGAGAACCTTGGGGAACTCCTCATGGGGGACAGGATAGAGAACTCTCCTTACAGGTTTAAGATGCACACCAATGAGAGTGAGATTTACTTGTGCCGGATTGAGGCGTTGTCCGGGGATCAGTTCAAGATCTTGAAGGAGAGGATTGATGAGATGTATCAGGTTAATTTGATTCTTGATAATTTACCTGCTATCCGGTTCACACAGAAAGATGGGTACTTTATGAGATGGACCGGGTACCCTGTTGGTGTTAAGATTGATGGTGCTTATTATGTGTTTAACCATCTCAAGTTCAATGTTCTTGTTCACAAGTACGAGGAGACCAATGTGGCTCGAGTAATGGGGACCAGTGAAGGTGCAGAAGTGATCCCGGTTGGCAAGGAGGGGTCTTCTGAGATTCCTGGATACATGGTTGTTGGGTTTGAGGTGATTCCTTGCAGTATTATGCATAATGCTGATTCTGCAAAAAATTTGAAGATGTATGACAAGTATTCCGCGTCTATCCGATGTGATCCGGCCACTGTGGCAATGCCTATTAAAGAGGGTCAACCTGTAGTGTTCACTTATGAGGTCACGTTTGAGGAGAGTGATATCAAGTGGCCATCTAGATGGGATGCCTACTTGAAGATGGAGGGAGCTAAGGTGCATTGGTTCTCTATCCTTAATTCACTTATGGTGATAACTTTTCTTGCTGGTATTGTTCTTGTGATCTTCTTGAGGACTGTTAGGAGGGATCTGACTCGTTATGAGGAGCTTGATAAGGAGGCTCAAGCACAAATGAACGAAGAGTTGTCTGGTTGGAAGCTTGTAGTGGGAGATGTTTTCCGTGCTCCGTCGAACCCTTCTTTGTTGTGTGTGATGGTTGGGGATGGTGTTCAGATTCTTGGGATGTCTGTTGTGACGATATTGTTTGCTGCACTTGGATTCATGTCACCGGCATCTCGTGGAACATTGATCACAGGTATGCTGTTTTTCTATATGATACTTGGTATTGCTGCTGGTTATGTCTCAGTGCGGATGTGGAGGACAATTGGTTTTGGTGATCAGAAGGGCTGGGTTTCAATTGCATGGAAGGCCGCTTGTTTCTTCCCAGGAATTTCCTTTTTGATCCTCACAACCTTGAACTTCCTATTGTGGGGAAGCCACAGCACTGGAGCCATTCCATTTTCACTCTTTGTAATACTAATCTTACTTTGGTTCTGCATATCTGTGCCCCTTACCCTTGTTGGTGGGTACTTTGGAGCCAAGGCACCCCACATTGAGTATCCAGTCCGAACCAACCAAATTCCTCGTGAAATTCCCCAGCAGAAGTACCCCTCATGGCTGTTAGTTCTTGGTGCTGGCACCCTTCCATTTGGCACCTTGTTCATTGAGCTCTTCTTTATCATGTCCAGCATTTGGATGGGTCGCGTTTACTATGTCTTTGGGTTTCTCTTTGTTGTTCTGGTCCTTCTTGTGGTGGTTTGTGCTGAGGTATCTTTAGTTCTGACTTACATGCATCTGTGTGTGGAGGATTGGAAATGGTGGTGGAAATCTTTCTTTGCCTCTGGTTCTGTTGCCATATACATCTTTTTGTACTCCATTAACTATCTTGTGTTTGATCTCAAGAGTTTAAGTGGTCCTGTGTCTGCAACTCTTTACTTGGGGTACTCACTCTTCATGGTTCTAGCAATCATGCTTTCTACAGGTACAATTGGGTTCCTCTCTTCATTCTGGTTCGTGCATTATTTGTTCTCTTCAGTCAAGTTGGATTGA 1983 0.4453 MESCAQFGLWVALILCLAFQIQPSYGFYLPGSYPHKYDVTDDLWVKVNSLTSIDTEMPFSYYSLPFCKPEGGIKDSAENLGELLMGDRIENSPYRFKMHTNESEIYLCRIEALSGDQFKILKERIDEMYQVNLILDNLPAIRFTQKDGYFMRWTGYPVGVKIDGAYYVFNHLKFNVLVHKYEETNVARVMGTSEGAEVIPVGKEGSSEIPGYMVVGFEVIPCSIMHNADSAKNLKMYDKYSASIRCDPATVAMPIKEGQPVVFTYEVTFEESDIKWPSRWDAYLKMEGAKVHWFSILNSLMVITFLAGIVLVIFLRTVRRDLTRYEELDKEAQAQMNEELSGWKLVVGDVFRAPSNPSLLCVMVGDGVQILGMSVVTILFAALGFMSPASRGTLITGMLFFYMILGIAAGYVSVRMWRTIGFGDQKGWVSIAWKAACFFPGISFLILTTLNFLLWGSHSTGAIPFSLFVILILLWFCISVPLTLVGGYFGAKAPHIEYPVRTNQIPREIPQQKYPSWLLVLGAGTLPFGTLFIELFFIMSSIWMGRVYYVFGFLFVVLVLLVVVCAEVSLVLTYMHLCVEDWKWWWKSFFASGSVAIYIFLYSINYLVFDLKSLSGPVSATLYLGYSLFMVLAIMLSTGTIGFLSSFWFVHYLFSSVKLD 660
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g00933 660 Coils Coil 315 335 - -
Pste2g00933 660 PANTHER TRANSMEMBRANE 9 SUPERFAMILY PROTEIN 26 660 IPR004240 GO:0016020
Pste2g00933 660 Pfam Endomembrane protein 70 58 613 IPR004240 GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g00933 Pste-Chr2 9969625 9971607 Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste2g00933 1 660 Miscellaneous Gene Families AT5G35160 84.418 0.0 1135
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste2g00933 2 9969625 9971607 Pste2g00933 2 9969625 9971607 ECH
Pste6g03164 6 19892193 19894593 Pste2g00933 2 9969625 9971607 PCT