Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele46g1436 ATGCAAGGACTTTTTTCTGTCTGCATCTATGCTTGCTTATATGATGGTGTTGGTAATAATGGGCAAATGTTGGCATGTTCATATTCTGAATTTTTACTCTGCATATCTATGCTATCTCTGGCTAGATTGGAAACTCTTTCAGGTTTAAGCTTTCCTTCTTCACTCCTCCCTCCAATGGCCGATACTAAGTCTGTCGACGCTTCTCTCTGGTGGGATTCTTTCACTCTGCTGCTTACTGAGCTTGAGAACTCCTCTCTCTCCTCAGACCTCCCTCCAAATTTGGTGAAGAAGTTGAGGGACAACCATTCCTGGTTAGTGGATGCAGTTTCGCGCTTCAAGCTGCCAAATGAGAAATCAAAGGAAGCTCTGAATTCGAAGAAACTGCAAATTGGATCTCACCAACTTACTATACAAACGCATTTGAAAGACCAAGCTTTGAAAATCAGCTCCTGCTTGCAACTAGATGAAGTTCAATCATACATTCTTGCGGAAAGGTCAATCAAACATAATGTAGCAATTGATTCCGTGGCTCTAGAATCTCTTCATGTGATAGTAATTCAATATTATACGGAGAGACAGTGCTTGCTGAAATGCATCAGATGGATTCTCATGCATGCTATATATATTGGACCAGGCTCTAAAGAACATGTTATTAGAGAGGAGGCAGAAAAGTTGTTTCAAAATGGACTGGAAAACAAATTAATATCTCTGTTTCAGGATCTCTTGATTTTTAGTTATCCAGAGCAAATGGATGTTGATCTTTTCACTCTGTGGGCTGAGGAGACTCTAATTGAAGACAACTTAGTTCTGGACATTCTCTTCCTTGCGTATTATGACTCATTTTGTACTTGTAGTGGTGAAAAGTGGAAGAAATTATGTAATATCTACAAGGGAATCATTTCTGGTCAATATAACTTCAGAAAGCTTGCAATATCGTCAGAAGCCTGGCAACTGTCTTATCATGCCAAAGTTCAACTGCTACTTATCCTGATAGAAACTCTGGATTTGGAAAATCTTCTTCAGATGGTTCATGATGAAACACCTTATAGGAAAGGTGCATCTACTTTTTCACTGATTGATGTCCAAGAGATGGATGCATTCGTGTCTACTTTCAATTCTTTTGAAATGAAAGAAGCTGGCCCCTTGATTCTAGCTTGGGCAGCATTTCTTTATCTGCTATTGACACTTCCAGGGAAAGATGAAAACAATGACCTAATGGAGATTGATCATGTTGGTTATGTTCGGCAGGCATTTGAGGCTGCATCATTTAGTTACTGTCTTGAAATTCTTGAGTGTGACATACTGAGGGAGTACGATGGTCCTGTTTCTGGATACCGTAGTGTTTTGAGAACATTATTATCTGCATTTATTGCATCTTATGAGGTCAACATTCAGGCAGAGGACAGCAACCCCATTTTGATACTGGATATTCTTTGCAAGATCTACAGAGGAGAGGAATCCCTTTGTATTCAGTTTTGGGACAAGGGAAGTTTCATTGATGGTCCAATTCGTTGTCTTCTTTGCAACCTAGGGAGTGAGTTCCCTTTCCAGACAGTGGAACTTGTGCAACTCTTGTCTTCCCTTTGTGAGGGAACGTGGCCTGCTGAATGTGTGTATAACTTCCTAGATAGGTCTATTGGGGTATCATCCTTGTTTGAGATTAGTAATGAGGCAGTGGAAGACGTCTCTCATATAGTTGAGGCACAACAACCAGTGCAATTTCCTGGAATTGAAGGTTTTTTTATTCCTGCTGGAACTCGTGGACATGTCTTGAAAGTTGTTGAAGGGAATACTGCCCTTGTACGATGGGAGTATGCAACATCAGGTGTGTTTCTCCTACTCCTACGTTTAGCCCAAGAGGTACATTTGAATGGCAAGGAGGAGGTTCTTTTGACTCTTGACCTGCTCAGTAGATTGGTTTCCTTTAACACTGCTGTCTGTTTTGAGTTGATGACTCTCAGCTGCTCTACCCATTTCCATGGTGTCAGCTTGATGAACGAACAGGAAAAGAATGTCTGGGTGATTGAGATTATTTGCAATCTTGTCAAAAACCCATCTCTGAATTCCTATGGTGCTGCACTGATGTCCAAGGCCATCAAGATTTTGGGAAAGATGTTAAATTGCTCTCCTTCTAGTGTTGCAGCAATTGCTCTAAATGCAAATATATTTGATATGGCTTTGCAGACAACTGTTTTCAGTAGAGCAAATAGTGCTTTGTCAAGTGGATCATGGTTGCTTTCTGGCAAACTAGCTAAGATGCTTTTAATTGACTGTGAGCAAAACAGTAATGACCGCCCCTTGGTAATATCAGTTCTGGACTTTACCATACAGCTGGTAGGAACTGGGGTGGAGAATGATTGTCTCCTTGCGTTGATTATTTTCTCTTTGCAATATGTTCTGGTCAATCATGAATCCTGGAAATACAAGATGAAGCATGTTCGATGGAAAGTGACATTGAAGGTGCTTGACTTGATGAAAAAATGCAACATATTGATGGCTTCCCATGGAAAAATGGGTGAGATAATTCATGATGTGTTGTTCTCTGATTCATCCATTCACAAGACTCTTTTCCAAATTGCTTGCACTACAGCAAATGCCTTGGAGAAATTGCATGTGAGCCGCCTCTTTGATCCAATGGAGATTGAAGGGTTACAATTTGCAATAAGTTCTGTACTAGATGTTCTTTGTATCATGCTGACCAAACTTTCTGAGGAGGCAGCATCCAGCTTTTCTGTTTTTCACCAAGCAGTGTTATCATGTACAACTAATTCTGTCCCTGTTGCTGCTGCTGTTATATCCTTGATTTCATACTCTCGAGATCCGGCCATCCAAATTGGTGCTGCTAGGTTTATTTCATTATTATTTTCTATAGCAGATTCCATTCAACCATTTTCGTATGGAACCACATGCTTTGCTCCAGAATCTAATCAGATCATGGATTTGAGACATTCTCTGAGCTACATATTGTTGGAGCAGTCAGCATCTAATGAAGATCTGTTTATTGCAACAGTTAATCTATTGACTTCTGCAGCACATCACCAGCCTGCATTTCTTATTGCTATATTTACTCCTGAGGAGAAGGACGATGGTCAGTTAAATGTTATTGGTTATGTAAAGTCCAAAGGTTCAAAGAAGTCGGGCCTAATAGATGCACTAATGGATTATATTGTAAGGGCAGATAATCTGATTAAGAGCCACCCACACATACTGCTGTGTGTACTTAACTTCATGATTGCCTTGTGGCAAGGAGCTCCTCAGTACTTAAATATCCTGGAGTCTCTGAGAAGCTCTGAGAAATTCTGGAAGTATTTGTCCAATGCAATCTTAAAAGTTGCTGGCAGCGCAACTCATCTACCCGTTAATCTGACAGAGAATGATGCTCGAAATCTAGCAAACAATTACCTTTGTCAATCTGCAATACTTGGAATCATGTCATATGAGATGTTCTTGCAGAAAAAGTTGTTGCATGCAGAATCACTTGTGAAGGATGCAGCTGGATCTCAGGGCAAGGAACAAGATGGTGCAAAAACTGAAAAATCTATGACACCTGCTTTTTGTGATGTTAAGGAGATTTGGTCTTCCTGGTGCAAAGATTCTGTTATGGAGAAACTAATGAAGTCGTATACTTCTGGGTATAATGATGATATATATAATAGTGCAAAAGTCGCTATCAGTTTATTCTCTGTCCATGTGATGGAAAAATTAGTAGCTGGTGATTCTGGAAGTTTATCAGTGTCATTGCAGCAGAAGTTTCATACAATGTTAACAAAGTTGAGCATGCATCCTGCTTTTTCTGAATTACTCTGCCAGTATTCACAACGTGGTTACAGTGAAGGGAAGAAATTAAAGAAGTTGATACTCAGTGATCTCTTTTATCATTTGCAAGGAGAGCTTGAAGGCAGAAAAGTTGGTACCGGACCATTTAAAGAGTTGTCTCAGTATCTGGTTGAATCAAATATTTTGGAAACCTATCAACACAATTTCAATGGTGACCTATGTGCAACTACCAAGAATTTATACTTGTTCGACATTGTACGCTTGCGAGCTGATTTAGGATTAGATGTGTGGAATTGTTCTGAGTGGAAGACATCTAAGGAGATTGCAGAAATCATGTTGCACTGGCTGCAGGAAGCAAACTCGTTTATGTTGGCTTCAAGTTCAAAACTTTCTGCATTGAAAGCATTGATTTCTGTCTCGACTGTCTACCATGATGATGCACTAGGGAGAAAATCTATGAGAGAGGCGATTCCGGATCAAATCATTTTCACATGCATAGATAATATATGCAAATCTTTTCATGCTACAATTGAAAAATTAGCACCTGTTCTTGATGTGTCTGAAGATCAACTCAGTTTTCTTGCGTCCCAAGCAGAATTGCTTCTCCAGTTGACCAGAACTGTCTGCAAAAGTCTCTCCTTTGATGTTTGCCTACTTGTTCTGCAATGTTCTGGTTCAGGTCTTAAACTGTTGAGTGAACTTAAGCTGTTATCTTCTAGGGCCAGTGTGATAATGAAGCTATTACTCACATTACTGCTTTTAGTATTAGATTCCAACTGCTTCAGTTCTCATTTGGGTGGTGGGACGATAGATGAGAAGTCTGGTGAGGGCTTTTCTAAAATTTCAAATGCAATCCTTGGCCTCCTTCCCATTCTTTGCAAATGTGTTGCTGCTCCTGAACATTGTGTGCTATCTCTGTCTGTTATGGACCTGATATTAAGAAATTTCTTGATGCCCGAGACTTGGTTACCTGTCATACAGAATCATCTGCAGCTTCAACTTCTTATGCTGAAATTTCAAGATAAAACGTCCTCTTCCATTCCAATAATATTGAAGTTTCTTTTGACACTTGCACGTGTAAAAGGAGGTGCTGAGATGCTTTATGGTTCTGGTTTCTTGTCATCTCTGAGAGTGTTGTGTGCTGAATGTGATGAGGCGTTCTCAAGATTTCATAGCGAAAATGTGGGTAGCTTACATGAAAAGTTTGAAATGCCTGGAGACATTTGGGGACTTGGATTAGCTGTGGTCACAGCTATGGTTCAATCCTTGGAAGACAGTTCTTCATGCTCAGCTATCGTGGACAGTGTAATACCTTACTTTTTCCAGGAGAATGCTCATCTTATTTTTGGTTCTCTAAATGCTCCGGACCTCCCTTCAGATCATCGTGACAAGAAAAGACCTCGGCCACAGAGGTCATGGATGTCTCTTGCTAATCTTAAGGAGACAGAACATACTTTGATGCTCATGTGTGAACTTGCAAAACATTGGAATTCATGGACTAAGGCAATCAATAAAGTGGATAGACAGCTTAGAGAGAGATGTATCCATCTTTTAGCCTTTATTAGCAGGGGCACTCAACGCCTTGGTGATTTGTCAAACAAGGATGCCGCACGTTTGTGTCAACCTGCTCTTAAAGAGGATTTTGACAATTGCTCAAAACCTTCGTATATCAACAGTAAAAATGGATGGTTTGCCCTTGCACCACATTTCTGCGTGTCAAAACTGAAGACCACTCCTGTCTCAACTGCTTTGACCACCTATGGTCAAGAAACTAAAAGTACAGATCTGTTTCCCAAAACATGCTTTTCTGACGCTGTTGCTGTGCAAATATATAGAATTGCATGTCTCCTTTTAAAGTTTCTCAGTTTACAAGCTGAAGGTGCTGTTAAAAGGGCTGAGGAGGTTGGCTTTGTTGATCTTGCACATTTTCCTGAGCTTCCCATGCCAGAAATCTTGCATGGATTGCAGGATCAAGCCATTGCGATTGTTAGAGAGTTATGTGAGGCCAACAAACCGCGGGTTTCTCCTCAAATTCAGAATCTTTGTTGCTTATTGTTGCAAATAATTGAAATGGCCTTGCAGTTGGAGCTCTGTGTTCTGCAGATCTGTGGCATAAGACCAGTATTAGGGCGTGTGGATGATTTTTCAAAGGAAATTAAAACTTTATTTGGTGCCATGGAGGAGCATGCGTTTCTCAAAGCTTCTAAGAAGTCCTTAAAACAAATGGTATCATTTGTCTATCCCGGAATGCTGCAATCCGAGGGTTTATGA 6048 0.4029 MQGLFSVCIYACLYDGVGNNGQMLACSYSEFLLCISMLSLARLETLSGLSFPSSLLPPMADTKSVDASLWWDSFTLLLTELENSSLSSDLPPNLVKKLRDNHSWLVDAVSRFKLPNEKSKEALNSKKLQIGSHQLTIQTHLKDQALKISSCLQLDEVQSYILAERSIKHNVAIDSVALESLHVIVIQYYTERQCLLKCIRWILMHAIYIGPGSKEHVIREEAEKLFQNGLENKLISLFQDLLIFSYPEQMDVDLFTLWAEETLIEDNLVLDILFLAYYDSFCTCSGEKWKKLCNIYKGIISGQYNFRKLAISSEAWQLSYHAKVQLLLILIETLDLENLLQMVHDETPYRKGASTFSLIDVQEMDAFVSTFNSFEMKEAGPLILAWAAFLYLLLTLPGKDENNDLMEIDHVGYVRQAFEAASFSYCLEILECDILREYDGPVSGYRSVLRTLLSAFIASYEVNIQAEDSNPILILDILCKIYRGEESLCIQFWDKGSFIDGPIRCLLCNLGSEFPFQTVELVQLLSSLCEGTWPAECVYNFLDRSIGVSSLFEISNEAVEDVSHIVEAQQPVQFPGIEGFFIPAGTRGHVLKVVEGNTALVRWEYATSGVFLLLLRLAQEVHLNGKEEVLLTLDLLSRLVSFNTAVCFELMTLSCSTHFHGVSLMNEQEKNVWVIEIICNLVKNPSLNSYGAALMSKAIKILGKMLNCSPSSVAAIALNANIFDMALQTTVFSRANSALSSGSWLLSGKLAKMLLIDCEQNSNDRPLVISVLDFTIQLVGTGVENDCLLALIIFSLQYVLVNHESWKYKMKHVRWKVTLKVLDLMKKCNILMASHGKMGEIIHDVLFSDSSIHKTLFQIACTTANALEKLHVSRLFDPMEIEGLQFAISSVLDVLCIMLTKLSEEAASSFSVFHQAVLSCTTNSVPVAAAVISLISYSRDPAIQIGAARFISLLFSIADSIQPFSYGTTCFAPESNQIMDLRHSLSYILLEQSASNEDLFIATVNLLTSAAHHQPAFLIAIFTPEEKDDGQLNVIGYVKSKGSKKSGLIDALMDYIVRADNLIKSHPHILLCVLNFMIALWQGAPQYLNILESLRSSEKFWKYLSNAILKVAGSATHLPVNLTENDARNLANNYLCQSAILGIMSYEMFLQKKLLHAESLVKDAAGSQGKEQDGAKTEKSMTPAFCDVKEIWSSWCKDSVMEKLMKSYTSGYNDDIYNSAKVAISLFSVHVMEKLVAGDSGSLSVSLQQKFHTMLTKLSMHPAFSELLCQYSQRGYSEGKKLKKLILSDLFYHLQGELEGRKVGTGPFKELSQYLVESNILETYQHNFNGDLCATTKNLYLFDIVRLRADLGLDVWNCSEWKTSKEIAEIMLHWLQEANSFMLASSSKLSALKALISVSTVYHDDALGRKSMREAIPDQIIFTCIDNICKSFHATIEKLAPVLDVSEDQLSFLASQAELLLQLTRTVCKSLSFDVCLLVLQCSGSGLKLLSELKLLSSRASVIMKLLLTLLLLVLDSNCFSSHLGGGTIDEKSGEGFSKISNAILGLLPILCKCVAAPEHCVLSLSVMDLILRNFLMPETWLPVIQNHLQLQLLMLKFQDKTSSSIPIILKFLLTLARVKGGAEMLYGSGFLSSLRVLCAECDEAFSRFHSENVGSLHEKFEMPGDIWGLGLAVVTAMVQSLEDSSSCSAIVDSVIPYFFQENAHLIFGSLNAPDLPSDHRDKKRPRPQRSWMSLANLKETEHTLMLMCELAKHWNSWTKAINKVDRQLRERCIHLLAFISRGTQRLGDLSNKDAARLCQPALKEDFDNCSKPSYINSKNGWFALAPHFCVSKLKTTPVSTALTTYGQETKSTDLFPKTCFSDAVAVQIYRIACLLLKFLSLQAEGAVKRAEEVGFVDLAHFPELPMPEILHGLQDQAIAIVRELCEANKPRVSPQIQNLCCLLLQIIEMALQLELCVLQICGIRPVLGRVDDFSKEIKTLFGAMEEHAFLKASKKSLKQMVSFVYPGMLQSEGL 2015
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele46g1436 2015 PANTHER NUCLEOPORIN NUP188 HOMOLOG 68 2012 IPR044840 GO:0017056
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele46g1436 Lele-ChrLele46 21155814 21176717 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele46g1436 46 21155814 21176717 Lele47g0073 47 497234 501682 hybridization
Lele46g1436 46 21155814 21176717 Lele48g0076 48 1202220 1222893 hybridization