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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bva09g00754 ATGGAGTCGATAATGGCAAGAGCTTTGGAGTATACTCTCAAGTACTGGCTTAAATCCTTTACTAGGGATCAGTTCAAATTGCAGGGTCGGACTGTGCAGCTTTCTAATTTAGatataaatgGGGATGCATTGCATTCAAGTGTTGGATTGCCACCAGCGCTGAATGTAGCGACAGCTAAAGTTGGAAAATTGGAGATAATGCTTCCATCTGTAAGGAATGTACAAATAGAGCCAATCATTGTCCAAATCGATACACTTGATTTGGTTCTCGAGGAGAATTCTGATTTCGATGCATCTGAAAGTACAAAGAGCGCTACATCATCTACTGCCTCGACAAAGGGTAGCGGTTATGGTTTTGCTGATAAGATTGCAGATGGAATGACCATACAGATTCATACAGTTAATCTATTGCTTGAAACTCGTGGGGGAGCTGGACGTCAAGGGGGAGCAACATGGGCATCACCCATGGCATCAATCACTATACGTAACCTTTTGCTGTATACCACAAATGAAGATTGGCAGgtTGTAAATCTTAAGGAAGCACAAGAATTCTCAAGTAACAAGAAGTACATATACGTGTTCAAAAAACTTGAATGGGAGTCTTTGTCTATTGATCTTTTGCCTCATCCTGACATGTTCACGGATGCTACTTTAGGCCTCTCTAAAGAGGGAGCAAACCTGAGAGATGATGATGGTGCAAAGCGAGTTTTCTTTGGGGGCGAGCGCTTTATAGAAGGAATATCAGGAGAGGCTTATATCACCATTCAGAGAACTGAATCAAACAGTCCACTTGGGCTTGAGGTTCAGTTACATGTTACTGAAGCCATTTGCCCTGCTTTAAGTGAACCAGGACTACGTGCTCTTCTCCGCTTTATGACGGGATTATATGTCTGTCTAAACAGGGGAGATGTTGATTTTAAGGCTCAACAGCGATCTACAGAAGCAGCTGGGCGATCTCTTGTCTCTATTGTTGTGGACCATATATTTCTTTGCATTAAAGATACAGAATTCCAGCTTGAGCTTTTAATgcaatctctctctttttctcggGCCAGTGTTTGTGAAGGAGATAATGACAATAACTTGACTAGAATCACAATTGGTGGATTATTTTTGAGGGACACCTTTTTGCGCCCTCCATGTACCTTAGTGCAACCATCAATGCAAGCTGCCACAAGAGACGTTCTCCATGTGCCAGAATTTGCTAGGAGCTTTTGCCCTCCAATATATCCTTTAGGAGAGCAGCAGTGGCAGTTGATCGAGGATACTCCTCTGATATGCCTCTATTCCCTTCAGATAAAGCCGTCTCCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTCAAACAGTTATTTACTGTCAGCCTCTTATGATTCATCTCCAAGAAGAATCCTGTCTGAGGatatcttctttcttatcCGATGGTATTGTTGTAAATCCAGGTGATGTTTTGCCAGATTTCTCAGTAAACTCTCTCATTTTCACTCTCAAGGGACTGGATCTCACAGTTCCTTTAGACAAGGCCAAATTAGATATTCCTGAAAGCAACATGGGCAGTGCTGTCCAGAGCTCCTTTGCTGGAGCAAGGCTTCATATTGAAAGCCTTTCCTTTTCAGCTTCACCTTCACTTAAAGTGAAAATGTTGAACCTGGAGAAGGATCCTGCTTGCTTCTGTCTTTGGAAAGGTCAACCAATTGATGCTAGCCAGAAAAAGTGGTCCACTAGAGCATCACATCTTACTCTGTCTCTTGAAACATGTACTGGCACAACTGAACGTCAGAATTCTCTTGGATGGACTTCAGGATTGTGGAGATGTGTTGATCTGAGAGATGCTTGTGTTGAAGTAGCTATGGCAACTGCTGATGGTAGCCCATTGTTAAATGTTCCTCCCCCTGGTGGTATTGTGAGGGTTGGAGTTGCATGTGGACAAATTCTGACAAACACTTCTGTTGAACAGTTATTTTTTGTCCTAGATCTCTATGCTTATTTCGGTAAAGTTAGTGAGAAAATAGCAATAGCTGGAAGAAAGAGTAAACAATTGAAGGATGCTATGGTCAAACATTCTAGTGGAAGCCTGATAGACAAGGTTCCTAGTGACACAGCCGTAAGTTTAGCAGTGAAGGACCTCCAACTTAGATTTCTGGAGTCTTCTTCAATGAATGTCGAGGGAATGCCTTTAGTACATTTTATTGGAGATGATCTGTTCATTCGTGCCAGTCATAGAACCCTTGGTGGTGCCATTGTTGTTTCATCGACTTTATGTTGGGATAGTGTAGAGATAGATTGTGTAGATGCCGATGGGAACTTGGCACGTGAAAATGACTCATTCTTGAATTCTGCTGAAAATGTTCCAGCAATGAATGATAATGTATATCATCAATTAAGAGCTGTTTTCTGGGTGCATAATAAAAAGAACCACAAATTCAATGGAAATGCTCATTCAGCTCCTTTTTTGGACATAAGCATGGTGCAAGTCATTCCCTTAGATGAACAAGACATAGagtcttataatttaaatgtcTCAGCTTCTATATCAGGTGTTCGCCTTGGTGGAGGAATGAACTATGCTGAAGCCCTTCTGCATCGATTTGGAATTCTTGGGCCTGATGGTGGTCCTGGGAAGGAACTTTGCAAAGGGTTAGAACACCTACAAACAGGACCACTGTTGAAACTTTTTAAGACAACACCTCTCATTGTTGATAATTCAGATGCTGAAACTacgagagaaaaagaaaacaattttccACACTTGAAGCAGCCAGATGATGTGGATGTGACTATTGAATTGAGAGATTGGTTATTCGCTCTTGAAGGTGCTCAAGAGATGGCTGAAAGATGGTGGTTCTCCAGCCGTGAAGATATAGGTAGAGAAGAGAGGTGCTGGCACACAACTTTCAGTGGTCTACGAGTTAATGCAAAAAGTAAGCCTAAGAATGTTGCGAATGGCAAAGCTCAATTGCGTGGGAAACAACAATATCCTATAGAACTTATTATGGTTGGAGTTCAAGGGTTGCAGATCTTTAAGCCTCATACCAAAAAGAACATTCCTCCAGCAATTTTAGCTGTAAATGGGGTGAAAGAATCTACTGATGCTGCTGAGGGAATTGGACTGGAAGTTAGCTTGGTAATTCGTGAGGATAATGTTGATGAAGAAATGGTTAACTGGGAGGTGGAAAACCTaaaattttctgttaaaaaaCCGATTGAGGCAGTTGTGACCAAGGATGAGCTTCAGCACCTTACATTTCTTTGCAAATCAGAGATTGACTCCATGGGCAGGATAACAGCTGGAATTCTACGGCTGCTTAAGCTAGAAGGTTCTGTGGGGCAGTCTGTAATAGATCAACTAAGCAACCTTGGAAGTGAAGGTATTGACAAGATCTTCTCTCCGCGAAGCCTCAGCACAGGCGGTGGTGCGGGCAGTATTGGATTTTCTCCATCAAATCTGATAAACGGAAGCCCACACAAATTTACGGAACCAACGCTAGCTTTGCTGGAGGAAGCAATTCTGGATTCAAGGGCCAAACTTGATGCTTTAGTCACTGATATTGGTGCTTCAGAGTCTTCATTTGAGCACCTTTCTGTTATCAAACAACTCGGTCAAAAGATTGAAAGCATGCAGGATTTATTGATGCAATTACGGAATCAACTTTA 3644 0.4111 MESIMARALEYTLKYWLKSFTRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHSSVGLPPALNVATAKVGKLEIMLPSVRNVQIEPIIVQIDTLDLVLEENSDFDASESTKSATSSTASTKGSGYGFADKIADGMTIQIHTVNLLLETRGGAGRQGGATWASPMASITIRNLLLYTTNEDWQVVNLKEAQEFSSNKKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFTDATLGLSKEGANLRDDDGAKRVFFGGERFIEGISGEAYITIQRTESNSPLGLEVQLHVTEAICPALSEPGLRALLRFMTGLYVCLNRGDVDFKAQQRSTEAAGRSLVSIVVDHIFLCIKDTEFQLELLMQSLSFSRASVCEGDNDNNLTRITIGGLFLRDTFLRPPCTLVQPSMQAATRDVLHVPEFARSFCPPIYPLGEQQWQLIEDTPLICLYSLQIKPSPLPPSFASQTVIYCQPLMIHLQEESCLRISSFLSDGIVVNPGDVLPDFSVNSLIFTLKGLDLTVPLDKAKLDIPESNMGSAVQSSFAGARLHIESLSFSASPSLKVKMLNLEKDPACFCLWKGQPIDASQKKWSTRASHLTLSLETCTGTTERQNSLGWTSGLWRCVDLRDACVEVAMATADGSPLLNVPPPGGIVRVGVACGQILTNTSVEQLFFVLDLYAYFGKVSEKIAIAGRKSKQLKDAMVKHSSGSLIDKVPSDTAVSLAVKDLQLRFLESSSMNVEGMPLVHFIGDDLFIRASHRTLGGAIVVSSTLCWDSVEIDCVDADGNLARENDSFLNSAENVPAMNDNVYHQLRAVFWVHNKKNHKFNGNAHSAPFLDISMVQVIPLDEQDIESYNLNVSASISGVRLGGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGKELCKGLEHLQTGPLLKLFKTTPLIVDNSDAETTREKENNFPHLKQPDDVDVTIELRDWLFALEGAQEMAERWWFSSREDIGREERCWHTTFSGLRVNAKSKPKNVANGKAQLRGKQQYPIELIMVGVQGLQIFKPHTKKNIPPAILAVNGVKESTDAAEGIGLEVSLVIREDNVDEEMVNWEVENLKFSVKKPIEAVVTKDELQHLTFLCKSEIDSMGRITAGILRLLKLEGSVGQSVIDQLSNLGSEGIDKIFSPRSLSTGGGAGSIGFSPSNLINGSPHKFTEPTLALLEEAILDSRAKLDALVTDIGASESSFEHLSVIKQLGQKIESMQDLLMQLRNQL 1214
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bva09g00754 1214 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 105 IPR026854 -
Bva09g00754 1214 PANTHER AMINO-TERMINAL REGION OF CHOREIN, A TM VESICLE-MEDIATED SORTER 1 1213 - -
Bva09g00754 1214 Coils Coil 1193 1214 - -
Bva09g00754 1214 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1213 IPR026728 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bva09g00754 Bva-Chr9 3841155 3849213 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bva09g00754 - - gmx:100811661 1808.5
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Bva09g00754 09 3841155 3849213 Bva07g01872 07 16845428 16853663 BWGD
Bva09g00754 09 3841155 3849213 Bva09g00754 09 3841155 3849213 ECH