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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Amo16g4075 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1366
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Amo16g4075 1365 PANTHER DNA REPAIR/RNA PROCESSING CPSF FAMILY 19 1362 - -
Amo16g4075 1365 Gene3D - 35 461 IPR015943 GO:0005515
Amo16g4075 1365 Pfam Mono-functional DNA-alkylating methyl methanesulfonate N-term 106 666 IPR018846 -
Amo16g4075 1365 PANTHER CLEAVAGE AND POLYADENYLATION SPECIFICITY FACTOR (CPSF) A SUBUNIT PROTEIN 19 1362 - -
Amo16g4075 1365 Pfam CPSF A subunit region 1064 1318 IPR004871 GO:0003676|GO:0005634
Amo16g4075 1365 Gene3D - 499 893 IPR015943 GO:0005515
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Amo16g4075 Amo-Chr16 153219383 153230164 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Amo16g4075 K12830 - gmx:100806799 2143.62
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Amo16g4075 16 153219383 153230164 Amo16g4075 16 153219383 153230164 ECH
Amo16g4075 16 153219383 153230164 Amo06g0400 06 5460207 5468949 hybridization