Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Alju03g2597 ATGTTCCTCTCTTTTGATGTTTTTTTTCCTGGGCTAATAATTTTGGGCGCCAAGCGCTTTCCATTTTCACGACATTTCCGCTCCGGTTTCCTTGTGTCGAGAAGTCAGCTTATGCTGTTCTACACCCAGAACCCAGCATTAGGGTTTTGGTGGGGCTTAATTCGGAAGAATACAACGAAGAAAATGGGAAGTAGGTCGACACTGGCGGGGAAGGAAGTTCCCGTAATCAGTAATGATGCCGTCAAGTGGATTGAACTGTCCGTTCCTTCTTCTTCCAACAGTGCCACCACTGCCGTTGACAGTGGCACTGCCACTCTCGGACCTCCCAAAGAGGACCTTGCCTCTTGCTCTGTCATTGGAAATCCTTCTACTTACCTGATATGGAGAATTCACAAAATGCAGCCTCAAGCATTAGAGTTACTGGAGATCCGTGCTTCCCAAGAATTTCCTAAAACTGGATTGAGGTTCACTTTCCCTGATGCGCTTTGCCCATTTGCTTTCATCTGCAAAAACGAGATTACTGCCACTTCTACATTCCCCTACTTGCTTTATGTATTGACTGTATCTGGGGTGGCTTATCTCTTGAAAATTAGAGATGTTTCTACATACTCGTCCTGCTCCGTCTTCCCAGCTCACGAGCTTACCGAGCTCAATGTGTTCAATTATTCGGATCATATGCCAGTGACTGCAGTAACAGCAACTTCTGGGTGTCTTGTTGTTGGCAGAAATGATGGTTCTATTTACTGTTTTCAGCTTGGTGTACTTGATCCAAGTGCTGCTGGATTTGTGGTTGAGCTGAGAGATGAAGTTGGAATCAGCCGATTGTGGGGCCTTATGTCACGGGGTAAAATGGTGAGTTTGGTACAAGACATGGTGATATATGAGCTTCATGGGAAAAGATTTCTGTTTGTACTTCATTTGGATGGGTCTCTACGAGTTTGGGATCTCGCATGTAATTCCAGGGTCTTTAGTCATACTATAGGTACTACAACCATGACAGGTGCTAGATTTATGAAATTATGGGTGGGTCAACCTTGTTTGGATTCAAGTACAATCGCAGTGGCAATTTTGTACAGACATACTTTGGATGAGAGCTTGGAGATGATCTCTATACAAAATATCCAATACAATTTTAGTGACAGAATAATTTTCTCGATGAAGTCGTCTTCACAAAATATTTCTTTGGAGGAGGGAGGATGCATTGATGTCAAACTAACTTCAGACAAGATATGGATACTGAAGGATAATGAACTAATATCGCACATGTGTTCTGCAAATACTGGCAAGGAAGAAGAATTGTCTTATGCATTACAAGAAGAGTTTGTTGCGGATCAACTATTTCAGGGTTCAGATCATCTTGCGGATGAAATTTTGCAGATTGCACATTCATTATTTTCATCTTCCAAGGATGATATTGTGCCTTTTGTATCTTCAATTTTCTTACGCAGGCTGCTTCTTCCTGGAGTGCATCATAATACTGTTTTGCATGCAACTCTAGTGGAGTATAAAAAGCAGTTGGTTGAATCTGAGTTCCAAGTGTTAACTACTGATGGACTAAAAAAGGAGATACTTTCAGCTATTGAACATGAGGTTGGAACTGAAAAGATGTCCATATTTCAATGCTGGAAGTATTTTTGTACCCGCTACTTCCATAATTGGTGCAAAATCAATGCATCATGTGGCTTGCTCATTGATTCCTCTACCAGTGCTGTTGGTTTAATTAGAAAAAGTTCAGTATCGCTTTTTCGGTCTTTGGAAGATATTGAGCGGATTTTAGAAGAAGAAGGAGGTGATCTCACAGGACTTGTGGATTTATTTGATGACGATCTTGAGCATGAAGTTCCAATGGAATTGTTCAGATGTGTTTCAAGTTTTAGCCAACATTTGGGCAAAACTGCTTCTTCCATATTTTATGAGTCACTTCTAAGTAGTCCAGCTATCTCTTCTGAAGATATTATTCATTGTATAGTGAAGATTCTGGAAACTGGATATGGTTCATTGGGTCCGGTTGTCCATACATCTGTTCCTGGGAATGATATGGTCCGGGAGAAGGAGCTTGCAGATCATAGAAATCTGAGGAGACTTTCTATTGACATGTTTTTGTCTCTCCAAGGGTTGTACAAGAAGGCTGCATCATGGCGCAGGATTTTAAATGTAATTGAGGGTTTTCTGAAATTTTTGGTTCCACACAAAACTGTGCATAACTTTGATTCAGAAAAAACATCAAATGTCAATTCCTCCGTTGTAGTCCATGCTACTTATCAGATTGCAAAGGTGATGTTTGAGTCTGCCTGGGACTTTCTTCTATTTCTCAGCTATCTACTGGACATCAGTGGGCAGATCCATATGTCACATGATGATATAACCAGAATACAAATTGAGTTAGTTCCTATGCTTCAAGAAACCATTTTTGAGTGGCTAGTTATTATCTTCCTTGCTACCACACCATCTGTACCAGCTGTGGTTGAGGATTTTAATTATAAACTCTCTTCATTACAAATTGACAACAACATGGGAAAACGGTCATGGAATGAGAAGCTTGGAAGATGTGACTTCACATTGGCTTTTATCTTCTTGCTGAATGCTAGGAGTTCATCCATAGATGGTAGCCAGGTTCCTTCAGAATGTTTATCAAATATGCAGGGCATTGTTGTCAAGATTAGAGACTTTGTCAGTTGGATAATCTATGGTCAGGCTGGAGGAATTTCTACCTTCTTGAGCCGTTCAATTGATCTCTCCTTTATCCTTTTCAAGCATGGGCAGTATGGTGCTGCTGAGCAATTGCTTACAATGGCGGAGGCTCATTTACACAAGGAGAAGACATCCCAAAGTATGCAAGAAGCTGATGGTGGATGGTGCATACGACAGCATCTTCTAGGTTGTGCCCTTCTTGCACAGGTGCAGTGTGGATTGCATGGCACTCTGAAAGAGAAAAAGGTCTCCGATGCTGTTCGCTGTTTCTTTAGGTCCCCATCTGGGAATGGTGCATCAGAGGCTTTGCCCAGTTTGCCTCATGACATAGGATTGCCATATCTTAAATTTGGTGGTTGTGCATCAACTGCTGTGTGGAAGCTTCATTACTATCAATGGGCAATGCAATTATTTGAACAATATAATATTAATGAAGGTGCTTGCCAGTTTGCTCTTGCTGCACTTGAGCAAGTTGATGAAGCTCTATCTATGAAAGATGAAAGGCACATTAGAGACTTAACCGATGAATCAGCGACAACCATCAAGGGTCGGCTATGGTCAAATGTCTTCAAATTTGCCTTAGACCTTGGCCGCTATTTTGATGCATATTGTGCAATAATTTCAAATCCAGACGAGGAGAGCAAATACATCTGCTTGAGACGTTTCATCATTGTCCTTTATGAACGAGGTTCTATCAAGATTCTTTGCAGCAGTAAGCTTCCCCTCACTGGTTTGATGGAGAAGGTAGAGCAGGAGCTTGCTTGGAAGGCTGAAAGATCGGATATATCTGCAAAGCCAAACTTGTACAAGTTGCTTTATACATTTCAAATGCATCAACATAATTGGCGCCGAGCAGCAAATTACATGTACCTATATTCAGCACGTTTGAGAACTGAAGTGGCTCTAAAAGATTACCAGGGTTATTCTTTGATATTGCAAGAGAGGCTGAATGCACTCTCTGCTGCTATTAATGCCTTGCATCTTGTTCATCCAGCACATGCCTGGATTGATCCACCGGCTGAAGGAAGATGTCTTATGAGTGAACAGTATCCGAGTAAGAAAGCTAGAAGAATTGTAGATATAGATTTGTCGGCTGAAAATGATGCAGAGCATCAAAGCTGGCATTCTTCTATTGATCTTGAAAAACTTGAGCATGAGTTTGTGCTAACATCGGCAGAATACATGCTGTCGCTGGTAAATGTTAAGTGGACATATACTGGTAAAGAAGGAGCGCTGTCAGATTTGGCTGATCTCCTTGTCCAAAACAATTTATGTGATATGGCCTTCACAATTCTTCTCAGATTTTTCAAGGGCTCAGGATTGAAGAGGGAGCTTGAAAGAGTTTTCTCTTCTATATCTTTGAGATGCTGTCTTGGTAAAGTAGAATCCACTTGGATTGAGCCACACAGTAATTTGTTGACATCGTCCAAGCTTGAAATGGTTGTCCATGGTTCACCTCTTGCAGTTTCTACAACCGCACAACCTGACAGGAATTGCCATTGGGCAACTCTGGAGCTTTACCTTGGAAAATATTGTGAATTTCATGGTAGGCTACCTGTTATTGTTGCTGAAACTCTTCTTCGTGCAGATGCTCAGATTGATTTGCCTCGTTGGCTGGTTCAGTTTTTCAAGGAGGGTCAAAGAGAAAAGATCTGGGGGATGGCTGGTCGAGAATCAAATCCCGCATCTTTGTTTCAACTTTATGTTAATTATGGTCGATTTACAGAAGCTACTAATCTCTTGCTGGAGTTCATGGAATCATTTGCATCAATGAGACCAGCAGATATAATCAGACGGAAAAAACCATTCGCAGTTTGGTTCCCATACACAACGATTGAGCGACTACTTTATCAACTTGAAGAGTTGATTAGAGTGGGTCACATGGTAGATCAATGTGAAAAACTTAAGAAGATGTTATATAGTTCTTTGCATAATCACCTGAAGTTGTTAAAAGAGGACTCGGATGATGCTATTTCTGTAGCTTGTTGA 4680 0.4118 MFLSFDVFFPGLIILGAKRFPFSRHFRSGFLVSRSQLMLFYTQNPALGFWWGLIRKNTTKKMGSRSTLAGKEVPVISNDAVKWIELSVPSSSNSATTAVDSGTATLGPPKEDLASCSVIGNPSTYLIWRIHKMQPQALELLEIRASQEFPKTGLRFTFPDALCPFAFICKNEITATSTFPYLLYVLTVSGVAYLLKIRDVSTYSSCSVFPAHELTELNVFNYSDHMPVTAVTATSGCLVVGRNDGSIYCFQLGVLDPSAAGFVVELRDEVGISRLWGLMSRGKMVSLVQDMVIYELHGKRFLFVLHLDGSLRVWDLACNSRVFSHTIGTTTMTGARFMKLWVGQPCLDSSTIAVAILYRHTLDESLEMISIQNIQYNFSDRIIFSMKSSSQNISLEEGGCIDVKLTSDKIWILKDNELISHMCSANTGKEEELSYALQEEFVADQLFQGSDHLADEILQIAHSLFSSSKDDIVPFVSSIFLRRLLLPGVHHNTVLHATLVEYKKQLVESEFQVLTTDGLKKEILSAIEHEVGTEKMSIFQCWKYFCTRYFHNWCKINASCGLLIDSSTSAVGLIRKSSVSLFRSLEDIERILEEEGGDLTGLVDLFDDDLEHEVPMELFRCVSSFSQHLGKTASSIFYESLLSSPAISSEDIIHCIVKILETGYGSLGPVVHTSVPGNDMVREKELADHRNLRRLSIDMFLSLQGLYKKAASWRRILNVIEGFLKFLVPHKTVHNFDSEKTSNVNSSVVVHATYQIAKVMFESAWDFLLFLSYLLDISGQIHMSHDDITRIQIELVPMLQETIFEWLVIIFLATTPSVPAVVEDFNYKLSSLQIDNNMGKRSWNEKLGRCDFTLAFIFLLNARSSSIDGSQVPSECLSNMQGIVVKIRDFVSWIIYGQAGGISTFLSRSIDLSFILFKHGQYGAAEQLLTMAEAHLHKEKTSQSMQEADGGWCIRQHLLGCALLAQVQCGLHGTLKEKKVSDAVRCFFRSPSGNGASEALPSLPHDIGLPYLKFGGCASTAVWKLHYYQWAMQLFEQYNINEGACQFALAALEQVDEALSMKDERHIRDLTDESATTIKGRLWSNVFKFALDLGRYFDAYCAIISNPDEESKYICLRRFIIVLYERGSIKILCSSKLPLTGLMEKVEQELAWKAERSDISAKPNLYKLLYTFQMHQHNWRRAANYMYLYSARLRTEVALKDYQGYSLILQERLNALSAAINALHLVHPAHAWIDPPAEGRCLMSEQYPSKKARRIVDIDLSAENDAEHQSWHSSIDLEKLEHEFVLTSAEYMLSLVNVKWTYTGKEGALSDLADLLVQNNLCDMAFTILLRFFKGSGLKRELERVFSSISLRCCLGKVESTWIEPHSNLLTSSKLEMVVHGSPLAVSTTAQPDRNCHWATLELYLGKYCEFHGRLPVIVAETLLRADAQIDLPRWLVQFFKEGQREKIWGMAGRESNPASLFQLYVNYGRFTEATNLLLEFMESFASMRPADIIRRKKPFAVWFPYTTIERLLYQLEELIRVGHMVDQCEKLKKMLYSSLHNHLKLLKEDSDDAISVAC 1559
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Alju03g2597 1559 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 192 331 IPR036322 GO:0005515
Alju03g2597 1559 PANTHER NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP160 62 1554 IPR021717 -
Alju03g2597 1559 Pfam Family of unknown function (DUF5311) 603 795 IPR035192 -
Alju03g2597 1559 Pfam Nucleoporin Nup120/160 126 591 - -
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Alju03g2597 03 52288946 52305161 Alju01g1499 01 11999608 12003685 CCT