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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi4g0598 ATGCTGGAGCCCTGGAGGGTAGTGTTTGTGCTCTACTGGTTGATAGACCGAATGGGCCAAAAGGATCCAATTTTGGAGGGGGAGGTCAAATATCGGTACAATGATGTTATCTCGTATTATAGAAAGTCTTTTATACAAGACAATGCTCAGAGAGTTTCACCCTTGAGCTTTGAACTTGAGGCTACTTTGAAATTGGCAAGGTTTCTTTGCAGACGTGAGTTGGCTAAGGAGGTAGTAGAATTGTTGACAGCTGCTGCTGATGGTGCAAAATCTTTGATTGATGCCAGCGATCGGCTCATATTATATGTTGAAATAGCCCGTTTATTTGGTACCCTTGGCTATCACCGGAAAGCTGCCTTTTTCTCAAGGCAGGTAGCTCAGTTGTATTTACAACAGGAAAATGGATTGGCTGCTATCAGTGCCATGCAAGTCTTGGCAATGACCACAAAAGCTTATCGTGTTCAAAGTAGAGCATCTGATTCAAAACATTCTCTTCCCTCTGAAATTGGACCAAGTTATGCTGATGGTGGGAAAATGCATCACCACTCAGTAGTCTCATTATTTGAGTCTCAATGGAGCACCCTGCAGATGGTCGTTCTAAGAGAGATACTAATGTCTTCTGTGCGTGCTGGAGATCCTCTTGCTGCATGGAGTGCAGCAGCTCGCCTACTTAGATGTTATTACCCTCTAATTACACCTGCTGGTCAAAATGGCCTTGCTACTGCACTTAAAAATTCATCAGAGAGGCTGCCTTCAGGAACCCGGTGTGCTGATCCTGCCTTACCTTTTATAAGGCTGCATTCTTTTCCTCTCCAGCCCTCACAAATGGACATTGTAAAACGCAATCCAGCAAGAGAAGATTGGTGGGCTGGATCTGCTCCTTCCGGGCCTTTTATTTATACACCATTCAGCAAAGGAGAGCCAAATGATACCAGTAAGCAGGAGCTGATTTGGATTGTTGGAGAACCAGTCCAGGTGCTGGTTGAGTTGGCAAATCCTTGTGGATTTGACTTGATGGTTGAGAGTATATATCTCTCAGTGCATTCAGGAAATTTTGATGCTTTTCCCATTAGGGTTAATCTCCCACCTAATTCATCAAAAGTGATCACCTTATCAGGCATTCCAACTTCTGTGGGACACGTGACAATTCCTGGGTGCACTGTTCATTGTTTTGGTGTCATTACTGAACACCTTTTCAAGGATGTTGACAATCTGCTTCATGGAGCTGCACAAGGACTTGTGCTTTCTGATCCTTTCCGTTGCTGTGGGTCAGCAAAGTTAAGAAATGTATCTGTTCCACAGATTTCTGTAGTGCCCCCATTGCCATTGCTTGTGTCACGCATTGTAGGTGGTGTTGGTGCTGTTATTTTATATGAAGGTGAAATTCGTGATGTATGGATAAGTCTAGCTAATGCAGGTACAGTTCCAGTTGAGCAGGCACACATTTCATTGTCTGGAAAAAACCAAGATGCCGTTATTTCAGTTGCATATGAAACCTTAAAGTCTGTCCTTCCTTTAAAGCCTGGTGCAGAAGTGACATTGCCAGTAACCTTAAAAGCCTGGCAACTTGGCCTGGTGGACCCTGATAATGCTGCTGGCAAGAGTGCCTCCGGAAGCACTGGGAGGCAATCCAAGGATGGAATCAGCCCCATACTGTTGATCCATTATACAGGGCCACTGACAAATCCTGGAGAACCGCCAGAAAATGGCTCTTCTGTGCCCCCAGGCAGACGTCTGGTTGTTCCCTTGCACATCTGTGTTTTGCAGGGCTTGTCTCTTGTGAAGGCTCGTTTGCTTTCGATGGAAATTCCTGCACATATTGGTGAAAACCTTCCTAAACCAGTTCGCCTGGACAATGGCTCTACTGAAGAAGTTACTATTTCTGAAAGTAAGGCAGATGGACTGGTAAAGATTGATCCTTTCAGAGGAAGTTGGGGACTGCGGTTTCTTGAACTTGAGTTGTCTAATCCAACAGATGTTGTATTTGAGATTAGTGTCTCTGTCCAGCTGGAAAACTCTAGTGATGTGGATAACCCTTCTGTTGATCAAGATGCTGCTGAATTGGGTTATCCTAAAACAAGAATTGATAGAGACTACTCTGCCAGGGTATTAATACCCCTGGAGCATTTTAAGTTGCCTGTTCTTGATGGTTCTTTCTTTGTGAAGGATTCTCAGGCAGATGGGACTTCCAGTGGTAGAACTTTGAGCTTTTCTGATAAGACTTCCAAGGCCGAATTAAATGCTTCTATTAAGAACTTGATTTCTAGAATAAAGCTGAGGTGGCAATCTGGGCGGAACAGCTCAGGAGAATTAAATATTAAAGATGCGATACAGGCAGCCCTTCAGACATCTGTTATGGACATACTGCTCCCAGATCCATTAACGTTTGGCTTCAAGCTTTCTAAAAATGGTGCTGGACATGCTGCAAAACTTGATTCACCAAAGGAGTCCAATGTTCAAGTTCCTTCCACATCTAAAGGGTCTGTACTGGCACATGACATGACCCCTATGGAAGTTCTGGTTCGCAATAACACCATGGAAATGATCAAGATGCGTTTTAGTATTAGATGCAGAGACGTAGCCGGAGCAAATTGTGTTGAGGGTGACAAGGCAACTGTCTTATGGGCTGGTGTTTTAAGCGGAGTCACCATGGAGGTTCCTCCACTTCAGGAAGTTAAACATTCTTTCTCCCTTTATTTCCTGGTCCCGGGTGAGTACACACTGGTAGCTGCTGCAGTGATAGATGATCCCAATGACATCCTCAGGGCTCGCGCAAGAAGCGTTTCATCAAATGAGCCTATCTTTTGCCGTGGCCCCCCATTTCATGTCCGTGTGATCGGGACAGCATAA 2850 0.4467 MLEPWRVVFVLYWLIDRMGQKDPILEGEVKYRYNDVISYYRKSFIQDNAQRVSPLSFELEATLKLARFLCRRELAKEVVELLTAAADGAKSLIDASDRLILYVEIARLFGTLGYHRKAAFFSRQVAQLYLQQENGLAAISAMQVLAMTTKAYRVQSRASDSKHSLPSEIGPSYADGGKMHHHSVVSLFESQWSTLQMVVLREILMSSVRAGDPLAAWSAAARLLRCYYPLITPAGQNGLATALKNSSERLPSGTRCADPALPFIRLHSFPLQPSQMDIVKRNPAREDWWAGSAPSGPFIYTPFSKGEPNDTSKQELIWIVGEPVQVLVELANPCGFDLMVESIYLSVHSGNFDAFPIRVNLPPNSSKVITLSGIPTSVGHVTIPGCTVHCFGVITEHLFKDVDNLLHGAAQGLVLSDPFRCCGSAKLRNVSVPQISVVPPLPLLVSRIVGGVGAVILYEGEIRDVWISLANAGTVPVEQAHISLSGKNQDAVISVAYETLKSVLPLKPGAEVTLPVTLKAWQLGLVDPDNAAGKSASGSTGRQSKDGISPILLIHYTGPLTNPGEPPENGSSVPPGRRLVVPLHICVLQGLSLVKARLLSMEIPAHIGENLPKPVRLDNGSTEEVTISESKADGLVKIDPFRGSWGLRFLELELSNPTDVVFEISVSVQLENSSDVDNPSVDQDAAELGYPKTRIDRDYSARVLIPLEHFKLPVLDGSFFVKDSQADGTSSGRTLSFSDKTSKAELNASIKNLISRIKLRWQSGRNSSGELNIKDAIQAALQTSVMDILLPDPLTFGFKLSKNGAGHAAKLDSPKESNVQVPSTSKGSVLAHDMTPMEVLVRNNTMEMIKMRFSIRCRDVAGANCVEGDKATVLWAGVLSGVTMEVPPLQEVKHSFSLYFLVPGEYTLVAAAVIDDPNDILRARARSVSSNEPIFCRGPPFHVRVIGTA* 950
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi4g0598 949 PANTHER TRAFFICKING PROTEIN PARTICLE COMPLEX SUBUNIT 9 18 943 IPR013935 -
Vvi4g0598 949 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 76 489 IPR013935 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vvi4g0598 Vvi-Chr4 5819653 5849181 Dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi4g0598 K20306 - vvi:100259475 1832.77