Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi3g0117 ATGGCGGATTCAGATTCGAAGCCGAAACAGAAACACACAAAGAAGAAGAGAAAGTTAAAAGTCCCAGAGGATGATCGAAGACCTTCCAAAACGCAGCGTTTCGATTTTCTAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGATGCAAAAGAAGAACGCCCGATTCGGAGGCCAGAAGAAGGTCGTCCGTGGGGGAATCTGCAGCTGATTTTATCATTACAGAACAAAGAAATTCTTCTTCAAGAGAAGGTCCAGCTTGCATATGATTTTGTTGCTACAAGAGCCACAGAAGAAGAGGAGGACACTGAGCAAGGTTTTGAAACAGTGAGCCTTTCACGAGTAATTATTTTCCTGAATGATTGGATCCAGTCATTGTTGATTTCTTCGGAAAAGAAAAGTAAGGTTGATTTGGACAAAACTCAGTTCCAAGTTGTTGGGACATGTTTGGATTTTAGATGCTGGGAGATTTTTAAGTTCTGTTTAGAGGAGTCTTTGGAACGGCATGTTCCACTAAACATCTCACGAAACTTGTTAAAAGCTATTCATTGCATTGCAAGGAATGCATTATCCCAACTGAATGATGCATCTTTGCATGCAAAGGAGTCATTTTTTATTGTTGAAGGGTTTGAATTGTATGGTACTGTTCTTAGTTGTGTTTCACTGGTGTTCTCATCTCATAATGGTTTGTCAAATGAAAATTTAGACTTGTGGATTTCAACTGTTGATGCCGTGCTTGAGCTTGTTCACAAAATTTACACCGACAACATAGCAGGTGGCAACGCGGGCAAATTTGTCCTGCAGTTCTCATGTTTAGTACTTGAGCCATTCAGCAAGTTTTTGAGGGTCCATCCATGTCGTAAAAATGGTTTTCATGATTTCGTGGATAAACTTCTTGAGCTGCTACTGCATTTGTTGGGTGTCTTAAATCTTCAGGCTGATGGAAATAATCCTGGATGGACAAGAGACCTGTTGAAGTTGGTTGAAGAGGTTTTATCCCATGGGCTGTTTCATCCAGCCCACATTGATGGGTTTCTCAGCTTACATGGTAAAGAAAAGCATGGAAAAGAATATGATGGGCAATCAGAAGAGCCAAAAATGGTTGTTAAAAGTTATCACAGACATTTGTTTGATAAACTGGAAAAAATTGTGGCTGCCAAGAAGGTATTACCATTGAGTGGCATAGGAGAACTATTTCATTTGCTTGTTGTTCAAGTAAAAAAGCAAAAAGGAGCCTTGGTGTTGTCAGAAGGTACCAAGATTGTAGGGAAGACGGTAGGTTTCATTCACTCGGAAGATTATTTTTCTGGTCATATGTCTATGATGTTTGCTGGGAACCATAGTGTGCTTTCTGAAAACAGTTATTTGTCAAGTAGTTTGAATTCAGAGACAAGGAAGTCTCTTTTTGATTTTTTTGTACAGATTATGGAGCCTTTGCTGTTTCAGATAAAAGGCTATCTCCAAACCAAACTGGAAGTGGGACCTGCATTATTGGATGTTCATTGTACTCTCAAATCTACCAATAAGTTACTTGCTAGCTTTATGCATGAGAAGGTTTATGTACAAACAGAAGATACCCATGAAGGAGCTTGTCTTAATTTCTTGAAGGTGGTTTACGATAGGATCATGTCATTTTCGGTCGAAATAAATCAAATGTGGCTGTCAACGGTTGATGCAGACAAGGGGATACATGTTGATACTTTAAATTTAATAGGCAAGGAGCTTATTGCTGCATTAGGTTATTTCTTGGAAATTGATTATGAGGTTATTGGTAATGATTTAGTAAGCTTATGGCTCATGATGCTTTCATTCTTGGCCATTGGCCTTTCTTCAATGGACATGTCAGATCAATCTTCTTTATCTTCAAAGATGGTGGATGTTGGTTGCCAGCTGATAAACCTCTATAGTGAACTTCGACAGGTGAATAATGCTATTTTTGCACTCTGTAAAGCAGTGAGGCTTTTGGTATCACATGATAGTGATTGTGAACTGAATTATTCTGGATTTATGTCCTGCACAAATTCTGCATCCTATGAAGCATGTGCAAAATCAGTGGAAATGTTATTGTGCTCGCAAGAGTTCAAATTTGCCATTTATAATGCTATTAGATCTATACCAGAAGGGCAAGCAAGTGAATGTGTTCGACAATTAACAACAGATATTTCAGATTCACTGAAGTGGATGAAAACAAGTTGCTCTGTGGCTTCTGGAAAAGAATCTGGAAACGCAAAGCAAAGTGGTAGCCTACTGGGTTTTGATCTGCAAGTGGAACTTCTGGGAAAAGGTTTGGCAGAAATATATACACTGGTGCTAGATTCTCTGAATGTCACAACAGGTAATAGTAGTCTCTTAGGAGTTTCTATAGAGGGCCTAATGACAGTTATGCGCCCTGGCATGAGTAGTCTGGTTGCACTACAGCTAGATGGTGTCAATGAGTTCATTTCTGCTGTCACAGAAAGAATCTTCTACAACAGGGTGGCTGAATGCAAAAATGATTTCAGAAAATTAAGAGCATCCACTCAGTGGATCTTTGTTTTATTCTTTCGTTTGTACATGTCCTGTCGAAGCTTATACAGGCAATCAATCAGCCTTGTGCCTCCAACTTCAGCAAAAAAGATGTCTGCAGTAATGGGGGACTTCTATATAGCACACACTGGAAGGGATTGGGTGGAGAAAACTGATTGGACGGAACAAGGCTATTTTTCTTGGATTGTCCAACCTTCTGCTTCCCTTCCTAATATTATACAATCTATTTTAGACCTTTATCCTCAGGATAGAGTTGTAACTTGCTCTCCTCTGGTTTATGTGTTGCACACCATGGCTCTTCAGAGGCTTGTTGATTTGAATAGGCAGATTAAATCATTTGAGTATTTACTGCAGAGTAATAATAAGTTAGTCCAAGAAAAGTTAATGGATGATGATGGCTTATCACAGTGTCATGAAAAAGACATAAAGTCTAATAAAAAGAAAAGCAGAAAGTGGAAACGTTTTATTGCTGTTTTGAGGGAAGAGGCGACGGGCCTTACTGATTTCATGATGGGATCTGTCTCATTAGTGACCAAAAAGCAACAGTGTTTCTCCAGTTTTGATGATACAACTTGTAAGGATACATGCGCCAAAGCTCTTCATGAGGATGATGCATGGGATTTGGGTGTTTGTGCTGTGAATGAGATAACATTGCCCACTGCAATTTGGTGGGTTCTTTGCCAAAATATTGATATTTGGTGCACTCATGCTGCTAAGAAGAAGTTGAAGACGTTCCTCTCACTTTTAATATGTACTTCTCTTCCTCATATTGGAAGCAGTTTTGGAGAGGTTAAAAAACACAACACCAATGAACCTGGCTATCAGAGGAAAGTATCGGTGGGGCAAATCTCGATGGAACTTCTAAGTGACACCACTCTGTATGAACAAAAATTTGTTTGCAGGCACATTGCATCAAGGTTTTGCCGTAATCTGGAGAAGTCATTATCACCATTACTTAGTGATGCAGCATACAGAGATTTTGACTTCAATTCATCACCCAATTGGCAAGAGGTTTTAAGTGCCTTTGACAACTTATCAGTGGTTGTTTCAGGCGCCAAGTATGTAACTAATGATTGTGCTTCAGTGGCAGAACTGACTTCTCATCTATCTAATAGGCTGCCTACAGAATTTAATGAGGAAAAGAAAGCCTTTCTTTTACAGAGCATGGAATTTACAGCTTGTCAAAGTTCGCTTAATCTATTGTGCTGGATGCCAAAAGGATATTTAAATTCTAGATCATTCTCCCTTTATACAACTTGTATTCTCAACCTTGAAAGGTTTGTGGTTTGCAGGTTAATAAAGTGTCATTGTGCATTATGTTCCCATAATCATTATGAGCTTTACAGATTGTTTTTGTCTTGCCGGAGGACCTTGAAACATCTGATAATGGCATTTTGTGAGGAGAAAATGGAAGCTAGTCAATCCTCACTTACTTCAATATTTCCTGAGGTTTCATTTCCTGTTTTATGGCTTTTAAAGTCAGTATCTGTGATGGTTGGGCTTCAACACACATTTTCAGAGGATAGAGCTAGCCAATTTAGATATATGTCCTTCTCATTGATGGATCAAACCTCATATGTGTTTTTGATGTTTAGCAAAAGTCAGTTTAGTCATGTGGTTCACTTCAGTATGAATGTGAAGAAGTCTTGTGCAGAACAACTTAATTCTGATCTTGTCCATGAGGAGAGTCATTTAACTGAAACTGATCCTTGTTCGGATTCCTCAAAAGCTGTTGATGCATGGAAAAATGTGGTCCTTGTTGCTGAAGCCTTAAAGGAACAGACAGAAAATCTTCTCATCTCTCTAAAGGATGCCCTTTGTAACAAGAGGGTGGAAGTTGGAACTGTGGATTTAAATAGATTATCTTCTCTAGTGTCATGCTTTCAAGGGTTTATGTGGGGCCTTGCATCTGCCATGAACCATATAGATGTGAAGGAGTGTGATGATGAAATGAAATTGTTGAAATGGAAGAATGAACCTTTCTCCAAACTCAACCTTTGTATAAATGTCTTCACAGATTTTATTGATTTTTCCTTATGCATGTTTCTTATTGAGGATGATCAACAGCCTGAAGGTTTAGGTGGTGCTCAAAATCTTTCTGGGTTGGACCAGAAAAATGACTGTTCACTTGAACCCTATGGTGGTGAGAATGATATTTCATGTGCTAACAAGCAACAGAAATCCAAAACTGCAAGGAGCTCAGGATCATTGCACATCGACAATGATTCTGAAAATACTGGTGGTCAAGAAATGAGGTTGCAGTTGGACAGTGCAGTCTGTGCTACCAATTTCCTGTCTGATGTTGATTTGTTTGAGCTACGACGATTAAATAGGCCTTTGCTGCGAAGCTTGTTAAAAGGTGATAATCCTGAAGCAGCTTTTTTTCTCAGAGAGTTATTTATAGCTTCTTCAGCTATTCTGAGGCTAAATTTGCAGATCAACTGTATTCCCTTATCATCATGCTTTGTGCCTATTTTTAATGGCATTTCACAACTTTTGTTATTGGAATTGGCAAACATGGCTGATGTGCCACAGCCAATTTCTTTGGTGTGGTTAGACGGTGTTTTAAAATATCTGGAGGAATTAGGGAATCAATTTCCTTTAACTAATCCTACCTTGTACAGAGATGTTTATGCCAAGCTGATAGATCTTCACTTGAAGGCCATAGGAAAATGCATTTCTTTGCAGGGGAAAAGAGCTACTCTAGCATCCCATGACGCAGAGTCAAGTACCAAGACACTCGACAGTCATGTAGGATTATCTGATGCATCTCTTTCTCATGGGCCATATTGCTTCGATGAATTTAAATCAAGGTTGAGGATGTCATTCAAAGTGTTTATAAAGAAGCCATCAGAGTTGCATTTATTATCTGCTATACAGGCTTTAGAGAGAGCACTAGTTGGAGTACAGGAAGGCTGCATGGTGATCTATGATGTAAATACTGGAAGTGCACATGGGGGAAAGGTTTCCTCAATCACTGCAGCTGGCATTGACTGCTTGGATTTGGTGCTTGAATTTGTTTCAGGACGCAAACGATTGAGTGTGGTTAAAAGACACTTAAAGAGCTTAATTGCTGGCCTGTTCAACATAGTTTTGCACTTGCAGAGCCCTTTTATATTCTATAGGAAATTGATCCATAATAAAGGTCAGACTGATCCAGATCCTGGCTCAGTTATTCTTATGTGCATTGAGGTACTGACAAGAATTTCTGGAAAGCATGCTCTGTTCCAAATGGATCCTTGCCATCTACAGCAGTGTTTGCGGATACCTGCAGCACTTTTTCAATCTTTCCGTGGGCTTAGACTTTCTGATGCTCCAGCTTCATATAATTTTTTTATGTTTTCTGACAACCAAGATAATGGTTCTCTGGAAAGCATGGATTCTTGTACTGTGGATCGACAATTCACAATAGATCTATTTGCTGCATGCTGCAGATTATTGAATACCGTTCTTAAGCATCATAAAAGTGAGTGTGAGCAATGCATTGCTCTTCTTGAAGATTCGGTTTGTGTTCTCCTTCGTTGTTTAGAGACGGTGGATGCTGATTCAGTGGTCCGAAAAGGTTATTTTTCATGGGAAGTAGAAGAGGGAGTAAAGTGTGCTTGTTTTCTTCGAAGGATTTATGAAGAGATGAGACAGCAAAAGGATGTCTTTAGGCAGCACTGTTTTAAGTTTTTATCCAATTACATATGGATTTATTCAGGATATGGCCCCCTTAAAACAGGCATCAGAAGGGAAATTGACGATGCTCTGAGACCAGGAGTTTATGCCTTAATAGATGCTTGCTCAGCAGATGATCTTCAATATCTTCATACTGTGTTTGGAGAGGGTCCTTGTCGAAGCACTCTAGCAACTTTGCAGCATGATTACAAGCTGAACTTCCAATATGAAGGAAAAGTTTGA 6414 0.392 MADSDSKPKQKHTKKKRKLKVPEDDRRPSKTQRFDFLEKEKEKDAKEERPIRRPEEGRPWGNLQLILSLQNKEILLQEKVQLAYDFVATRATEEEEDTEQGFETVSLSRVIIFLNDWIQSLLISSEKKSKVDLDKTQFQVVGTCLDFRCWEIFKFCLEESLERHVPLNISRNLLKAIHCIARNALSQLNDASLHAKESFFIVEGFELYGTVLSCVSLVFSSHNGLSNENLDLWISTVDAVLELVHKIYTDNIAGGNAGKFVLQFSCLVLEPFSKFLRVHPCRKNGFHDFVDKLLELLLHLLGVLNLQADGNNPGWTRDLLKLVEEVLSHGLFHPAHIDGFLSLHGKEKHGKEYDGQSEEPKMVVKSYHRHLFDKLEKIVAAKKVLPLSGIGELFHLLVVQVKKQKGALVLSEGTKIVGKTVGFIHSEDYFSGHMSMMFAGNHSVLSENSYLSSSLNSETRKSLFDFFVQIMEPLLFQIKGYLQTKLEVGPALLDVHCTLKSTNKLLASFMHEKVYVQTEDTHEGACLNFLKVVYDRIMSFSVEINQMWLSTVDADKGIHVDTLNLIGKELIAALGYFLEIDYEVIGNDLVSLWLMMLSFLAIGLSSMDMSDQSSLSSKMVDVGCQLINLYSELRQVNNAIFALCKAVRLLVSHDSDCELNYSGFMSCTNSASYEACAKSVEMLLCSQEFKFAIYNAIRSIPEGQASECVRQLTTDISDSLKWMKTSCSVASGKESGNAKQSGSLLGFDLQVELLGKGLAEIYTLVLDSLNVTTGNSSLLGVSIEGLMTVMRPGMSSLVALQLDGVNEFISAVTERIFYNRVAECKNDFRKLRASTQWIFVLFFRLYMSCRSLYRQSISLVPPTSAKKMSAVMGDFYIAHTGRDWVEKTDWTEQGYFSWIVQPSASLPNIIQSILDLYPQDRVVTCSPLVYVLHTMALQRLVDLNRQIKSFEYLLQSNNKLVQEKLMDDDGLSQCHEKDIKSNKKKSRKWKRFIAVLREEATGLTDFMMGSVSLVTKKQQCFSSFDDTTCKDTCAKALHEDDAWDLGVCAVNEITLPTAIWWVLCQNIDIWCTHAAKKKLKTFLSLLICTSLPHIGSSFGEVKKHNTNEPGYQRKVSVGQISMELLSDTTLYEQKFVCRHIASRFCRNLEKSLSPLLSDAAYRDFDFNSSPNWQEVLSAFDNLSVVVSGAKYVTNDCASVAELTSHLSNRLPTEFNEEKKAFLLQSMEFTACQSSLNLLCWMPKGYLNSRSFSLYTTCILNLERFVVCRLIKCHCALCSHNHYELYRLFLSCRRTLKHLIMAFCEEKMEASQSSLTSIFPEVSFPVLWLLKSVSVMVGLQHTFSEDRASQFRYMSFSLMDQTSYVFLMFSKSQFSHVVHFSMNVKKSCAEQLNSDLVHEESHLTETDPCSDSSKAVDAWKNVVLVAEALKEQTENLLISLKDALCNKRVEVGTVDLNRLSSLVSCFQGFMWGLASAMNHIDVKECDDEMKLLKWKNEPFSKLNLCINVFTDFIDFSLCMFLIEDDQQPEGLGGAQNLSGLDQKNDCSLEPYGGENDISCANKQQKSKTARSSGSLHIDNDSENTGGQEMRLQLDSAVCATNFLSDVDLFELRRLNRPLLRSLLKGDNPEAAFFLRELFIASSAILRLNLQINCIPLSSCFVPIFNGISQLLLLELANMADVPQPISLVWLDGVLKYLEELGNQFPLTNPTLYRDVYAKLIDLHLKAIGKCISLQGKRATLASHDAESSTKTLDSHVGLSDASLSHGPYCFDEFKSRLRMSFKVFIKKPSELHLLSAIQALERALVGVQEGCMVIYDVNTGSAHGGKVSSITAAGIDCLDLVLEFVSGRKRLSVVKRHLKSLIAGLFNIVLHLQSPFIFYRKLIHNKGQTDPDPGSVILMCIEVLTRISGKHALFQMDPCHLQQCLRIPAALFQSFRGLRLSDAPASYNFFMFSDNQDNGSLESMDSCTVDRQFTIDLFAACCRLLNTVLKHHKSECEQCIALLEDSVCVLLRCLETVDADSVVRKGYFSWEVEEGVKCACFLRRIYEEMRQQKDVFRQHCFKFLSNYIWIYSGYGPLKTGIRREIDDALRPGVYALIDACSADDLQYLHTVFGEGPCRSTLATLQHDYKLNFQYEGKV* 2138
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi3g0117 2137 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 55 - -
Vvi3g0117 2137 PANTHER UNHEALTHY RIBOSOME BIOGENESIS PROTEIN 2 HOMOLOG 55 2137 - -
Vvi3g0117 2137 Pfam Urb2/Npa2 family 1898 2136 IPR018849 -
Vvi3g0117 2137 MobiDBLite consensus disorder prediction 18 55 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi3g0117 - - vvi:100248664 4174.01